source: trunk/FACT++/gui/RawEventsViewer/RawEventsViewer.cc @ 19364

Last change on this file since 19364 was 19364, checked in by tbretz, 8 months ago
Changed the maximum valid range of some spin boxes in case this is not a FACT camera.
File size: 77.0 KB
Line 
1/*
2 * QtGl.cpp
3 *
4 *  Created on: Jul 19, 2011
5 *      Author: lyard
6 *
7 ******
8 */
9#include <math.h>
10#include <fstream>
11
12#include <boost/date_time/local_time/local_time.hpp>
13
14#include "RawEventsViewer.h"
15
16#include <QFileDialog>
17#include <QMouseEvent>
18
19#include <qwt_symbol.h>
20#include <qwt_plot_grid.h>
21#pragma GCC diagnostic push
22#pragma GCC diagnostic ignored "-Woverloaded-virtual"
23#include <qwt_plot_zoomer.h>
24#pragma GCC diagnostic pop
25
26#include "src/Configuration.h"
27#include "externals/factfits.h"
28
29
30using namespace std;
31
32#undef ACTUAL_NUM_PIXELS
33#define ACTUAL_NUM_PIXELS 1440
34
35//bounding box for diplaying the impulse curve
36float bboxMin[2] = {-0.8,-0.9};
37float bboxMax[2] = {0.8,-0.3};
38/************************************************************
39 * CALC BLUR COLOR if in blur display mode, calculate the interpolated
40 * colour for a given vertex
41 ************************************************************/
42void RawDataViewer::calcBlurColor(int pixel,  int vertex)
43{
44    GLfloat color[3];
45    int first, second;
46    first = vertex-1;
47    second = vertex;
48    if (first < 0)
49        first = 5;
50
51    first = neighbors[pixel][first];
52    second = neighbors[pixel][second];
53//    cout << pixel << " " << vertex << " " << "first: " << first << " second: " << second << endl;
54    for (int i=0;i<3;i++)
55        color[i] = pixelsColor[pixel][i];
56    float divide = 1;
57    if (first != -1)
58    {
59        divide++;
60        for (int i=0;i<3;i++)
61            color[i] += pixelsColor[first][i];
62    }
63    if (second != -1)
64    {
65        divide++;
66        for (int i=0;i<3;i++)
67            color[i] += pixelsColor[second][i];
68    }
69    for (int i=0;i<3;i++)
70        color[i] /= divide;
71
72//    cout << color[0] << " " << color[1] << " " << color[2] << endl;
73
74    glColor3fv(color);
75}
76void RawDataViewer::calcMidBlurColor(int pixel, int vertex)
77{
78    GLfloat color[3];
79    int first;
80    first = vertex-1;
81    if (first < 0)
82        first = 5;
83    first = neighbors[pixel][first];
84    for (int i=0;i<3;i++)
85        color[i] = pixelsColor[pixel][i];
86    float divide = 1;
87    if (first != -1)
88    {
89        divide++;
90        for (int i=0;i<3;i++)
91            color[i] += pixelsColor[first][i];
92    }
93    for (int i=0;i<3;i++)
94        color[i] /= divide;
95    glColor3fv(color);
96}
97/************************************************************
98 * DRAW BLURRY HEXAGON. draws a solid hexagon, with interpolated colours
99 ************************************************************/
100void RawDataViewer::drawBlurryHexagon(int index)
101{
102
103//per-pixel mesh
104    GLfloat color[3];
105    for (int i=0;i<3;i++)
106        color[i] = pixelsColor[index][i];
107    glBegin(GL_TRIANGLES);
108    calcBlurColor(index, 0);
109    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][0]]);
110    glColor3fv(color);
111    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
112
113    calcBlurColor(index, 1);
114    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][1]]);
115
116    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][1]]);
117    glColor3fv(color);
118    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
119
120    calcBlurColor(index, 2);
121    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][2]]);
122
123    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][2]]);
124    glColor3fv(color);
125    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
126
127    calcBlurColor(index, 3);
128    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][3]]);
129
130    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][3]]);
131    glColor3fv(color);
132    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
133
134    calcBlurColor(index, 4);
135    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][4]]);
136
137    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][4]]);
138    glColor3fv(color);
139    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
140
141    calcBlurColor(index, 5);
142    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][5]]);
143
144    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][5]]);
145    glColor3fv(color);
146    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
147
148    calcBlurColor(index, 0);
149    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][0]]);
150    glEnd();
151
152    return;
153}
154
155/************************************************************
156 * DRAW CAMERA draws all the camera pixels
157 ************************************************************/
158void RawDataViewer::drawCamera(bool alsoWire)
159{
160    glLoadIdentity();
161    if (!drawImpulse)
162    {
163        glTranslatef(0,-0.44,0);
164        glRotatef(cameraRotation, 0,0,-1);
165        if (cameraRotation == 90)
166        {
167            glTranslatef(-0.45,-0.45,0);
168        }
169        if (cameraRotation == -90)
170        {
171            glTranslatef(0.45,-0.45,0);
172        }
173        glScalef(1.5,1.5,1);
174    }
175    else
176    {
177        glRotatef(cameraRotation, 0,0,-1);
178          if (cameraRotation == 90)
179        {
180            glTranslatef(-0.45/1.5,-0.45/1.5,0);
181        }
182        if (cameraRotation == -90)
183        {
184            glTranslatef(0.45/1.5,-0.45/1.5,0);
185        }
186  }
187    glColor3f(0.5,0.5,0.5);
188    glLineWidth(1.0);
189    float color;
190
191    for (int i=0;i<ACTUAL_NUM_PIXELS;i++)
192    {
193        if (!nRoi)
194          color = (float)(i)/(float)(ACTUAL_NUM_PIXELS);
195        else
196
197//        if (_softwareOrdering)
198//            color = float(eventData[nRoi*i + whichSlice] + (VALUES_SPAN/2))/(float)(VALUES_SPAN-1);
199//        else
200            color = float(eventData[nRoi*hardwareMapping[i] + whichSlice]+(VALUES_SPAN/2))/(float)(VALUES_SPAN-1);
201        if (logScale)
202        {
203            color *= 9;
204            color += 1;
205            color = log10(color);
206        }
207
208        if (color < ss[0])
209        {
210            pixelsColor[i][0] = tooLowValueCoulour[0];
211            pixelsColor[i][1] = tooLowValueCoulour[1];
212            pixelsColor[i][2] = tooLowValueCoulour[2];
213            continue;
214        }
215        if (color > ss[4])
216        {
217            pixelsColor[i][0] = tooHighValueCoulour[0];
218            pixelsColor[i][1] = tooHighValueCoulour[1];
219            pixelsColor[i][2] = tooHighValueCoulour[2];
220            continue;
221        }
222        int index = 0;
223        while (ss[index] < color && index < 4)
224            index++;
225        index--;
226        if (index < 0) index = 0;
227        float weight0 = (color-ss[index]) / (ss[index+1]-ss[index]);
228        if (weight0 > 1.0f) weight0 = 1.0f;
229        if (weight0 < 0.0f) weight0 = 0.0f;
230        float weight1 = 1.0f-weight0;
231        pixelsColor[i][0] = weight1*rr[index] + weight0*rr[index+1];
232        pixelsColor[i][1] = weight1*gg[index] + weight0*gg[index+1];
233        pixelsColor[i][2] = weight1*bb[index] + weight0*bb[index+1];
234    }
235
236    for (int i=0;i<ACTUAL_NUM_PIXELS;i++)
237    {
238
239        glColor3fv(pixelsColor[i]);
240        glLoadName(i);
241if (drawBlur)
242    drawBlurryHexagon(i);
243else
244    drawHexagon(i,true);
245
246    }
247    if (!alsoWire)
248        return;
249    glTranslatef(0,0,0.1f);
250    glColor3f(0.0f,0.0f,0.0f);
251    for (int i=0;i<ACTUAL_NUM_PIXELS;i++)
252    {
253
254        drawHexagon(i, false);
255    }
256
257}
258
259/************************************************************
260 * DRAW PIXEL CURVE. draws the raw impulse curve of the currently selected pixel
261 ************************************************************/
262void RawDataViewer::drawPixelCurve()
263{
264    float xRange = bboxMax[0] - bboxMin[0];
265    float yRange = bboxMax[1] - bboxMin[1];
266
267    glBegin(GL_LINES);
268    glLineWidth(1.0f);
269    glColor3f(0.0,0.0,0.0);
270    glVertex2f(bboxMin[0], bboxMin[1]);
271    glVertex2f(bboxMax[0], bboxMin[1]);
272    glVertex2f(bboxMin[0], bboxMin[1]);
273    glVertex2f(bboxMin[0], bboxMax[1]);
274    glVertex2f(bboxMin[0], (bboxMin[1]+bboxMax[1])/2.0f);
275    glVertex2f(bboxMax[0], (bboxMin[1]+bboxMax[1])/2.0f);
276    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*nRoi/(float)(nRoi+nRoiTM),
277               bboxMin[1]);
278    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*nRoi/(float)(nRoi+nRoiTM),
279               bboxMax[1]);
280   glEnd();
281    glTranslatef(0,0,0.1f);
282    if (!nRoi)
283          return;
284     glBegin(GL_LINES);
285    glColor3f(1.0f,1.0f,0.0f);
286    float divideMe = (float)(VALUES_SPAN-1);
287    float plusMe = (float)(VALUES_SPAN)/2;
288    if (divideMe <= 0)
289        divideMe = 1;
290
291    /*
292    if (drawCalibrationLoaded)
293        plusMe += 0;//VALUES_SPAN/2;
294    if (drawCalibrationLoaded && calibrationLoaded)
295    {
296        divideMe /=2;
297        plusMe = 0 ;///=2;
298        }*/
299
300//    int mapping = _softwareOrdering ? selectedPixel : hardwareMapping[selectedPixel];
301    int mapping = hardwareMapping[selectedPixel];
302    const int hw = mapping;
303    const PixelMapEntry& mapEntry = fPixelMap.index(selectedPixel);
304    const int pixelIdInPatch = mapEntry.pixel();
305    const int patchId = mapEntry.patch();
306    const int boardId = mapEntry.board();
307    const int crateId = mapEntry.crate();
308
309    if (selectedPixel != -1)
310    {
311    for (int i=0;i<nRoi-1;i++)
312    {
313        float d1 = eventData[nRoi*hw + i]+plusMe;
314        float d2 = eventData[nRoi*hw + i+1]+plusMe;
315        if (!finite(d1)) d1 = 20000;
316        if (!finite(d2)) d2 = 20000;
317        glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*i/(float)(nRoi+nRoiTM),
318                   bboxMin[1] + yRange*(d1) /divideMe);
319        glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*(i+1)/(float)(nRoi+nRoiTM),
320                   bboxMin[1] + yRange*(d2) /divideMe);
321    }
322    glEnd();
323
324    glColor3f(0.0f, 1.0f, 1.0f);
325    glBegin(GL_LINES);
326    if (pixelIdInPatch == 8)//this channel has a time marker
327    {
328
329        for (int i=0;i<nRoiTM-1;i++)
330        {
331            float d1 = eventData[nRoi*1440 + nRoiTM*(40*crateId + 4*boardId + patchId) + i] + plusMe;
332            float d2 = eventData[nRoi*1440 + nRoiTM*(40*crateId + 4*boardId + patchId) + i+1] + plusMe;
333            if (!finite(d1)) d1 = 20000;
334            if (!finite(d2)) d2 = 20000;
335            glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*(i+nRoi)/(float)(nRoi+nRoiTM),
336                       bboxMin[1] + yRange*(d1)/divideMe);
337            glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*(i+1+nRoi)/(float)(nRoi+nRoiTM),
338                       bboxMin[1] + yRange*(d2) / divideMe);
339        }
340    }
341
342    }
343    glEnd();
344    glTranslatef(0,0,0.1f);
345    glBegin(GL_LINES);
346    glColor3f(1.0,0.0,0.0);
347    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*whichSlice/(float)(nRoi+nRoiTM),
348               bboxMin[1]);
349    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*whichSlice/(float)(nRoi+nRoiTM),
350               bboxMax[1]);
351
352    glEnd();
353
354}
355/************************************************************
356 * CONSTRUCTOR.
357 ************************************************************/
358RawDataViewer::RawDataViewer(QWidget *cParent) : BasicGlCamera(cParent), RMSvalues(1440), Meanvalues(1440), Maxvalues(1440), PosOfMaxvalues(1440), VALUES_SPAN(4096)
359
360{
361
362    whichSlice = 0;
363
364    nRoi = 0;
365    nRoiTM = 0;
366    offSetRoi = 0;
367    eventNum = 0;
368    rowNum = -1;
369    eventStep = 1;
370    selectedPixel = 393;
371    inputFile = NULL;
372    eventData = NULL;
373    drawPatch = false;
374    drawImpulse = true;
375    drawBlur = false;
376    loopCurrentEvent = false;
377    fIsDrsCalibration = false;
378    SetAutoRefresh(true);
379    runType = "unkown";
380
381
382}
383
384void RawDataViewer::assignPixelMapFile(const string& map)
385{
386    PixelMap mypMap;
387    if (map.empty())
388    {
389        if (!mypMap.Read("FACTmap111030.txt"))
390        {
391            if (!mypMap.Read("/swdev_nfs/FACT++/FACTmap111030.txt"))
392            {
393                if (!mypMap.Read("./FACTmap111030.txt"))
394                {
395                    cerr << "ERROR - Problems reading FACTmap111030.txt" << endl;
396                    exit(-1);
397                }
398            }
399        }
400    }
401    else
402    {
403        if (!mypMap.Read(map))
404        {
405            cerr << "ERROR - Problems reading mapping file '" << map << "'" << endl;
406            exit(-1);
407        }
408    }
409
410    assignPixelMap(mypMap);
411
412    for (int i=0;i<160;i++)
413    {
414        const float color[3] = { 0.5, 0.5, 0.3 };
415
416        for (int j=0;j<3;j++)
417            patchesColor[i][j] = color[j];
418    }
419    fZeroArray = NULL;
420
421    _softwareOrdering = false;
422}
423/************************************************************
424 *  DESTRUCTOR
425 ************************************************************/
426RawDataViewer::~RawDataViewer()
427{
428    if (inputFile != NULL)
429    {
430        inputFile->close();
431        delete inputFile;
432    }
433    if (eventData != NULL) {
434        delete[] eventData;
435        delete[] rawEventData;
436        delete[] waveLetArray;
437    }
438    if (fZeroArray != NULL)
439        delete[] fZeroArray;
440}
441void RawDataViewer::allocateZeroArray()
442{
443    if (fZeroArray == NULL)
444    {
445        fZeroArray = new char[8192];
446    }
447}
448/************************************************************
449 * PAINT GL. main drawing function.
450 ************************************************************/
451void RawDataViewer::paintGL()
452{
453    //Should not be required, but apparently it helps when piping it through X forwarding
454    glFinish();
455    glClear(GL_COLOR_BUFFER_BIT | GL_DEPTH_BUFFER_BIT);
456    glLoadIdentity();
457
458    glTranslatef(0,0,-0.5);
459
460    if (drawBlur)
461    {
462        glShadeModel(GL_SMOOTH);
463        drawCamera(false);
464    }
465    else
466    {
467        glShadeModel(GL_FLAT);
468        drawCamera(true);
469    }
470    glTranslatef(0,0,0.1f);
471    if (drawPatch)
472        drawPatches();
473    glTranslatef(0,0,0.1f);
474   if (!drawBlur && (selectedPixel != -1))
475   {
476        glLineWidth(1.0f);
477        glColor3f(1.0,1.0,1.0);
478        drawHexagon(selectedPixel, false);
479   }
480   glTranslatef(0,0,0.1f);
481   if (drawImpulse)
482   {
483    //   glRotatef(cameraRotation, 0,0,1);
484       glLoadIdentity();
485       glLineWidth(2.0);
486       drawPixelCurve();
487   }
488   glTranslatef(0,0,0.1f);
489   DrawScale();
490}
491
492/************************************************************
493 * MOUSE PRESS EVENT. mouse click handler.
494 ************************************************************/
495void RawDataViewer::mousePressEvent(QMouseEvent *cEvent)
496{
497    if (cEvent->pos().x() > width()-(width()/50.f))
498    {
499        toggleInterfaceDisplay();
500        return;
501    }
502    lastPos = cEvent->pos();
503    if (setCorrectSlice(cEvent))
504        return;
505    int face = PixelAtPosition(cEvent->pos());
506
507        selectedPixel = face;
508        emit signalCurrentPixel(face);
509
510    updateGL();
511}
512
513/************************************************************
514 * SET CORRECT SLICE. if displayed, figures out if the graph was
515 * clicked, and if so, which slice should be displayed
516 ************************************************************/
517bool RawDataViewer::setCorrectSlice(QMouseEvent* cEvent)
518{
519    if (!drawImpulse)
520        return false;
521    float cx = (float)cEvent->x() * pixelSize - shownSizex/2;
522    float cy = ((float)height()-(float)cEvent->y())*pixelSize - shownSizey/2;
523    if (cx < bboxMin[0] ||
524        cx > bboxMax[0] ||
525        cy < bboxMin[1] ||
526        cy > bboxMax[1])
527        return false;
528    whichSlice = (cx - bboxMin[0])*(nRoi+nRoiTM)/(bboxMax[0] - bboxMin[0]);
529    if (whichSlice >= nRoi)
530        whichSlice = nRoi-1;
531    emit signalCurrentSlice(whichSlice);
532    return true;
533}
534
535/************************************************************
536 * MOUSE MOVE EVENT. used to track the dragging of slices display
537 ************************************************************/
538void RawDataViewer::mouseMoveEvent(QMouseEvent *cEvent)
539{
540    if (cEvent->buttons() & Qt::LeftButton) {
541        setCorrectSlice(cEvent);
542        updateGL();
543    } else if (cEvent->buttons() & Qt::RightButton) {
544        updateGL();
545    }
546    lastPos = cEvent->pos();
547}
548
549/************************************************************
550 * MOUSE DOUBLE CLICK EVENT. used to select pixels
551 ************************************************************/
552void RawDataViewer::mouseDoubleClickEvent(QMouseEvent *cEvent)
553{
554    int face = PixelAtPosition(cEvent->pos());
555    if (face != -1) {
556        selectedPixel = face;
557        emit signalCurrentPixel(face);
558        updateGL();
559        }
560}
561
562/************************************************************
563 * OPEN FILE. opens a new fits file
564 ************************************************************/
565void RawDataViewer::openFile(string& file)
566{
567    if (inputFile)
568    {
569        inputFile->close();
570        delete inputFile;
571    }
572    try {
573    inputFile = new factfits(file, "Events");
574    }
575    catch (std::runtime_error e)
576    {
577        cout << "Something went wrong while loading fits. Aborting: " << e.what() << endl;
578        return;
579    }
580    if (!*inputFile)
581    {
582        delete inputFile;
583        inputFile = NULL;
584        return;
585    }
586    vector<string> entriesToCheck;
587    if (inputFile->IsCompressedFITS())
588        entriesToCheck.push_back("ZNAXIS2");
589    else
590        entriesToCheck.push_back("NAXIS2");
591    entriesToCheck.push_back("NROI");
592    entriesToCheck.push_back("REVISION");
593    entriesToCheck.push_back("RUNID");
594    entriesToCheck.push_back("NBOARD");
595    entriesToCheck.push_back("NPIX");
596    entriesToCheck.push_back("NROITM");
597    entriesToCheck.push_back("TIMESYS");
598    entriesToCheck.push_back("DATE");
599    entriesToCheck.push_back("NIGHT");
600    entriesToCheck.push_back("CAMERA");
601    entriesToCheck.push_back("DAQ");
602    entriesToCheck.push_back("TSTART");
603    entriesToCheck.push_back("TSTOP");
604
605
606    for (vector<string>::const_iterator it=entriesToCheck.begin(); it != entriesToCheck.end(); it++)
607    {
608        try {
609        if (!inputFile->HasKey(*it)){
610            cout << "Warning: header keyword " << *it << " missing." << endl;
611            }
612        }
613        catch (std::runtime_error e)
614        {
615            cout << e.what() << endl;
616            return;
617        }
618    }
619
620    nRows = 0;
621    if (inputFile->IsCompressedFITS())
622        nRows = inputFile->HasKey("ZNAXIS2") ? inputFile->GetInt("ZNAXIS2") : 0;
623    else
624        nRows = inputFile->HasKey("NAXIS2") ? inputFile->GetInt("NAXIS2") : 0;
625    nRoi =           inputFile->HasKey("NROI") ?  inputFile->GetInt("NROI") : 0;
626    runNumber =      inputFile->HasKey("RUNID") ?  inputFile->GetInt("RUNID") : -1;
627    nTM =            inputFile->HasKey("NTMARK") ? inputFile->GetInt("NTMARK") : 0;
628
629    runType = "unkown";
630    if (inputFile->HasKey("RUNTYPE"))
631    {
632        runType = inputFile->GetStr("RUNTYPE");
633        if (runType == "")
634            runType = "unkown";
635    }
636    firstDataTime =  inputFile->HasKey("TSTART") ? inputFile->GetInt("TSTART") : -1;
637    lastDataTime =   inputFile->HasKey("TSTOP") ? inputFile->GetInt("TSTOP"): -1;
638    nRoiTM =         inputFile->HasKey("NROITM") ? inputFile->GetInt("NROITM") : 0;
639    revision =       inputFile->HasKey("REVISION") ? inputFile->GetInt("REVISION") : -1;
640    builderVersion = inputFile->HasKey("BLDVER") ? inputFile->GetInt("BLDVER") : -1;
641    nBoards =        inputFile->HasKey("NBOARD") ? inputFile->GetInt("NBOARD") : 0;
642    nPixels =        inputFile->HasKey("NPIX") ?  inputFile->GetInt("NPIX") : 0;
643    timeSystem =     inputFile->HasKey("TIMESYS") ? inputFile->GetStr("TIMESYS") : "";
644    creationDate =   inputFile->HasKey("DATE") ? inputFile->GetStr("DATE") : "";
645    nightInt =       inputFile->HasKey("NIGHT") ? inputFile->GetInt("NIGHT") : 0;
646    camera =         inputFile->HasKey("CAMERA") ? inputFile->GetStr("CAMERA") : "";
647    daq =            inputFile->HasKey("DAQ") ? inputFile->GetStr("DAQ") : "";
648    adcCount =       inputFile->HasKey("ADCRANGE") ? inputFile->GetFloat("ADCRANGE") : 2000;
649    if (nPixels == 0)
650    {
651        cout << "could not read num pixels from fits header. Assuming 1440 (FACT)." << endl;
652        nPixels = 1440;
653    }
654    if (nRoi == 0 && !inputFile->HasKey("NROI"))
655    {//let's try to figure out the roi from the column's format
656        const fits::Table::Columns& cols = inputFile->GetColumns();
657        if (cols.find("Data") == cols.end())
658        {
659            cout << "ERROR: Column \"Data\" could not be found. abortin load." << endl;
660            return;
661        }
662        const fits::Table::Columns::const_iterator col = cols.find("Data");
663        if (col->second.type != 'I')
664        {
665            cout << "ERROR: Data Column has type " << col->second.type << " while viewer expects I" << endl;
666            return;
667        }
668        if (col->second.num % nPixels != 0)
669        {
670            cout << "ERROR: Num pixels (" << nPixels << ") does not match Data length (" << col->second.num << "). Aborting" << endl;
671            return;
672        }
673        nRoi = col->second.num/nPixels;
674        cout << "Estimate num samples per pixels to be " << nRoi;
675        _softwareOrdering = true;
676    }
677    else
678        _softwareOrdering = inputFile->Get<string>("ISMC", "F")=="T";
679
680    if (inputFile->HasKey("OFFSET"))
681        offSetRoi = inputFile->GetInt("OFFSET");
682
683    nbOk = 0;//inputFile->GetInt("NBEVTOK");
684    nbRej = 0;//inputFile->GetInt("NBEVTREJ");
685    nbBad = 0;//inputFile->GetInt("NBEVTBAD");
686
687    eventNum = 1;
688
689    if (eventData != NULL) {
690        delete[] eventData;
691        delete[] rawEventData;
692        delete[] waveLetArray;
693    }
694    eventData = new float[1440*nRoi + 160*nRoiTM];//(1440+160)*nRoi];
695
696    rawEventData = new int16_t[1440*nRoi + 160*nRoiTM];//(1440+160)*nRoi];
697    waveLetArray = new int16_t[1024*1440];
698    try
699    {
700        inputFile->SetPtrAddress("Data", rawEventData);
701        if (inputFile->HasColumn("EventNum"))
702            inputFile->SetPtrAddress("EventNum", &eventNum);
703        else
704            cout << "Warning: could not find column \"EventNum\"" << endl;
705        if (inputFile->HasColumn("TriggerType"))
706            inputFile->SetPtrAddress("TriggerType", &triggerType);
707        else
708            cout << "Warning: could not find column \"TriggerType\"" << endl;
709        if (inputFile->HasColumn("SoftTrig"))
710            inputFile->SetPtrAddress("SoftTrig", &softTrig);
711        else
712            cout << "Warning: could not find column \"SoftTrig\"" << endl;
713        if (inputFile->HasColumn("BoardTime"))
714            inputFile->SetPtrAddress("BoardTime", boardTime);
715        else
716            cout << "Warning: could not find column \"BoardTime\"" << endl;
717        if (inputFile->HasColumn("StartCellData"))
718            inputFile->SetPtrAddress("StartCellData", startPix);
719        else
720            cout << "Warning: could not find column \"StartCellData\"" << endl;
721        if (inputFile->HasColumn("StartCellTimeMarker"))
722            inputFile->SetPtrAddress("StartCellTimeMarker", startTM);
723        else
724            cout << "Warning: could not find column \"StartCellTimeMarker\"" << endl;
725        if (inputFile->HasColumn("TimeMarker"))
726            inputFile->SetPtrAddress("TimeMarker", &rawEventData[1440*nRoi]);
727        else
728            cout << "Warning: could not find column \"TimeMarker\"" << endl;
729    }
730    catch (const runtime_error &e)
731    {
732        cout << e.what() << endl;
733        cout << "Loading aborted." << endl;
734
735        nRoi = nRows = 0;
736
737        return;
738    }
739
740    try
741    {
742        pcTime[0] = pcTime[1] = 0;
743        if (inputFile->HasColumn("UnixTimeUTC"))
744            inputFile->SetPtrAddress("UnixTimeUTC", pcTime);
745    }
746    catch (const runtime_error&)
747    {
748            try
749        {
750            if (inputFile->HasColumn("PCTime"))
751                inputFile->SetPtrAddress("PCTime", pcTime);
752            else
753                cout << "Warning: could not find column \"UnixTimeUTC\" nor \"PCTime\"" << endl;
754
755        }
756        catch (const runtime_error&)
757        {
758
759        }
760    }
761
762
763    int backupStep = eventStep;
764    rowNum = -1;
765    eventStep = 1;
766
767    plusEvent();
768    eventStep = backupStep;
769    emit newFileLoaded();
770    emit signalCurrentPixel(selectedPixel);
771}
772
773void RawDataViewer::openCalibFile(string& file)
774{
775    //calibrationLoaded = false;
776    string msg;
777    try
778    {
779        msg = fDrsCalib.ReadFitsImp(file);
780        if (msg.empty())
781        {
782            emit newFileLoaded();
783            updateGL();
784            return;
785        }
786    }
787    catch (const runtime_error &e)
788    {
789        msg = string("Something went wrong while loading Drs Calib: ") + e.what() + string(".. Aborting file loading");
790    }
791    cerr << msg << endl;
792    fDrsCalib.Clear();
793}
794
795template <typename T>
796void RawDataViewer::getCalibrationDataForDisplay(const CalibDataTypes/* calibTypes*/,
797                                                 const vector<T>& inputData,
798                                                 const int roi,
799                                                 const int roiTM)
800{
801
802    eventData = new float[1440*roi + 160*roiTM];//(1440+160)*nRoi];
803    nRoi=roi;
804    nRoiTM=roiTM;
805
806    long long min, max, mean;
807    min = max = inputData[0];
808    mean=0;
809    for (int i=0;i<1440*roi + 160*roiTM;i++) {
810        eventData[i] = (float)inputData[i];
811        mean += inputData[i];
812        if (inputData[i] > max)
813            max = inputData[i];
814        if (inputData[i] < min)
815            min = inputData[i];
816    }
817    mean /= 1440*roi + 160*roiTM;
818    for (int i=0;i<1440*roi + 160*roiTM;i++)
819        eventData[i] -= (float)mean;
820    VALUES_SPAN = max - min;
821//    cout << VALUES_SPAN << " " << min << " " << max << " " << mean << endl;
822//    cout << 1440*roi + 160*roiTM << " " << roi << " " << roiTM << " " << inputData.size() << endl;
823}
824/************************************************************
825 * PLUS EVENT
826 ************************************************************/
827void RawDataViewer::plusEvent()
828{
829    eventStepping(true);
830}
831/************************************************************
832 * MINUS EVENT
833 ************************************************************/
834void RawDataViewer::minusEvent()
835{
836    eventStepping(false);
837}
838/************************************************************
839 * SET EVENT STEP
840 ************************************************************/
841void RawDataViewer::setEventStep(int step)
842{
843    eventStep = step;
844}
845/************************************************************
846 * EVENT STEPPING
847 ************************************************************/
848
849void RawDataViewer::ApplyCalibration()
850{
851    for (int i=0;i<1440*nRoi + 160*nRoiTM;i++)//(1440+160)*nRoi;i++)
852        eventData[i] = (float)rawEventData[i];
853
854    if (fIsDrsCalibration)
855    {
856        fDrsCalib.Apply(eventData, rawEventData, startPix, nRoi);
857        DrsCalibrate::RemoveSpikes(eventData, nRoi);
858        //TODO apply calibration to the Time markers
859    }
860
861    //hide the time markers
862    int nSlicesToRemove = 60;
863    float* backupData = 0;
864    if (nRoiTM == 0) //they are written into the regular channel
865    {
866        backupData = new float[nSlicesToRemove*160];
867        for (int i=0;i<1440;i++)
868        {
869            const PixelMapEntry& mapEntry = fPixelMap.index(i);
870            const int pixelIdInPatch = mapEntry.pixel();
871            const int patchId = mapEntry.patch();
872            const int boardId = mapEntry.board();
873            const int crateId = mapEntry.crate();
874
875            const int hw = mapEntry.hw();
876            if (pixelIdInPatch == 8)
877            {
878                for (int j=0;j<nSlicesToRemove;j++)
879                {
880                    backupData[(40*crateId + 4*boardId + patchId)*nSlicesToRemove+j] = eventData[(hw*nRoi) + (nRoi-nSlicesToRemove) + j];
881                    eventData[(hw*nRoi) + (nRoi-nSlicesToRemove) + j] = eventData[hw*nRoi + (nRoi-nSlicesToRemove) - 1];
882                }
883            }
884        }
885    }
886
887    vector<float> pixelStatsData(1440*4);
888    DrsCalibrate::GetPixelStats(pixelStatsData.data(), eventData, nRoi);
889
890    for (vector<PixelMapEntry>::const_iterator it=fPixelMap.begin(); it!=fPixelMap.end(); it++)
891    {
892        Meanvalues[it->index]     = pixelStatsData[0*1440+it->hw()];
893        RMSvalues[it->index]      = pixelStatsData[1*1440+it->hw()];
894        Maxvalues[it->index]      = pixelStatsData[2*1440+it->hw()];
895        PosOfMaxvalues[it->index] = pixelStatsData[3*1440+it->hw()];
896    }
897    if (nRoiTM == 0)//move back the data back in place
898    {
899        for (int i=0;i<1440;i++)
900        {
901            const PixelMapEntry& mapEntry = fPixelMap.index(i);
902            const int pixelIdInPatch = mapEntry.pixel();
903            const int patchId = mapEntry.patch();
904            const int boardId = mapEntry.board();
905            const int crateId = mapEntry.crate();
906            if (patchId > 160)
907                cout << "Voila mon probleme: " << patchId << endl;
908            const int hw = mapEntry.hw();
909            if (pixelIdInPatch == 8)
910            {
911 //               cout << "|" << crateId << " " << boardId << " " << patchId << " " << hw << "| ";
912                for (int j=0;j<nSlicesToRemove;j++)
913                {
914                    eventData[(hw*nRoi) + (nRoi - nSlicesToRemove) + j] = backupData[(40*crateId + 4*boardId + patchId)*nSlicesToRemove+j];
915                }
916            }
917        }
918        delete[] backupData;
919    }
920    if (isVisible())
921        updateGL();
922}
923
924void RawDataViewer::eventStepping(bool plus)
925{
926    if (plus)
927        rowNum += eventStep;
928    else
929        rowNum -= eventStep;
930    if (rowNum >= nRows)
931        rowNum -= nRows;
932    if (rowNum < 0)
933        rowNum += nRows;
934
935    if (inputFile == NULL)
936        return;
937    inputFile->GetRow(rowNum);
938    if (_softwareOrdering)
939    {//remap pixels data according to hardware id
940        if (nRoiTM != 0)
941            cout << "Warning: did not expect Time Markers data from Monte-Carlo simulations. These will not be mapped properly." << endl;
942        //first copy the data
943        int16_t* tempData = new int16_t[1440*nRoi];
944        for (int i=0;i<1440*nRoi;i++)
945            tempData[i] = rawEventData[i];
946        //copy back the data and re-map it on the fly
947        for (int i=0;i<1440;i++)
948            for (int j=0;j<nRoi;j++)
949                rawEventData[i*nRoi + j] = tempData[softwareMapping[i]*nRoi + j];
950
951        delete[] tempData;
952    }
953//    cout << "Getting row " << rowNum << endl;
954
955
956    ApplyCalibration();
957
958    emit signalCurrentEvent(eventNum);
959    emit signalCurrentPixel(selectedPixel);
960}
961
962/************************************************************
963 * NEXT SLICE. deprec ?
964 ************************************************************/
965void RawDataViewer::nextSlice()
966{
967    whichSlice++;
968    if (whichSlice >= nRoi)
969    {
970        whichSlice = 0;
971        if (!loopCurrentEvent)
972        {
973            int backupStep = eventStep;
974            eventStep = 1;
975            eventStepping(true);
976            eventStep = backupStep;
977        }
978    }
979    emit signalCurrentSlice(whichSlice);
980    updateGL();
981}
982void RawDataViewer::previousSlice()
983{
984    whichSlice--;
985    if (whichSlice < 0)
986    {
987        whichSlice = nRoi-1;
988        if (!loopCurrentEvent)
989        {
990            int backupStep = eventStep;
991            eventStep = 1;
992            eventStepping(false);
993            eventStep = backupStep;
994        }
995    }
996    emit signalCurrentSlice(whichSlice);
997    updateGL();
998}
999void RawDataViewer::setCurrentPixel(int pix)
1000{
1001 //   if (pix == -1)
1002 //       return;
1003    selectedPixel = pix;
1004    if (isVisible())
1005    updateGL();
1006     emit signalCurrentPixel(pix);
1007}
1008void RawDataViewer::computePulsesStatistics()
1009{
1010    if (!inputFile)
1011    {
1012        cout << "A FITS file must be open in order to complete this operation" << endl;
1013        return;
1014    }
1015
1016
1017//    for (int i=0;i<nRows;i++)//for all events
1018//    {
1019//        inputFile->GetRow(rowNum);
1020//        for (int i=0;i<(1440+160)*nRoi;i++)
1021//            eventData[i] = (float)rawEventData[i];
1022
1023//        for (int j=0;j<ACTUAL_NUM_PIXELS;j++)
1024///        {
1025    int j = selectedPixel;
1026    if (j == -1)
1027        return;
1028            for (int i=0;i<nRoi;i++)
1029            {
1030                aMeas[i] = eventData[j*nRoi+i];// * adcCount;
1031
1032            }
1033            for (int i=0;i<nRoi;i++)
1034            {
1035                if (i==0)
1036                    n1mean[i] = aMeas[i+1];
1037                else
1038                {
1039                    if (i==1023)
1040                        n1mean[i] = aMeas[i-1];
1041                    else
1042                        n1mean[i] = (aMeas[i-1]+aMeas[i+1])/2.f;
1043                }
1044            }
1045            //find spike
1046            for (int i=0;i<nRoi-3;i++)
1047            {
1048                const float fract = 0.8f;
1049                float xx, xp, xpp;
1050                vCorr[i] = 0;//aMeas[i];
1051                xx = aMeas[i] - n1mean[i];
1052                if (xx < -8.f)
1053                {
1054                    xp = aMeas[i+1] - n1mean[i+1];
1055                    xpp = aMeas[i+2] - n1mean[i+2];
1056                    if ((aMeas[i+2] - (aMeas[i] + aMeas[i+3])/2.f) > 10.f)
1057                    {
1058                        vCorr[i+1] = (aMeas[i] + aMeas[i+3])/2.f;
1059                        vCorr[i+2] = (aMeas[i] + aMeas[i+3])/2.f;
1060                        i = i+2;
1061                    }
1062                    else
1063                    {
1064                        if ((xp > -2.*xx*fract) && (xpp < -10.f))
1065                        {
1066                            vCorr[i+1] = n1mean[i+1];
1067                            n1mean[i+2] = aMeas[i+1] - aMeas[i+3]/2.f;
1068                            i++;
1069                        }
1070                    }
1071                }
1072            }
1073            for (int i=0;i<nRoi;i++)
1074                n1mean[i] = aMeas[i]-n1mean[i];
1075 //       }
1076 //   }
1077}
1078/************************************************************
1079 * UICONNECTOR CONSTRUCTOR
1080 ************************************************************/
1081UIConnector::UIConnector(QWidget *p)
1082{
1083    setupUi(this);
1084    initHistograms();
1085
1086    currentFile = "none";
1087    currentCalibFile = "none";
1088
1089    updateSpinnerDisplay = true;
1090    updating = false;
1091
1092    timer.setInterval(10.0);
1093    QObject::connect(&timer, SIGNAL(timeout()),
1094                     this, SLOT(nextSlicePlease()));
1095
1096    QButtonGroup &scaleGroup = *new QButtonGroup(p);// = new QButtonGroup(canvas);
1097    QButtonGroup &animateGroup = *new QButtonGroup(p);// = new QButtonGroup(canvas);
1098
1099    scaleGroup.addButton(currentPixelScale);
1100    scaleGroup.addButton(entireCameraScale);
1101
1102    animateGroup.addButton(playEventsRadio);
1103    animateGroup.addButton(playSlicesRadio);
1104    animateGroup.addButton(playPixelsRadio);
1105
1106    entireCameraScale->setChecked(true);
1107
1108    RMS_window->enableText(false);
1109    Mean_window->enableText(false);
1110    PosOfMax_window->enableText(false);
1111    Max_window->enableText(false);
1112
1113 //   RMS_window->ShowPatchCursor(true);
1114
1115    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(colorPaletteHasChanged()),
1116                     this, SLOT(on_autoScaleColor_clicked()));
1117    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(signalCurrentSlice(int)),
1118                     this, SLOT(currentSliceHasChanged(int)));
1119    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(signalCurrentEvent(int)),
1120                     this, SLOT(currentEventHasChanged(int)));
1121    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1122                     this, SLOT(pixelChanged(int)));
1123    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(newFileLoaded()),
1124                     this, SLOT(newFileLoaded()));
1125
1126    QObject::connect(RMS_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1127                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1128    QObject::connect(Max_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1129                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1130    QObject::connect(PosOfMax_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1131                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1132    QObject::connect(Mean_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1133                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1134
1135
1136
1137    show();
1138}
1139UIConnector::~UIConnector()
1140{
1141    grid1->detach();
1142    grid2->detach();
1143    grid3->detach();
1144    grid4->detach();
1145    grid5->detach();
1146    grid6->detach();
1147    boardsTimeHistoItem.detach();
1148    startCellHistoItem.detach();
1149    startTimeMarkHistoItem.detach();
1150    pixelValueCurveItem.detach();
1151    pixelAverageCurveItem.detach();
1152    aMeanCurveItem.detach();
1153    vCorrCurveItem.detach();
1154    meanCurveItem.detach();
1155}
1156void UIConnector::slicesPlusPlus()
1157{
1158    GLWindow->nextSlice();
1159}
1160void UIConnector::slicesMinusMinus()
1161{
1162    GLWindow->previousSlice();
1163}
1164void UIConnector::on_calibratedCheckBox_stateChanged(int state)
1165{
1166    GLWindow->fIsDrsCalibration = state;
1167    GLWindow->ApplyCalibration();
1168    threeD_Window->setData(GLWindow->eventData);
1169
1170    on_autoScaleColor_clicked();
1171    pixelChanged(GLWindow->selectedPixel);
1172
1173}
1174/************************************************************
1175 * DRAW PATCHES CHECK CHANGE. checkbox handler
1176 ************************************************************/
1177void UIConnector::on_drawPatchCheckBox_stateChanged(int state)
1178{
1179    GLWindow->drawPatch = state;
1180    GLWindow->updateGL();
1181    RMS_window->fDrawPatch = state;
1182    RMS_window->updateGL();
1183    Mean_window->fDrawPatch = state;
1184    Mean_window->updateGL();
1185    Max_window->fDrawPatch = state;
1186    Max_window->updateGL();
1187    PosOfMax_window->fDrawPatch = state;
1188    PosOfMax_window->updateGL();
1189}
1190/************************************************************
1191 * DRAW IMPULSE CHECK CHANGE. checkbox handler
1192 ************************************************************/
1193void UIConnector::on_drawImpulseCheckBox_stateChanged(int state)
1194{
1195    GLWindow->drawImpulse = state;
1196    TriggerOffset_window->drawImpulse = state;
1197    Gain_window->drawImpulse = state;
1198    Baseline_window->drawImpulse = state;
1199    GLWindow->updateGL();
1200    TriggerOffset_window->updateGL();
1201    Gain_window->updateGL();
1202    Baseline_window->updateGL();
1203}
1204/************************************************************
1205 * DRAW BLUR CHECK CHANGE. checkbox handler
1206 ************************************************************/
1207void UIConnector::on_drawBlurCheckBox_stateChanged(int state)
1208{
1209    GLWindow->drawBlur = state;
1210    GLWindow->updateGL();
1211}
1212void UIConnector::on_loopOverCurrentEventBox_stateChanged(int state)
1213{
1214    GLWindow->loopCurrentEvent = state;
1215}
1216
1217/************************************************************
1218 * NEXT SLICE PLEASE
1219 ************************************************************/
1220void UIConnector::nextSlicePlease()
1221{
1222    if (playEventsRadio->isChecked ())
1223        GLWindow->eventStepping(true);
1224    else
1225        if (playPixelsRadio->isChecked())
1226            GLWindow->setCurrentPixel((GLWindow->getCurrentPixel()+1)%1440);
1227        else
1228            GLWindow->nextSlice();
1229}
1230
1231/************************************************************
1232 * SET VIEWER.
1233 ************************************************************/
1234//void UIConnector::setViewer(RawDataViewer* v)
1235//{
1236//    viewer = v;
1237//}
1238/************************************************************
1239 * SLICES PER SECOND CHANGED. timing ui handler
1240 ************************************************************/
1241void UIConnector::slicesPerSecondChanged(double value)
1242{
1243    timer.setInterval(1000.0/value);
1244}
1245
1246void UIConnector::on_colorRange0_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1247void UIConnector::on_colorRange1_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1248void UIConnector::on_colorRange2_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1249void UIConnector::on_colorRange3_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1250void UIConnector::on_colorRange4_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1251
1252void UIConnector::on_redValue0_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1253void UIConnector::on_redValue1_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1254void UIConnector::on_redValue2_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1255void UIConnector::on_redValue3_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1256void UIConnector::on_redValue4_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1257
1258void UIConnector::on_greenValue0_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1259void UIConnector::on_greenValue1_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1260void UIConnector::on_greenValue2_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1261void UIConnector::on_greenValue3_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1262void UIConnector::on_greenValue4_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1263
1264void UIConnector::on_blueValue0_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1265void UIConnector::on_blueValue1_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1266void UIConnector::on_blueValue2_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1267void UIConnector::on_blueValue3_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1268void UIConnector::on_blueValue4_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1269
1270/************************************************************
1271 * LOAD NEW FILE CLICKED. button handler
1272 ************************************************************/
1273void UIConnector::on_loadNewFileButton_clicked()
1274{
1275    QFileDialog dialog;
1276    dialog.setFileMode(QFileDialog::ExistingFile);
1277    dialog.open(this, SLOT(fileSelected(QString)));
1278    dialog.setVisible(true);
1279    dialog.exec();
1280}
1281void UIConnector::on_loadDRSCalibButton_clicked()
1282{
1283    QFileDialog dialog;
1284    dialog.setFileMode(QFileDialog::ExistingFile);
1285    dialog.open(this, SLOT(calibFileSelected(QString)));
1286    dialog.setVisible(true);
1287    dialog.exec();
1288}
1289/************************************************************
1290 * FILE SELECTED. return of the file open dialog handler
1291 ************************************************************/
1292void UIConnector::fileSelected(QString file)
1293{
1294    currentFile = file.toStdString();
1295    if (currentFile != "")
1296        GLWindow->openFile(currentFile);
1297}
1298void UIConnector::calibFileSelected(QString file)
1299{
1300    currentCalibFile = file.toStdString();
1301    if (currentCalibFile != "")
1302        GLWindow->openCalibFile(currentCalibFile);
1303    if (GLWindow->fDrsCalib.fRoi != 0)
1304    {//spread the calibration data to the displayers
1305        Baseline_window->getCalibrationDataForDisplay(RawDataViewer::CALIB_BASELINE,
1306                                                      GLWindow->fDrsCalib.fOffset,
1307                                                      GLWindow->fDrsCalib.fRoi,
1308                                                      GLWindow->fDrsCalib.fNumTm);
1309
1310        Gain_window->getCalibrationDataForDisplay(RawDataViewer::CALIB_GAIN,
1311                                                  GLWindow->fDrsCalib.fGain,
1312                                                  GLWindow->fDrsCalib.fRoi,
1313                                                  GLWindow->fDrsCalib.fNumTm);
1314
1315        TriggerOffset_window->getCalibrationDataForDisplay(RawDataViewer::CALIB_TRIG_OFFSET,
1316                                                           GLWindow->fDrsCalib.fTrgOff,
1317                                                           GLWindow->fDrsCalib.fRoi,
1318                                                           GLWindow->fDrsCalib.fNumTm);
1319
1320    }
1321}
1322/************************************************************
1323 * NEW FILE LOADED. update of the UI after a new file has been loaded
1324 ************************************************************/
1325void UIConnector::newFileLoaded()
1326{
1327    ostringstream str;
1328
1329    //extract the file name only (no path) from the full name
1330    str << "File: ";
1331    if (currentFile.size() > 2)
1332        str << currentFile.substr(currentFile.find_last_of("//")+1, currentFile.size()) << "\n";
1333    else
1334        str << "--\n";
1335    str << "Calibration: ";
1336    if (currentCalibFile.size() > 2)
1337        str << currentCalibFile.substr(currentCalibFile.find_last_of("//")+1, currentCalibFile.size()) << "\n";
1338    else
1339        str << "--\n";
1340//    fileLoadedLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1341//    str.str("");
1342    str << "Run number: " << GLWindow->runNumber << "\n";
1343//    runNumberLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1344//    str.str("");
1345    str << "Number of Events: " << GLWindow->nRows << "\n";
1346
1347    displayingEventBox->setMaximum(GLWindow->nRows-1);
1348
1349    str << "Number of Slices: " << GLWindow->nRoi << "\n";// << "/1024";
1350//    numberOfSlicesLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1351//    str.str("");
1352    str << "Number of Time Marks: " << GLWindow->nTM << "\n";
1353//    numberOfTimeMarksLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1354
1355//    str.str("");
1356    str << "Run Type: " << GLWindow->runType << "\n";
1357//    runTypeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1358//    str.str("");
1359    str << "Time of 1st data: " << GLWindow->firstDataTime << "\n";
1360//    firstTimeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1361//    str.str("");
1362    str << "Time of last data: " << GLWindow->lastDataTime << "\n";
1363//    lastTimeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1364//    str.str("");
1365    str << "SVN revision: " << GLWindow->revision << '\n';
1366    str << "Number of boards: " << GLWindow->nBoards << '\n';
1367    str << "Number of pixels: " << GLWindow->nPixels << '\n';
1368    str << "Number of Slices TM: " << GLWindow->nRoiTM << '\n';
1369    str << "Time system: " << GLWindow->timeSystem << '\n';
1370    str << "Date: " << GLWindow->creationDate << '\n';
1371    str << "Night: " << GLWindow->nightInt << '\n';
1372    str << "Camera: " << GLWindow->camera << '\n';
1373    str << "DAQ: " << GLWindow->daq << '\n';
1374    str << "ADC Count: " << GLWindow->adcCount << '\n';
1375    str << "NB Evts OK:" << GLWindow->nbOk << '\n';
1376    str << "NB Evts Rejected: " << GLWindow->nbRej << '\n';
1377    str << "NB Evts Bad: " << GLWindow->nbBad << '\n';
1378    extraInfoLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1379
1380    /*
1381    if (GLWindow->calibrationLoaded)
1382    {
1383        drawCalibrationCheckBox->setEnabled(true);
1384    }*/
1385
1386
1387}
1388/************************************************************
1389 * PLAY PAUSE CLICKED. ui handler
1390 ************************************************************/
1391void UIConnector::on_playPauseButton_clicked()
1392{
1393    if (timer.isActive())
1394        timer.stop();
1395    else
1396        timer.start();
1397}
1398
1399void UIConnector::displaySliceValue()
1400{
1401    if (!GLWindow->nRoi)
1402        return;
1403    if (GLWindow->selectedPixel == -1)
1404    {
1405        ostringstream str;
1406        str << " Current Pixel val.: --";
1407        currentPixelValue->setText(QString(str.str().c_str()));
1408        return;
1409    }
1410//    int mapping = GLWindow->_softwareOrdering ? GLWindow->selectedPixel : GLWindow->hardwareMapping[GLWindow->selectedPixel];
1411    int mapping = GLWindow->hardwareMapping[GLWindow->selectedPixel];
1412    const int idx = GLWindow->nRoi*mapping + GLWindow->whichSlice;
1413
1414    ostringstream str;
1415    str << "Current Pixel val.: " << GLWindow->eventData[idx];
1416    currentPixelValue->setText(QString(str.str().c_str()));
1417}
1418
1419/************************************************************
1420 * CURRENT SLICE HAS CHANGE. ui handler
1421 ************************************************************/
1422void UIConnector::currentSliceHasChanged(int slice)
1423{
1424    if (!GLWindow->nRoi)
1425        return;
1426
1427    if (updateSpinnerDisplay)
1428        displayingSliceBox->setValue(slice);
1429
1430    displaySliceValue();
1431}
1432
1433/*****
1434 *******************************************************
1435 * CURRENT EVENT HAS CHANGED. ui handler
1436 ************************************************************/
1437
1438double xval[50000];
1439double yval[50000];
1440void UIConnector::on_displayingEventBox_valueChanged(int cEvent)
1441{
1442//    cout << "Here " << updateSpinnerDisplay << endl;
1443    if (!updateSpinnerDisplay)
1444        return;
1445    updateSpinnerDisplay = false;
1446//    currentEventHasChanged(cEvent);
1447    GLWindow->rowNum = cEvent - GLWindow->eventStep;
1448    GLWindow->eventStepping(true);
1449    updateSpinnerDisplay = true;
1450
1451//    GLWindow->updateGL();
1452}
1453void UIConnector::on_slicesPerSecValue_valueChanged(double value)
1454{
1455    timer.setInterval(1000.0/value);
1456}
1457void UIConnector::on_displayingSliceBox_valueChanged(int cSlice)
1458{
1459    updateSpinnerDisplay = false;
1460    currentSliceHasChanged(cSlice);
1461    updateSpinnerDisplay = true;
1462    GLWindow->whichSlice = cSlice;
1463    GLWindow->updateGL();
1464}
1465void UIConnector::currentEventHasChanged(int )
1466{
1467
1468    RMS_window->SetData(GLWindow->RMSvalues);
1469    Mean_window->SetData(GLWindow->Meanvalues);
1470    PosOfMax_window->SetData(GLWindow->PosOfMaxvalues);
1471    Max_window->SetData(GLWindow->Maxvalues);
1472    threeD_Window->setData(GLWindow->eventData);//rawEventData);
1473
1474    if (RMS_window->isVisible())
1475        RMS_window->updateGL();
1476    if (Mean_window->isVisible())
1477        Mean_window->updateGL();
1478    if (PosOfMax_window->isVisible())
1479        PosOfMax_window->updateGL();
1480    if (Max_window->isVisible())
1481        Max_window->updateGL();
1482    ostringstream str;
1483//    str << "Displaying Event " << cEvent;
1484//    QString qstr(str.str().c_str());
1485//    emit updateCurrentEventDisplay(qstr);
1486    if (updateSpinnerDisplay)
1487    {
1488        updateSpinnerDisplay = false;
1489        displayingEventBox->setValue(GLWindow->rowNum);
1490        updateSpinnerDisplay = true;
1491    }
1492
1493 //   GLWindow->doWaveLetOnCurrentEventPlease();
1494
1495        //retrieve the data that we want to display
1496    boost::posix_time::ptime hrTime( boost::gregorian::date(1970, boost::gregorian::Jan, 1),
1497            boost::posix_time::seconds(GLWindow->pcTime[0]) +  boost::posix_time::microsec(GLWindow->pcTime[1]));
1498
1499    str.str("");
1500    str << "PC Time: " << boost::posix_time::to_iso_extended_string(hrTime);
1501    PCTimeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1502
1503    str.str("");
1504    str << "Software Trigger: " << GLWindow->softTrig;
1505    softwareTriggerLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1506
1507    str.str("");
1508    str << "Trigger Type: " << GLWindow->triggerType;
1509    triggerTypeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1510
1511    displaySliceValue();
1512
1513    if (autoScaleColor->isChecked())
1514        emit GLWindow->colorPaletteHasChanged();//autoScalePressed();
1515
1516    boardsTimeList->clear();
1517    startPixelsList->clear();
1518    startTimeMarksList->clear();
1519    triggerDelayList->clear();
1520    std::map<int, int> boardsHistoMap;
1521    for (int i=0;i <NBOARDS; i++)
1522    {
1523        str.str("");
1524        str << i;
1525        if (i<10) str << " ";
1526        if (i<100) str << " ";
1527        if (i<1000) str << " ";
1528        str << ": " << GLWindow->boardTime[i];
1529        boardsTimeList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1530        if (boardsHistoMap.find(GLWindow->boardTime[i]) != boardsHistoMap.end())
1531            boardsHistoMap[GLWindow->boardTime[i]]++;
1532        else
1533            boardsHistoMap[GLWindow->boardTime[i]] = 1;
1534    }
1535    std::map<int, int> pixelHistoMap;
1536    for (int i=0;i <NPIX; i++)
1537    {
1538        str.str("");
1539        str << i;
1540        if (i<10) str << " ";
1541        if (i<100) str << " ";
1542        if (i<1000) str << " ";
1543        str << ": " << GLWindow->startPix[i];
1544        startPixelsList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1545        if (pixelHistoMap.find(GLWindow->startPix[i]) != pixelHistoMap.end())
1546            pixelHistoMap[GLWindow->startPix[i]]++;
1547        else
1548            pixelHistoMap[GLWindow->startPix[i]] = 1;
1549    }
1550
1551    std::map<int, int> timeMarksMap;
1552    for (int i=0;i <NTMARK; i++)
1553    {
1554        str.str("");
1555        str << i;
1556        if (i<10) str << " ";
1557        if (i<100) str << " ";
1558        if (i<1000) str << " ";
1559        str << ": " << GLWindow->startTM[i];
1560        startTimeMarksList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1561        if (timeMarksMap.find(GLWindow->startTM[i]) != timeMarksMap.end())
1562            timeMarksMap[GLWindow->startTM[i]]++;
1563        else
1564            timeMarksMap[GLWindow->startTM[i]] = 1;
1565    }
1566    std::map<int,int> delayMap;
1567    triggerDelayList->addItem(QString("Patch | Slice:Delay Slice:Delay..."));
1568    for (int i=0;i<NTMARK; i++)
1569    {
1570        str.str("");
1571        str << i << " | ";
1572        for (int j=0;j<GLWindow->nRoi;j++)
1573        {
1574            int value = GLWindow->eventData[1440*GLWindow->nRoi + i*GLWindow->nRoi + j];
1575            if (delayMap.find(value) != delayMap.end())
1576                 delayMap[value]++;
1577             else
1578                 delayMap[value] = 1;
1579            str << j << ":" << value << " ";
1580         }
1581        triggerDelayList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1582    }
1583
1584    std::map<int,int>::iterator it = boardsHistoMap.begin();
1585    int nsamples = 0;
1586    int previousValue = it->first-10;
1587    for (unsigned int i=0;i<boardsHistoMap.size();i++)
1588    {
1589        if (previousValue != it->first-1)
1590        {
1591            xval[nsamples] = previousValue+1;
1592            yval[nsamples] = 0;
1593            nsamples++;
1594            xval[nsamples] = it->first-1;
1595            yval[nsamples] = 0;
1596            nsamples++;
1597        }
1598        xval[nsamples] = it->first;
1599        yval[nsamples] = it->second;
1600        previousValue = it->first;
1601        it++;
1602        nsamples++;
1603        xval[nsamples] = previousValue;
1604        yval[nsamples] = 0;
1605        nsamples++;
1606        if (nsamples > 4090)
1607        {
1608            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1609            break;
1610        }
1611    }
1612    xval[nsamples] = it==boardsHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1613    yval[nsamples] = 0;
1614    nsamples++;
1615 //   if (nsamples > 5)
1616#if QWT_VERSION < 0x060000
1617       boardsTimeHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1618#else
1619       boardsTimeHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1620#endif
1621
1622    it = pixelHistoMap.begin();
1623    nsamples = 0;
1624    previousValue = it->first-10;
1625    for (unsigned int i=0;i<pixelHistoMap.size();i++)
1626    {
1627        if (previousValue != it->first-1)
1628        {
1629            xval[nsamples] = previousValue+1;
1630            yval[nsamples] = 0;
1631            nsamples++;
1632            xval[nsamples] = it->first-1;
1633            yval[nsamples] = 0;
1634            nsamples++;
1635        }
1636        xval[nsamples] = it->first;
1637        yval[nsamples] = it->second;
1638        previousValue = it->first;
1639        it++;
1640        nsamples++;
1641        xval[nsamples] = previousValue;
1642        yval[nsamples] = 0;
1643        nsamples++;
1644        if (nsamples > 4090)
1645        {
1646            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1647            break;
1648        }
1649   }
1650    xval[nsamples] = it==pixelHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1651    yval[nsamples] = 0;
1652    nsamples++;
1653//    if (nsamples > 5)
1654#if QWT_VERSION < 0x060000
1655       startCellHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1656#else
1657       startCellHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1658#endif
1659
1660    it = timeMarksMap.begin();
1661    nsamples = 0;
1662    previousValue = it->first-10;
1663    for (unsigned int i=0;i<timeMarksMap.size();i++)
1664    {
1665        if (previousValue != it->first-1)
1666        {
1667            xval[nsamples] = previousValue+1;
1668            yval[nsamples] = 0;
1669            nsamples++;
1670            xval[nsamples] = it->first-1;
1671            yval[nsamples] = 0;
1672            nsamples++;
1673        }
1674        xval[nsamples] = it->first;
1675        yval[nsamples] = it->second;
1676        previousValue = it->first;
1677        it++;
1678        nsamples++;
1679        xval[nsamples] = previousValue;
1680        yval[nsamples] = 0;
1681        nsamples++;
1682        if (nsamples > 4090)
1683        {
1684            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1685            break;
1686        }
1687    }
1688    xval[nsamples] = it==timeMarksMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1689    yval[nsamples] = 0;
1690    nsamples++;
1691 //   if (nsamples > 5)
1692#if QWT_VERSION < 0x060000
1693       startTimeMarkHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1694#else
1695       startTimeMarkHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1696#endif
1697
1698    it = delayMap.begin();
1699    nsamples = 0;
1700    previousValue = it->first-10;
1701    for (unsigned int i=0;i<delayMap.size();i++)
1702    {
1703        if (previousValue != it->first-1)
1704        {
1705            xval[nsamples] = previousValue+1;
1706            yval[nsamples] = 0;
1707            nsamples++;
1708            xval[nsamples] = it->first-1;
1709            yval[nsamples] = 0;
1710            nsamples++;
1711        }
1712        xval[nsamples] = it->first;
1713        yval[nsamples] = it->second;
1714        previousValue = it->first;
1715        it++;
1716        nsamples++;
1717        xval[nsamples] = previousValue;
1718        yval[nsamples] = 0;
1719        nsamples++;
1720        if (nsamples > 4090)
1721        {
1722            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1723            break;
1724        }
1725    }
1726    xval[nsamples] = it==delayMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1727    yval[nsamples] = 0;
1728    nsamples++;
1729  //  if (nsamples > 5)
1730#if QWT_VERSION < 0x060000
1731       triggerDelayHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1732#else
1733       triggerDelayHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1734#endif
1735       //WAVELETS HACK
1736/*       std::map<int, int> valuesHistoMap;
1737       std::map<int, int> waveletHistoMap;
1738       for (int i=0;i<1024*1440;i++)
1739       {
1740           if (valuesHistoMap.find(GLWindow->rawEventData[i]) != valuesHistoMap.end())
1741               valuesHistoMap[GLWindow->rawEventData[i]]++;
1742           else
1743               valuesHistoMap[GLWindow->rawEventData[i]] = 1;
1744           if (waveletHistoMap.find(GLWindow->waveLetArray[i]) != waveletHistoMap.end())
1745               waveletHistoMap[GLWindow->waveLetArray[i]]++;
1746           else
1747               waveletHistoMap[GLWindow->waveLetArray[i]] = 1;
1748       }
1749
1750       it = valuesHistoMap.begin();
1751       nsamples = 0;
1752       previousValue = it->first-10;
1753       cout << "Num values Original: " << valuesHistoMap.size() << endl;
1754       for (unsigned int i=0;i<valuesHistoMap.size();i++)
1755       {
1756           if (previousValue != it->first-1)
1757           {
1758               xval[nsamples] = previousValue+1;
1759               yval[nsamples] = 0;
1760               nsamples++;
1761               xval[nsamples] = it->first-1;
1762               yval[nsamples] = 0;
1763               nsamples++;
1764           }
1765           xval[nsamples] = it->first;
1766           yval[nsamples] = it->second;
1767           previousValue = it->first;
1768           it++;
1769           nsamples++;
1770           xval[nsamples] = previousValue;
1771           yval[nsamples] = 0;
1772           nsamples++;
1773           if (nsamples > 50000)
1774           {
1775               cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1776               break;
1777           }
1778       }
1779       xval[nsamples] = it==valuesHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1780       yval[nsamples] = 0;
1781       nsamples++;
1782     //  if (nsamples > 5)
1783   #if QWT_VERSION < 0x060000
1784          triggerDelayHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1785   #else
1786          triggerDelayHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1787   #endif
1788
1789          it = waveletHistoMap.begin();
1790          nsamples = 0;
1791          previousValue = it->first-10;
1792          cout << "Num values WaveLets: " << waveletHistoMap.size() << endl;
1793          for (unsigned int i=0;i<waveletHistoMap.size();i++)
1794          {
1795              if (previousValue != it->first-1)
1796              {
1797                  xval[nsamples] = previousValue+1;
1798                  yval[nsamples] = 0;
1799                  nsamples++;
1800                  xval[nsamples] = it->first-1;
1801                  yval[nsamples] = 0;
1802                  nsamples++;
1803              }
1804              xval[nsamples] = it->first;
1805              yval[nsamples] = it->second;
1806              previousValue = it->first;
1807              it++;
1808              nsamples++;
1809              xval[nsamples] = previousValue;
1810              yval[nsamples] = 0;
1811              nsamples++;
1812              if (nsamples > 50000)
1813              {
1814                  cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1815                  break;
1816              }
1817          }
1818          xval[nsamples] = it==waveletHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1819          yval[nsamples] = 0;
1820          nsamples++;
1821        //  if (nsamples > 5)
1822      #if QWT_VERSION < 0x060000
1823          startTimeMarkHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1824      #else
1825          startTimeMarkHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1826      #endif
1827*/
1828//END OF WAVELETS HACK
1829       //    startCellHistoZoom->setZoomBase(startCellHistoItem.boundingRect());
1830    QStack< QRectF > stack;
1831//    QRectF cRectangle = boardsTimeHistoItem.boundingRect();
1832    stack.push(scaleBoundingRectangle(boardsTimeHistoItem.boundingRect(), 1.05f));//cRectangle);//boardsTimeHistoItem.boundingRect());
1833    boardsTimeHistoZoom->setZoomStack(stack);
1834    stack.pop();
1835    stack.push(scaleBoundingRectangle(startCellHistoItem.boundingRect(), 1.05f));
1836    startCellHistoZoom->setZoomStack(stack);
1837    stack.pop();
1838    stack.push(scaleBoundingRectangle(startTimeMarkHistoItem.boundingRect(), 1.05f));
1839    startTimeMarkHistoZoom->setZoomStack(stack);
1840    stack.pop();
1841    stack.push(scaleBoundingRectangle(triggerDelayHistoItem.boundingRect(), 1.05f));
1842    triggerDelayHistoZoom->setZoomStack(stack);
1843    stack.pop();
1844
1845    pixelChanged(GLWindow->selectedPixel);
1846}
1847//can't use a ref to rectangle, as the type must be converted first
1848QRectF UIConnector::scaleBoundingRectangle(QRectF rectangle, float scale)
1849{
1850    QPointF bottomRight = rectangle.bottomRight();
1851    QPointF topLeft = rectangle.topLeft();
1852    QPointF center = rectangle.center();
1853    return QRectF(topLeft + (topLeft-center)*(scale-1.0f), //top left
1854                  bottomRight + (bottomRight-center)*(scale-1.0f)); //bottom right
1855}
1856void UIConnector::initHistograms()
1857{
1858//    QwtPlot*     boardsTimeHisto;
1859//    QwtPlotHistogram boardsTimeHistoItem;
1860    grid1 = new QwtPlotGrid;
1861    grid1->enableX(false);
1862    grid1->enableY(true);
1863    grid1->enableXMin(false);
1864    grid1->enableYMin(false);
1865    grid1->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1866    grid1->attach(boardsTimeHisto);
1867
1868    grid2 = new QwtPlotGrid;
1869    grid2->enableX(false);
1870    grid2->enableY(true);
1871    grid2->enableXMin(false);
1872    grid2->enableYMin(false);
1873    grid2->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1874    grid2->attach(startCellsHisto);
1875
1876    grid3 = new QwtPlotGrid;
1877    grid3->enableX(false);
1878    grid3->enableY(true);
1879    grid3->enableXMin(false);
1880    grid3->enableYMin(false);
1881    grid3->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1882    grid3->attach(startTimeMarkHisto);
1883
1884    grid4 = new QwtPlotGrid;
1885    grid4->enableX(false);
1886    grid4->enableY(true);
1887    grid4->enableXMin(false);
1888    grid4->enableYMin(false);
1889    grid4->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1890    grid4->attach(pixelValueCurve);
1891
1892    grid6 = new QwtPlotGrid;
1893    grid6->enableX(false);
1894    grid6->enableY(true);
1895    grid6->enableXMin(false);
1896    grid6->enableYMin(false);
1897    grid6->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1898    grid6->attach(pixelAverageCurve);
1899
1900    grid5 = new QwtPlotGrid;
1901    grid5->enableX(false);
1902    grid5->enableY(true);
1903    grid5->enableXMin(false);
1904    grid5->enableYMin(false);
1905    grid5->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1906    grid5->attach(triggerDelayHisto);
1907
1908    boardsTimeHisto->setAutoReplot(true);
1909    startCellsHisto->setAutoReplot(true);
1910    startTimeMarkHisto->setAutoReplot(true);
1911    pixelValueCurve->setAutoReplot(true);
1912    pixelAverageCurve->setAutoReplot(true);
1913    triggerDelayHisto->setAutoReplot(true);
1914    boardsTimeHisto->setTitle("Boards time values");
1915    startCellsHisto->setTitle("Start Cell values");
1916    startTimeMarkHisto->setTitle("Start Time Marks values");
1917    pixelValueCurve->setTitle("Current pixel values");
1918    pixelAverageCurve->setTitle("Average pixels values");
1919    triggerDelayHisto->setTitle("Trigger Delays");
1920
1921 //   boardsTimeHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1922//    startCellHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1923//    startTimeMarkHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1924//    triggerDelayHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1925//    pixelValueCurveItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1926
1927    boardsTimeHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1928    boardsTimeHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1929    startCellHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1930    startCellHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1931    startTimeMarkHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1932    startTimeMarkHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1933    triggerDelayHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1934    triggerDelayHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1935
1936    boardsTimeHistoItem.attach(boardsTimeHisto);
1937    startCellHistoItem.attach(startCellsHisto);
1938    startTimeMarkHistoItem.attach(startTimeMarkHisto);
1939    triggerDelayHistoItem.attach(triggerDelayHisto);
1940
1941    //curve
1942//    pixelValueCurveItem.setSymbol(new QwtSymbol(QwtSymbol::Cross, Qt::NoBrush, QPen(Qt::black), QSize(5,5)));
1943    pixelValueCurveItem.setPen(QColor(Qt::black));
1944    pixelAverageCurveItem.setPen(QColor(Qt::black));
1945    aMeanCurveItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1946    vCorrCurveItem.setPen(QColor(Qt::red));
1947    meanCurveItem.setPen(QColor(Qt::blue));
1948    pixelValueCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1949    pixelAverageCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1950    aMeanCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1951    vCorrCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1952    meanCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1953
1954//    pixelValueCurveItem.setCurveAttribute(QwtPlotCurve::Fitted);
1955    pixelValueCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1956    pixelAverageCurveItem.attach(pixelAverageCurve);
1957//    aMeanCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1958 //   vCorrCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1959//    meanCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1960
1961    //FIXME delete these pointers with the destructor
1962    curveZoom = new QwtPlotZoomer(pixelValueCurve->canvas());
1963    curveZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1964    curveZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1965    averageCurveZoom = new QwtPlotZoomer(pixelAverageCurve->canvas());
1966    averageCurveZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1967    averageCurveZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1968
1969    boardsTimeHistoZoom = new QwtPlotZoomer(boardsTimeHisto->canvas());
1970    boardsTimeHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1971    boardsTimeHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1972
1973    startCellHistoZoom = new QwtPlotZoomer(startCellsHisto->canvas());
1974    startCellHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1975    startCellHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1976
1977    startTimeMarkHistoZoom = new QwtPlotZoomer(startTimeMarkHisto->canvas());
1978    startTimeMarkHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1979    startTimeMarkHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1980
1981    triggerDelayHistoZoom = new QwtPlotZoomer(triggerDelayHisto->canvas());
1982    triggerDelayHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1983    triggerDelayHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1984
1985
1986}
1987
1988void UIConnector::pixelChanged(int pixel)
1989{
1990    RMS_window->fWhite = pixel;
1991    Mean_window->fWhite = pixel;
1992    Max_window->fWhite = pixel;
1993    PosOfMax_window->fWhite = pixel;
1994    if (pixel != -1)
1995    {
1996        RMS_window->fWhitePatch = RMS_window->pixelsPatch[pixel];
1997        Mean_window->fWhitePatch = Mean_window->pixelsPatch[pixel];
1998        Max_window->fWhitePatch = Max_window->pixelsPatch[pixel];
1999        PosOfMax_window->fWhitePatch = PosOfMax_window->pixelsPatch[pixel];
2000    }
2001    else
2002    {
2003        RMS_window->fWhitePatch = -1;
2004        Mean_window->fWhitePatch = -1;
2005        Max_window->fWhitePatch = -1;
2006        PosOfMax_window->fWhitePatch = -1;
2007    }
2008    if (pixel == -1)
2009        return;
2010    int softwarePix = pixel;
2011//    if (!GLWindow->_softwareOrdering)
2012        pixel = GLWindow->hardwareMapping[pixel];
2013
2014    HwIDBox->setValue(pixel);
2015
2016    if (!GLWindow->nRoi)
2017        return;
2018
2019int currentPixel = pixel;
2020
2021    for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2022    {
2023        xval[i] = i;
2024        yval[i] = GLWindow->eventData[GLWindow->nRoi*currentPixel + i];
2025    }
2026
2027
2028int realNumSamples = GLWindow->nRoi;
2029    if (GLWindow->nRoiTM != 0)
2030    {
2031        const PixelMapEntry& mapEntry = GLWindow->fPixelMap.index(softwarePix);
2032        const int pixelIdInPatch = mapEntry.pixel();
2033        const int patchId = mapEntry.patch();
2034        const int boardId = mapEntry.board();
2035        const int crateId = mapEntry.crate();
2036        if (pixelIdInPatch == 8)
2037        {
2038            int TMIndex = 0;
2039            int xIndex = GLWindow->nRoi;
2040            int arrayIndex = GLWindow->nRoi;
2041            if (GLWindow->offSetRoi < 0)
2042                TMIndex -= GLWindow->offSetRoi;
2043            if (GLWindow->offSetRoi > 0)
2044                xIndex += GLWindow->offSetRoi;
2045            for (int i=TMIndex;i<GLWindow->nRoiTM;i++, xIndex++, arrayIndex++)
2046            {
2047                xval[arrayIndex] = xIndex;
2048                yval[arrayIndex] = GLWindow->eventData[GLWindow->nRoi*1440 + GLWindow->nRoiTM*(40*crateId + 4*boardId + patchId) + i];
2049            }
2050            realNumSamples += GLWindow->nRoiTM - TMIndex;
2051        }
2052      //  cout << pixelIdInPatch << " " ;
2053    }
2054
2055#if QWT_VERSION < 0x060000
2056    pixelValueCurveItem.setData(xval, yval, realNumSamples);
2057#else
2058       pixelValueCurveItem.setSamples(xval, yval, realNumSamples);
2059#endif
2060
2061//now compute the average value of all pixels
2062       currentPixel = 0;
2063       for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2064           yval[i] = 0;
2065       for (int j=0;j<1440;j++) {
2066           currentPixel = j;
2067           for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2068           {
2069               xval[i] = i;
2070               yval[i] += GLWindow->eventData[GLWindow->nRoi*currentPixel + i];
2071           }
2072       }
2073       for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2074           yval[i] /= 1440;
2075#if QWT_VERSION < 0x060000
2076       pixelAverageCurveItem.setData(xval, yval, GLWindow->nRoi);
2077#else
2078    pixelAverageCurveItem.setSamples(xval, yval, realNumSamples);
2079#endif
2080
2081    QStack< QRectF > stack;
2082    stack.push(scaleBoundingRectangle(pixelValueCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2083    curveZoom->setZoomBase(scaleBoundingRectangle(pixelValueCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2084    curveZoom->setZoomStack(stack);
2085    stack.pop();
2086    stack.push(scaleBoundingRectangle(pixelAverageCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2087    averageCurveZoom->setZoomBase(scaleBoundingRectangle(pixelAverageCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2088    averageCurveZoom->setZoomStack(stack);
2089    stack.pop();
2090
2091    displaySliceValue();
2092    on_autoScaleColor_clicked();
2093}
2094
2095void UIConnector::on_HwIDBox_valueChanged(int)
2096{
2097    updating = true;
2098
2099    const int hwID = HwIDBox->value();
2100
2101    const int crateID =  hwID/360;
2102    const int boardID = (hwID%360)/36;
2103    const int patchID = (hwID%36 )/9;
2104    const int pixelID =  hwID%9;
2105
2106    SwIDBox->setValue(GLWindow->softwareMapping[hwID]);
2107
2108    crateIDBox->setValue(crateID);
2109    boardIDBox->setValue(boardID);
2110    patchIDBox->setValue(patchID);
2111    pixelIDBox->setValue(pixelID);
2112
2113    updating = false;
2114
2115    GLWindow->selectedPixel = GLWindow->softwareMapping[hwID];
2116    GLWindow->updateGL();
2117
2118    pixelChanged(GLWindow->selectedPixel);
2119}
2120
2121void UIConnector::cbpxChanged()
2122{
2123    if (updating)
2124        return;
2125
2126    const int hwid = crateIDBox->value()*360 + boardIDBox->value()*36 + patchIDBox->value()*9 + pixelIDBox->value();
2127    HwIDBox->setValue(hwid);
2128}
2129
2130void UIConnector::on_SwIDBox_valueChanged(int swid)
2131{
2132    if (updating)
2133        return;
2134
2135//    if (GLWindow->_softwareOrdering)
2136//        HwIDBox->setValue(swid);
2137//    else
2138        HwIDBox->setValue(GLWindow->hardwareMapping[swid]);
2139}
2140
2141void UIConnector::on_autoScaleColor_clicked()
2142{
2143    if (!autoScaleColor->isChecked())
2144    {
2145        GLWindow->ss[0] = 0.496;
2146        GLWindow->ss[1] = 0.507;
2147        GLWindow->ss[2] = 0.518;
2148        GLWindow->ss[3] = 0.529;
2149        GLWindow->ss[4] = 0.540;;
2150        colorRange0->setValue(GLWindow->ss[0]);
2151        colorRange1->setValue(GLWindow->ss[1]);
2152        colorRange2->setValue(GLWindow->ss[2]);
2153        colorRange3->setValue(GLWindow->ss[3]);
2154        colorRange4->setValue(GLWindow->ss[4]);
2155        return;
2156    }
2157    if (!GLWindow->nRoi)
2158        return;
2159
2160    int start = 0;
2161    int end   = 1440;
2162
2163    if (!entireCameraScale->isChecked())
2164    {
2165        start = GLWindow->selectedPixel;
2166        end   = GLWindow->selectedPixel+1;
2167        if (end == 0)
2168        {
2169            start = 0;
2170            end = 1440;
2171        }
2172    }
2173
2174    int min =  100000; //real min = -2048, int_16 = -32768 to 32767
2175    int max = -100000; //real max = 2047
2176
2177    long average = 0;
2178    long numSamples = 0;
2179    int errorDetected = -1;
2180
2181    for (int i=start;i<end;i++)
2182    {
2183        if (i==863)//keep crazy pixel out of the autoscale
2184            continue;
2185        for (int j=10;j<GLWindow->nRoi-50;j++)
2186        {
2187            int cValue = GLWindow->eventData[i*GLWindow->nRoi+j];
2188            if (cValue > max && cValue < 32767)
2189                max = cValue;
2190            if (cValue < min && cValue > -32768)
2191               min = cValue;
2192            if (cValue < 32767 && cValue > -32768)
2193            {
2194                average+=cValue;
2195                numSamples++;
2196            }
2197            else
2198            {
2199                errorDetected = i;
2200            }
2201//            numSamples++;
2202        }
2203    }
2204    average /= numSamples;
2205    if (errorDetected != -1)
2206    {
2207        cout << "Overflow detected at pixel " << errorDetected << " (at least)" << endl;
2208    }
2209//    cout << "min: " << min << " max: " << max << " average: " << average << endl;
2210    float minRange = (float)(min+(GLWindow->VALUES_SPAN/2))/(float)(GLWindow->VALUES_SPAN-1);
2211    float maxRange = (float)(max+(GLWindow->VALUES_SPAN/2))/(float)(GLWindow->VALUES_SPAN-1);
2212    float midRange = (float)(average+(GLWindow->VALUES_SPAN/2))/(float)(GLWindow->VALUES_SPAN-1);
2213    if (GLWindow->logScale)
2214    {
2215        minRange *= 9;
2216        maxRange *= 9;
2217//        midRange *= 9;
2218        minRange += 1;
2219        maxRange += 1;
2220//        midRange += 1;
2221        minRange = log10(minRange);
2222        maxRange = log10(maxRange);
2223//        midRange = (minRange + maxRange)/2.f;
2224        midRange = log10(midRange);
2225    }
2226
2227    GLWindow->ss[0] = minRange;
2228    colorRange0->setValue(GLWindow->ss[0]);
2229    GLWindow->ss[4] = maxRange;
2230    colorRange4->setValue(GLWindow->ss[4]);
2231//    GLWindow->ss[2] = midRange;
2232//    range2->setValue(GLWindow->ss[2]);
2233//    GLWindow->ss[1] = (minRange+midRange)/2;
2234//    range1->setValue(GLWindow->ss[1]);
2235//    GLWindow->ss[3] = (maxRange+midRange)/2;
2236//    range3->setValue(GLWindow->ss[3]);
2237
2238    GLWindow->ss[2] = (maxRange+minRange)/2;
2239    colorRange2->setValue(GLWindow->ss[2]);
2240
2241    GLWindow->ss[1] = minRange+(maxRange-minRange)/4;
2242    colorRange1->setValue(GLWindow->ss[1]);
2243
2244    GLWindow->ss[3] = minRange+3*(maxRange-minRange)/4;
2245    colorRange3->setValue(GLWindow->ss[3]);
2246}
2247
2248void PrintUsage()
2249{
2250    cout << "\n"
2251        "The FACT++ raw data viewer.\n"
2252        "\n"
2253        "Usage: viewer [OPTIONS] [datafile.fits[.gz|.fz] [calibration.drs.fits[.gz]]]\n"
2254        "  or:  viewer [OPTIONS]\n";
2255    cout << endl;
2256
2257}
2258
2259void PrintHelp()
2260{
2261    cout <<
2262            "\n"
2263         << endl;
2264}
2265
2266int UIConnector::SetupConfiguration(Configuration &conf)
2267{
2268    RawDataViewer *canvas = GLWindow;
2269
2270    if (conf.Has("mappingFile"))
2271    {
2272        canvas->assignPixelMapFile(conf.Get<string>("mappingFile"));
2273    }
2274    else
2275        canvas->assignPixelMapFile("");
2276
2277    if (!canvas->isFACT())
2278    {
2279        HwIDBox->setMaximum(71);
2280        SwIDBox->setMaximum(71);
2281        SwIDBox->setValue(0);
2282        HwIDBox->setValue(19);
2283        crateIDBox->setMaximum(0);
2284        crateIDBox->setEnabled(false);
2285        boardIDBox->setMaximum(1);
2286    }
2287
2288    if (conf.Has("color.range"))
2289    {
2290        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.range");
2291        if (value.size() != 5)
2292        {
2293            cout << "Error, colorRange option should have exactly 5 double values" << endl;
2294            return -1;
2295        }
2296        for (int i=0;i<5;i++)
2297            canvas->ss[i] = value[i];
2298    }
2299
2300    if (conf.Has("color.red"))
2301    {
2302        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.red");
2303        if (value.size() != 5)
2304        {
2305            cout << "Error, colorRed option should have exactly 5 double values" << endl;
2306            return -1;
2307        }
2308        for (int i=0;i<5;i++)
2309            canvas->rr[i] = value[i];
2310    }
2311
2312    if (conf.Has("color.green"))
2313    {
2314        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.green");
2315        if (value.size() != 5)
2316        {
2317            cout << "Error, colorGreen option should have exactly 5 double values" << endl;
2318            return -1;
2319        }
2320        for (int i=0;i<5;i++)
2321            canvas->gg[i] = value[i];
2322    }
2323
2324    if (conf.Has("color.blue"))
2325    {
2326        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.blue");
2327        if (value.size() != 5)
2328        {
2329            cout << "Error, colorBlue option should have exactly 5 double values" << endl;
2330            return -1;
2331        }
2332        for (int i=0;i<5;i++)
2333            canvas->bb[i] = value[i];
2334    }
2335
2336    colorRange0->setValue(canvas->ss[0]);
2337    colorRange1->setValue(canvas->ss[1]);
2338    colorRange2->setValue(canvas->ss[2]);
2339    colorRange3->setValue(canvas->ss[3]);
2340    colorRange4->setValue(canvas->ss[4]);
2341    redValue0->setValue(canvas->rr[0]);
2342    redValue1->setValue(canvas->rr[1]);
2343    redValue2->setValue(canvas->rr[2]);
2344    redValue3->setValue(canvas->rr[3]);
2345    redValue4->setValue(canvas->rr[4]);
2346    greenValue0->setValue(canvas->gg[0]);
2347    greenValue1->setValue(canvas->gg[1]);
2348    greenValue2->setValue(canvas->gg[2]);
2349    greenValue3->setValue(canvas->gg[3]);
2350    greenValue4->setValue(canvas->gg[4]);
2351    blueValue0->setValue(canvas->bb[0]);
2352    blueValue1->setValue(canvas->bb[1]);
2353    blueValue2->setValue(canvas->bb[2]);
2354    blueValue3->setValue(canvas->bb[3]);
2355    blueValue4->setValue(canvas->bb[4]);
2356
2357    if (conf.Has("drs"))
2358    {
2359        const QString qstr(conf.Get<string>("drs").c_str());
2360        calibFileSelected(qstr);
2361    }
2362
2363    if (conf.Has("file"))
2364    {
2365        const QString qstr(conf.Get<string>("file").c_str());
2366        fileSelected(qstr);
2367    }
2368
2369
2370    return 0;
2371}
2372
2373void SetupConfiguration(Configuration& conf)
2374{
2375    po::options_description configs("Raw Events Viewer Options");
2376    configs.add_options()
2377        ("color.range", vars<double>(), "Range of the display colours")
2378        ("color.red",   vars<double>(), "Range of red values")
2379        ("color.green", vars<double>(), "Range of green values")
2380        ("color.blue",  vars<double>(), "Range of blue values")
2381        ("file,f",      var<string>(),  "File to be loaded")
2382        ("drs,d",       var<string>(),  "DRS calibration file to be loaded")
2383        ("mappingFile", var<string>(),  "Which pixels mapping file to use")
2384        ;
2385    conf.AddOptions(configs);
2386
2387    po::positional_options_description p;
2388    p.add("file", 1); // The first positional options
2389    p.add("drs",  2); // The first positional options
2390    conf.SetArgumentPositions(p);
2391
2392}
2393
2394/************************************************************
2395 * MAIN PROGRAM FUNCTION.
2396 ************************************************************/
2397int main(int argc, const char *argv[])
2398{
2399    QApplication app(argc, const_cast<char**>(argv));
2400
2401    if (!QGLFormat::hasOpenGL()) {
2402        std::cerr << "This system has no OpenGL support" << std::endl;
2403        return 1;
2404    }
2405
2406    Configuration conf(argv[0]);
2407    conf.SetPrintUsage(PrintUsage);
2408    SetupConfiguration(conf);
2409    if (!conf.DoParse(argc, argv, PrintHelp))
2410        return 2;
2411
2412    UIConnector myUi;
2413    if (myUi.SetupConfiguration(conf)<0)
2414        return 3;
2415
2416    return app.exec();
2417}
2418
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.