source: trunk/FACT++/gui/RawEventsViewer/RawEventsViewer.cc @ 19373

Last change on this file since 19373 was 19373, checked in by tbretz, 5 months ago
On the way to make it more maintanance friendly. Fixed a bug (some roi were roiTM)
File size: 77.0 KB
Line 
1/*
2 * QtGl.cpp
3 *
4 *  Created on: Jul 19, 2011
5 *      Author: lyard
6 *
7 ******
8 */
9#include <math.h>
10#include <fstream>
11
12#include <boost/date_time/local_time/local_time.hpp>
13
14#include "RawEventsViewer.h"
15
16#include <QFileDialog>
17#include <QMouseEvent>
18
19#include <qwt_symbol.h>
20#include <qwt_plot_grid.h>
21#pragma GCC diagnostic push
22#pragma GCC diagnostic ignored "-Woverloaded-virtual"
23#include <qwt_plot_zoomer.h>
24#pragma GCC diagnostic pop
25
26#include "src/Configuration.h"
27#include "externals/factfits.h"
28
29
30using namespace std;
31
32#undef ACTUAL_NUM_PIXELS
33#define ACTUAL_NUM_PIXELS 1440
34
35//bounding box for diplaying the impulse curve
36float bboxMin[2] = {-0.8,-0.9};
37float bboxMax[2] = {0.8,-0.3};
38/************************************************************
39 * CALC BLUR COLOR if in blur display mode, calculate the interpolated
40 * colour for a given vertex
41 ************************************************************/
42void RawDataViewer::calcBlurColor(int pixel,  int vertex)
43{
44    GLfloat color[3];
45    int first, second;
46    first = vertex-1;
47    second = vertex;
48    if (first < 0)
49        first = 5;
50
51    first = neighbors[pixel][first];
52    second = neighbors[pixel][second];
53//    cout << pixel << " " << vertex << " " << "first: " << first << " second: " << second << endl;
54    for (int i=0;i<3;i++)
55        color[i] = pixelsColor[pixel][i];
56    float divide = 1;
57    if (first != -1)
58    {
59        divide++;
60        for (int i=0;i<3;i++)
61            color[i] += pixelsColor[first][i];
62    }
63    if (second != -1)
64    {
65        divide++;
66        for (int i=0;i<3;i++)
67            color[i] += pixelsColor[second][i];
68    }
69    for (int i=0;i<3;i++)
70        color[i] /= divide;
71
72//    cout << color[0] << " " << color[1] << " " << color[2] << endl;
73
74    glColor3fv(color);
75}
76void RawDataViewer::calcMidBlurColor(int pixel, int vertex)
77{
78    GLfloat color[3];
79    int first;
80    first = vertex-1;
81    if (first < 0)
82        first = 5;
83    first = neighbors[pixel][first];
84    for (int i=0;i<3;i++)
85        color[i] = pixelsColor[pixel][i];
86    float divide = 1;
87    if (first != -1)
88    {
89        divide++;
90        for (int i=0;i<3;i++)
91            color[i] += pixelsColor[first][i];
92    }
93    for (int i=0;i<3;i++)
94        color[i] /= divide;
95    glColor3fv(color);
96}
97/************************************************************
98 * DRAW BLURRY HEXAGON. draws a solid hexagon, with interpolated colours
99 ************************************************************/
100void RawDataViewer::drawBlurryHexagon(int index)
101{
102
103//per-pixel mesh
104    GLfloat color[3];
105    for (int i=0;i<3;i++)
106        color[i] = pixelsColor[index][i];
107    glBegin(GL_TRIANGLES);
108    calcBlurColor(index, 0);
109    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][0]]);
110    glColor3fv(color);
111    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
112
113    calcBlurColor(index, 1);
114    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][1]]);
115
116    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][1]]);
117    glColor3fv(color);
118    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
119
120    calcBlurColor(index, 2);
121    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][2]]);
122
123    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][2]]);
124    glColor3fv(color);
125    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
126
127    calcBlurColor(index, 3);
128    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][3]]);
129
130    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][3]]);
131    glColor3fv(color);
132    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
133
134    calcBlurColor(index, 4);
135    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][4]]);
136
137    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][4]]);
138    glColor3fv(color);
139    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
140
141    calcBlurColor(index, 5);
142    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][5]]);
143
144    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][5]]);
145    glColor3fv(color);
146    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
147
148    calcBlurColor(index, 0);
149    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][0]]);
150    glEnd();
151
152    return;
153}
154
155/************************************************************
156 * DRAW CAMERA draws all the camera pixels
157 ************************************************************/
158void RawDataViewer::drawCamera(bool alsoWire)
159{
160    glLoadIdentity();
161    if (!drawImpulse)
162    {
163        glTranslatef(0,-0.44,0);
164        glRotatef(cameraRotation, 0,0,-1);
165        if (cameraRotation == 90)
166        {
167            glTranslatef(-0.45,-0.45,0);
168        }
169        if (cameraRotation == -90)
170        {
171            glTranslatef(0.45,-0.45,0);
172        }
173        glScalef(1.5,1.5,1);
174    }
175    else
176    {
177        glRotatef(cameraRotation, 0,0,-1);
178          if (cameraRotation == 90)
179        {
180            glTranslatef(-0.45/1.5,-0.45/1.5,0);
181        }
182        if (cameraRotation == -90)
183        {
184            glTranslatef(0.45/1.5,-0.45/1.5,0);
185        }
186  }
187    glColor3f(0.5,0.5,0.5);
188    glLineWidth(1.0);
189    float color;
190
191    for (int i=0;i<ACTUAL_NUM_PIXELS;i++)
192    {
193        if (!nRoi)
194          color = (float)(i)/(float)(ACTUAL_NUM_PIXELS);
195        else
196
197//        if (_softwareOrdering)
198//            color = float(eventData[nRoi*i + whichSlice] + (VALUES_SPAN/2))/(float)(VALUES_SPAN-1);
199//        else
200            color = float(eventData[nRoi*hardwareMapping[i] + whichSlice]+(VALUES_SPAN/2))/(float)(VALUES_SPAN-1);
201        if (logScale)
202        {
203            color *= 9;
204            color += 1;
205            color = log10(color);
206        }
207
208        if (color < ss[0])
209        {
210            pixelsColor[i][0] = tooLowValueCoulour[0];
211            pixelsColor[i][1] = tooLowValueCoulour[1];
212            pixelsColor[i][2] = tooLowValueCoulour[2];
213            continue;
214        }
215        if (color > ss[4])
216        {
217            pixelsColor[i][0] = tooHighValueCoulour[0];
218            pixelsColor[i][1] = tooHighValueCoulour[1];
219            pixelsColor[i][2] = tooHighValueCoulour[2];
220            continue;
221        }
222        int index = 0;
223        while (ss[index] < color && index < 4)
224            index++;
225        index--;
226        if (index < 0) index = 0;
227        float weight0 = (color-ss[index]) / (ss[index+1]-ss[index]);
228        if (weight0 > 1.0f) weight0 = 1.0f;
229        if (weight0 < 0.0f) weight0 = 0.0f;
230        float weight1 = 1.0f-weight0;
231        pixelsColor[i][0] = weight1*rr[index] + weight0*rr[index+1];
232        pixelsColor[i][1] = weight1*gg[index] + weight0*gg[index+1];
233        pixelsColor[i][2] = weight1*bb[index] + weight0*bb[index+1];
234    }
235
236    for (int i=0;i<ACTUAL_NUM_PIXELS;i++)
237    {
238
239        glColor3fv(pixelsColor[i]);
240        glLoadName(i);
241if (drawBlur)
242    drawBlurryHexagon(i);
243else
244    drawHexagon(i,true);
245
246    }
247    if (!alsoWire)
248        return;
249    glTranslatef(0,0,0.1f);
250    glColor3f(0.0f,0.0f,0.0f);
251    for (int i=0;i<ACTUAL_NUM_PIXELS;i++)
252    {
253
254        drawHexagon(i, false);
255    }
256
257}
258
259/************************************************************
260 * DRAW PIXEL CURVE. draws the raw impulse curve of the currently selected pixel
261 ************************************************************/
262void RawDataViewer::drawPixelCurve()
263{
264    float xRange = bboxMax[0] - bboxMin[0];
265    float yRange = bboxMax[1] - bboxMin[1];
266
267    glBegin(GL_LINES);
268    glLineWidth(1.0f);
269    glColor3f(0.0,0.0,0.0);
270    glVertex2f(bboxMin[0], bboxMin[1]);
271    glVertex2f(bboxMax[0], bboxMin[1]);
272    glVertex2f(bboxMin[0], bboxMin[1]);
273    glVertex2f(bboxMin[0], bboxMax[1]);
274    glVertex2f(bboxMin[0], (bboxMin[1]+bboxMax[1])/2.0f);
275    glVertex2f(bboxMax[0], (bboxMin[1]+bboxMax[1])/2.0f);
276    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*nRoi/(float)(nRoi+nRoiTM),
277               bboxMin[1]);
278    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*nRoi/(float)(nRoi+nRoiTM),
279               bboxMax[1]);
280   glEnd();
281    glTranslatef(0,0,0.1f);
282    if (!nRoi)
283          return;
284     glBegin(GL_LINES);
285    glColor3f(1.0f,1.0f,0.0f);
286    float divideMe = (float)(VALUES_SPAN-1);
287    float plusMe = (float)(VALUES_SPAN)/2;
288    if (divideMe <= 0)
289        divideMe = 1;
290
291    /*
292    if (drawCalibrationLoaded)
293        plusMe += 0;//VALUES_SPAN/2;
294    if (drawCalibrationLoaded && calibrationLoaded)
295    {
296        divideMe /=2;
297        plusMe = 0 ;///=2;
298        }*/
299
300//    int mapping = _softwareOrdering ? selectedPixel : hardwareMapping[selectedPixel];
301    int mapping = hardwareMapping[selectedPixel];
302    const int hw = mapping;
303    const PixelMapEntry& mapEntry = fPixelMap.index(selectedPixel);
304    const int pixelIdInPatch = mapEntry.pixel();
305    const int patchId = mapEntry.patch();
306    const int boardId = mapEntry.board();
307    const int crateId = mapEntry.crate();
308
309    if (selectedPixel != -1)
310    {
311    for (int i=0;i<nRoi-1;i++)
312    {
313        float d1 = eventData[nRoi*hw + i]+plusMe;
314        float d2 = eventData[nRoi*hw + i+1]+plusMe;
315        if (!finite(d1)) d1 = 20000;
316        if (!finite(d2)) d2 = 20000;
317        glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*i/(float)(nRoi+nRoiTM),
318                   bboxMin[1] + yRange*(d1) /divideMe);
319        glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*(i+1)/(float)(nRoi+nRoiTM),
320                   bboxMin[1] + yRange*(d2) /divideMe);
321    }
322    glEnd();
323
324    glColor3f(0.0f, 1.0f, 1.0f);
325    glBegin(GL_LINES);
326    if (pixelIdInPatch == 8)//this channel has a time marker
327    {
328
329        for (int i=0;i<nRoiTM-1;i++)
330        {
331            float d1 = eventData[nRoi*1440 + nRoiTM*(40*crateId + 4*boardId + patchId) + i] + plusMe;
332            float d2 = eventData[nRoi*1440 + nRoiTM*(40*crateId + 4*boardId + patchId) + i+1] + plusMe;
333            if (!finite(d1)) d1 = 20000;
334            if (!finite(d2)) d2 = 20000;
335            glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*(i+nRoi)/(float)(nRoi+nRoiTM),
336                       bboxMin[1] + yRange*(d1)/divideMe);
337            glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*(i+1+nRoi)/(float)(nRoi+nRoiTM),
338                       bboxMin[1] + yRange*(d2) / divideMe);
339        }
340    }
341
342    }
343    glEnd();
344    glTranslatef(0,0,0.1f);
345    glBegin(GL_LINES);
346    glColor3f(1.0,0.0,0.0);
347    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*whichSlice/(float)(nRoi+nRoiTM),
348               bboxMin[1]);
349    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*whichSlice/(float)(nRoi+nRoiTM),
350               bboxMax[1]);
351
352    glEnd();
353
354}
355/************************************************************
356 * CONSTRUCTOR.
357 ************************************************************/
358RawDataViewer::RawDataViewer(QWidget *cParent) : BasicGlCamera(cParent), RMSvalues(1440), Meanvalues(1440), Maxvalues(1440), PosOfMaxvalues(1440), VALUES_SPAN(4096)
359
360{
361
362    whichSlice = 0;
363
364    nRoi = 0;
365    nRoiTM = 0;
366    offSetRoi = 0;
367    eventNum = 0;
368    rowNum = -1;
369    eventStep = 1;
370    selectedPixel = 393;
371    inputFile = NULL;
372    drawPatch = false;
373    drawImpulse = true;
374    drawBlur = false;
375    loopCurrentEvent = false;
376    fIsDrsCalibration = false;
377    SetAutoRefresh(true);
378    runType = "unkown";
379
380
381}
382
383void RawDataViewer::assignPixelMapFile(const string& map)
384{
385    PixelMap mypMap;
386    if (map.empty())
387    {
388        if (!mypMap.Read("FACTmap111030.txt"))
389        {
390            if (!mypMap.Read("/swdev_nfs/FACT++/FACTmap111030.txt"))
391            {
392                if (!mypMap.Read("./FACTmap111030.txt"))
393                {
394                    cerr << "ERROR - Problems reading FACTmap111030.txt" << endl;
395                    exit(-1);
396                }
397            }
398        }
399    }
400    else
401    {
402        if (!mypMap.Read(map))
403        {
404            cerr << "ERROR - Problems reading mapping file '" << map << "'" << endl;
405            exit(-1);
406        }
407    }
408
409    assignPixelMap(mypMap);
410
411    for (int i=0;i<160;i++)
412    {
413        const float color[3] = { 0.5, 0.5, 0.3 };
414
415        for (int j=0;j<3;j++)
416            patchesColor[i][j] = color[j];
417    }
418    fZeroArray = NULL;
419
420    _softwareOrdering = false;
421}
422/************************************************************
423 *  DESTRUCTOR
424 ************************************************************/
425RawDataViewer::~RawDataViewer()
426{
427    if (inputFile != NULL)
428    {
429        inputFile->close();
430        delete inputFile;
431    }
432    if (fZeroArray != NULL)
433        delete[] fZeroArray;
434}
435void RawDataViewer::allocateZeroArray()
436{
437    if (fZeroArray == NULL)
438    {
439        fZeroArray = new char[8192];
440    }
441}
442/************************************************************
443 * PAINT GL. main drawing function.
444 ************************************************************/
445void RawDataViewer::paintGL()
446{
447    //Should not be required, but apparently it helps when piping it through X forwarding
448    glFinish();
449    glClear(GL_COLOR_BUFFER_BIT | GL_DEPTH_BUFFER_BIT);
450    glLoadIdentity();
451
452    glTranslatef(0,0,-0.5);
453
454    if (drawBlur)
455    {
456        glShadeModel(GL_SMOOTH);
457        drawCamera(false);
458    }
459    else
460    {
461        glShadeModel(GL_FLAT);
462        drawCamera(true);
463    }
464    glTranslatef(0,0,0.1f);
465    if (drawPatch)
466        drawPatches();
467    glTranslatef(0,0,0.1f);
468   if (!drawBlur && (selectedPixel != -1))
469   {
470        glLineWidth(1.0f);
471        glColor3f(1.0,1.0,1.0);
472        drawHexagon(selectedPixel, false);
473   }
474   glTranslatef(0,0,0.1f);
475   if (drawImpulse)
476   {
477    //   glRotatef(cameraRotation, 0,0,1);
478       glLoadIdentity();
479       glLineWidth(2.0);
480       drawPixelCurve();
481   }
482   glTranslatef(0,0,0.1f);
483   DrawScale();
484}
485
486/************************************************************
487 * MOUSE PRESS EVENT. mouse click handler.
488 ************************************************************/
489void RawDataViewer::mousePressEvent(QMouseEvent *cEvent)
490{
491    if (cEvent->pos().x() > width()-(width()/50.f))
492    {
493        toggleInterfaceDisplay();
494        return;
495    }
496    lastPos = cEvent->pos();
497    if (setCorrectSlice(cEvent))
498        return;
499    int face = PixelAtPosition(cEvent->pos());
500
501        selectedPixel = face;
502        emit signalCurrentPixel(face);
503
504    updateGL();
505}
506
507/************************************************************
508 * SET CORRECT SLICE. if displayed, figures out if the graph was
509 * clicked, and if so, which slice should be displayed
510 ************************************************************/
511bool RawDataViewer::setCorrectSlice(QMouseEvent* cEvent)
512{
513    if (!drawImpulse)
514        return false;
515    float cx = (float)cEvent->x() * pixelSize - shownSizex/2;
516    float cy = ((float)height()-(float)cEvent->y())*pixelSize - shownSizey/2;
517    if (cx < bboxMin[0] ||
518        cx > bboxMax[0] ||
519        cy < bboxMin[1] ||
520        cy > bboxMax[1])
521        return false;
522    whichSlice = (cx - bboxMin[0])*(nRoi+nRoiTM)/(bboxMax[0] - bboxMin[0]);
523    if (whichSlice >= nRoi)
524        whichSlice = nRoi-1;
525    emit signalCurrentSlice(whichSlice);
526    return true;
527}
528
529/************************************************************
530 * MOUSE MOVE EVENT. used to track the dragging of slices display
531 ************************************************************/
532void RawDataViewer::mouseMoveEvent(QMouseEvent *cEvent)
533{
534    if (cEvent->buttons() & Qt::LeftButton) {
535        setCorrectSlice(cEvent);
536        updateGL();
537    } else if (cEvent->buttons() & Qt::RightButton) {
538        updateGL();
539    }
540    lastPos = cEvent->pos();
541}
542
543/************************************************************
544 * MOUSE DOUBLE CLICK EVENT. used to select pixels
545 ************************************************************/
546void RawDataViewer::mouseDoubleClickEvent(QMouseEvent *cEvent)
547{
548    int face = PixelAtPosition(cEvent->pos());
549    if (face != -1) {
550        selectedPixel = face;
551        emit signalCurrentPixel(face);
552        updateGL();
553        }
554}
555
556/************************************************************
557 * OPEN FILE. opens a new fits file
558 ************************************************************/
559void RawDataViewer::openFile(string file, bool reopen)
560{
561    if (inputFile)
562    {
563        inputFile->close();
564        delete inputFile;
565    }
566    try {
567        inputFile = reopen && fIsDrsCalibration ? new zfits(file, "Events") :  new factfits(file, "Events");
568    }
569    catch (std::runtime_error e)
570    {
571        cout << "Something went wrong while loading fits. Aborting: " << e.what() << endl;
572        return;
573    }
574    if (!*inputFile)
575    {
576        delete inputFile;
577        inputFile = NULL;
578        return;
579    }
580    vector<string> entriesToCheck;
581    if (inputFile->IsCompressedFITS())
582        entriesToCheck.push_back("ZNAXIS2");
583    else
584        entriesToCheck.push_back("NAXIS2");
585    entriesToCheck.push_back("NROI");
586    entriesToCheck.push_back("REVISION");
587    entriesToCheck.push_back("RUNID");
588    entriesToCheck.push_back("NBOARD");
589    entriesToCheck.push_back("NPIX");
590    entriesToCheck.push_back("NROITM");
591    entriesToCheck.push_back("TIMESYS");
592    entriesToCheck.push_back("DATE");
593    entriesToCheck.push_back("NIGHT");
594    entriesToCheck.push_back("CAMERA");
595    entriesToCheck.push_back("DAQ");
596    entriesToCheck.push_back("TSTART");
597    entriesToCheck.push_back("TSTOP");
598
599
600    for (vector<string>::const_iterator it=entriesToCheck.begin(); it != entriesToCheck.end(); it++)
601    {
602        try {
603        if (!inputFile->HasKey(*it)){
604            cout << "Warning: header keyword " << *it << " missing." << endl;
605            }
606        }
607        catch (std::runtime_error e)
608        {
609            cout << e.what() << endl;
610            return;
611        }
612    }
613
614    nRows = 0;
615    if (inputFile->IsCompressedFITS())
616        nRows = inputFile->HasKey("ZNAXIS2") ? inputFile->GetInt("ZNAXIS2") : 0;
617    else
618        nRows = inputFile->HasKey("NAXIS2") ? inputFile->GetInt("NAXIS2") : 0;
619    nRoi =           inputFile->HasKey("NROI") ?  inputFile->GetInt("NROI") : 0;
620    runNumber =      inputFile->HasKey("RUNID") ?  inputFile->GetInt("RUNID") : -1;
621    nTM =            inputFile->HasKey("NTMARK") ? inputFile->GetInt("NTMARK") : 0;
622
623    runType = "unkown";
624    if (inputFile->HasKey("RUNTYPE"))
625    {
626        runType = inputFile->GetStr("RUNTYPE");
627        if (runType == "")
628            runType = "unkown";
629    }
630    firstDataTime =  inputFile->HasKey("TSTART") ? inputFile->GetInt("TSTART") : -1;
631    lastDataTime =   inputFile->HasKey("TSTOP") ? inputFile->GetInt("TSTOP"): -1;
632    nRoiTM =         inputFile->HasKey("NROITM") ? inputFile->GetInt("NROITM") : 0;
633    revision =       inputFile->HasKey("REVISION") ? inputFile->GetInt("REVISION") : -1;
634    builderVersion = inputFile->HasKey("BLDVER") ? inputFile->GetInt("BLDVER") : -1;
635    nBoards =        inputFile->HasKey("NBOARD") ? inputFile->GetInt("NBOARD") : 0;
636    nPixels =        inputFile->HasKey("NPIX") ?  inputFile->GetInt("NPIX") : 0;
637    timeSystem =     inputFile->HasKey("TIMESYS") ? inputFile->GetStr("TIMESYS") : "";
638    creationDate =   inputFile->HasKey("DATE") ? inputFile->GetStr("DATE") : "";
639    nightInt =       inputFile->HasKey("NIGHT") ? inputFile->GetInt("NIGHT") : 0;
640    camera =         inputFile->HasKey("CAMERA") ? inputFile->GetStr("CAMERA") : "";
641    daq =            inputFile->HasKey("DAQ") ? inputFile->GetStr("DAQ") : "";
642    adcCount =       inputFile->HasKey("ADCRANGE") ? inputFile->GetFloat("ADCRANGE") : 2000;
643    if (nPixels == 0)
644    {
645        cout << "could not read num pixels from fits header. Assuming 1440 (FACT)." << endl;
646        nPixels = 1440;
647    }
648    if (nRoi == 0 && !inputFile->HasKey("NROI"))
649    {//let's try to figure out the roi from the column's format
650        const fits::Table::Columns& cols = inputFile->GetColumns();
651        if (cols.find("Data") == cols.end())
652        {
653            cout << "ERROR: Column \"Data\" could not be found. abortin load." << endl;
654            return;
655        }
656        const fits::Table::Columns::const_iterator col = cols.find("Data");
657        if (col->second.type != 'I')
658        {
659            cout << "ERROR: Data Column has type " << col->second.type << " while viewer expects I" << endl;
660            return;
661        }
662        if (col->second.num % nPixels != 0)
663        {
664            cout << "ERROR: Num pixels (" << nPixels << ") does not match Data length (" << col->second.num << "). Aborting" << endl;
665            return;
666        }
667        nRoi = col->second.num/nPixels;
668        cout << "Estimate num samples per pixels to be " << nRoi;
669        _softwareOrdering = true;
670    }
671    else
672        _softwareOrdering = inputFile->Get<string>("ISMC", "F")=="T";
673
674    if (inputFile->HasKey("OFFSET"))
675        offSetRoi = inputFile->GetInt("OFFSET");
676
677    nbOk = 0;//inputFile->GetInt("NBEVTOK");
678    nbRej = 0;//inputFile->GetInt("NBEVTREJ");
679    nbBad = 0;//inputFile->GetInt("NBEVTBAD");
680
681    eventNum = 1;
682
683    eventData.resize(1440*nRoi + 160*nRoiTM);
684    rawEventData.resize(1440*nRoi + 160*nRoiTM);
685    waveLetArray.resize(1024*1440);
686    try
687    {
688        inputFile->SetPtrAddress("Data", rawEventData.data());
689        if (inputFile->HasColumn("EventNum"))
690            inputFile->SetPtrAddress("EventNum", &eventNum);
691        else
692            cout << "Warning: could not find column \"EventNum\"" << endl;
693        if (inputFile->HasColumn("TriggerType"))
694            inputFile->SetPtrAddress("TriggerType", &triggerType);
695        else
696            cout << "Warning: could not find column \"TriggerType\"" << endl;
697        if (inputFile->HasColumn("SoftTrig"))
698            inputFile->SetPtrAddress("SoftTrig", &softTrig);
699        else
700            cout << "Warning: could not find column \"SoftTrig\"" << endl;
701        if (inputFile->HasColumn("BoardTime"))
702            inputFile->SetPtrAddress("BoardTime", boardTime);
703        else
704            cout << "Warning: could not find column \"BoardTime\"" << endl;
705        if (inputFile->HasColumn("StartCellData"))
706            inputFile->SetPtrAddress("StartCellData", startPix);
707        else
708            cout << "Warning: could not find column \"StartCellData\"" << endl;
709        if (inputFile->HasColumn("StartCellTimeMarker"))
710            inputFile->SetPtrAddress("StartCellTimeMarker", startTM);
711        else
712            cout << "Warning: could not find column \"StartCellTimeMarker\"" << endl;
713        if (inputFile->HasColumn("TimeMarker"))
714            inputFile->SetPtrAddress("TimeMarker", rawEventData.data()+1440*nRoi);
715        else
716            cout << "Warning: could not find column \"TimeMarker\"" << endl;
717    }
718    catch (const runtime_error &e)
719    {
720        cout << e.what() << endl;
721        cout << "Loading aborted." << endl;
722
723        nRoi = nRows = 0;
724
725        return;
726    }
727
728    try
729    {
730        pcTime[0] = pcTime[1] = 0;
731        if (inputFile->HasColumn("UnixTimeUTC"))
732            inputFile->SetPtrAddress("UnixTimeUTC", pcTime);
733    }
734    catch (const runtime_error&)
735    {
736            try
737        {
738            if (inputFile->HasColumn("PCTime"))
739                inputFile->SetPtrAddress("PCTime", pcTime);
740            else
741                cout << "Warning: could not find column \"UnixTimeUTC\" nor \"PCTime\"" << endl;
742
743        }
744        catch (const runtime_error&)
745        {
746
747        }
748    }
749
750
751    if (!reopen)
752    {
753        int backupStep = eventStep;
754        rowNum = -1;
755        eventStep = 1;
756        plusEvent();
757        eventStep = backupStep;
758    }
759    else
760        readEvent();
761
762    emit newFileLoaded();
763    emit signalCurrentPixel(selectedPixel);
764}
765
766void RawDataViewer::openCalibFile(string& file)
767{
768    //calibrationLoaded = false;
769    string msg;
770    try
771    {
772        msg = fDrsCalib.ReadFitsImp(file);
773        if (msg.empty())
774        {
775            emit newFileLoaded();
776            updateGL();
777            return;
778        }
779    }
780    catch (const runtime_error &e)
781    {
782        msg = string("Something went wrong while loading Drs Calib: ") + e.what() + string(".. Aborting file loading");
783    }
784    cerr << msg << endl;
785    fDrsCalib.Clear();
786}
787
788template <typename T>
789void RawDataViewer::getCalibrationDataForDisplay(const CalibDataTypes/* calibTypes*/,
790                                                 const vector<T>& inputData,
791                                                 const int roi,
792                                                 const int roiTM)
793{
794    eventData.assign(inputData.begin(), inputData.end());
795    nRoi=roi;
796    nRoiTM=roiTM;
797
798    long long min, max, mean;
799    min = max = inputData[0];
800    mean=0;
801    for (int i=0;i<1440*roi + 160*roiTM;i++) {
802        mean += inputData[i];
803        if (inputData[i] > max)
804            max = inputData[i];
805        if (inputData[i] < min)
806            min = inputData[i];
807    }
808    mean /= 1440*roi + 160*roiTM;
809    for (int i=0;i<1440*roi + 160*roiTM;i++)
810        eventData[i] -= (float)mean;
811    VALUES_SPAN = max - min;
812//    cout << VALUES_SPAN << " " << min << " " << max << " " << mean << endl;
813//    cout << 1440*roi + 160*roiTM << " " << roi << " " << roiTM << " " << inputData.size() << endl;
814}
815/************************************************************
816 * PLUS EVENT
817 ************************************************************/
818void RawDataViewer::plusEvent()
819{
820    eventStepping(true);
821}
822/************************************************************
823 * MINUS EVENT
824 ************************************************************/
825void RawDataViewer::minusEvent()
826{
827    eventStepping(false);
828}
829/************************************************************
830 * SET EVENT STEP
831 ************************************************************/
832void RawDataViewer::setEventStep(int step)
833{
834    eventStep = step;
835}
836/************************************************************
837 * EVENT STEPPING
838 ************************************************************/
839
840void RawDataViewer::ApplyCalibration()
841{
842    eventData.assign(rawEventData.begin(), rawEventData.end());
843
844    if (fIsDrsCalibration)
845    {
846        fDrsCalib.Apply(eventData.data(), rawEventData.data(), startPix, nRoi);
847        DrsCalibrate::RemoveSpikes(eventData.data(), nRoi);
848        //TODO apply calibration to the Time markers
849    }
850
851    //hide the time markers
852    int nSlicesToRemove = 60;
853    float* backupData = 0;
854    if (nRoiTM == 0) //they are written into the regular channel
855    {
856        backupData = new float[nSlicesToRemove*160];
857        for (int i=0;i<1440;i++)
858        {
859            const PixelMapEntry& mapEntry = fPixelMap.index(i);
860            const int pixelIdInPatch = mapEntry.pixel();
861            const int patchId = mapEntry.patch();
862            const int boardId = mapEntry.board();
863            const int crateId = mapEntry.crate();
864
865            const int hw = mapEntry.hw();
866            if (pixelIdInPatch == 8)
867            {
868                for (int j=0;j<nSlicesToRemove;j++)
869                {
870                    backupData[(40*crateId + 4*boardId + patchId)*nSlicesToRemove+j] = eventData[(hw*nRoi) + (nRoi-nSlicesToRemove) + j];
871                    eventData[(hw*nRoi) + (nRoi-nSlicesToRemove) + j] = eventData[hw*nRoi + (nRoi-nSlicesToRemove) - 1];
872                }
873            }
874        }
875    }
876
877    vector<float> pixelStatsData(1440*4);
878    DrsCalibrate::GetPixelStats(pixelStatsData.data(), eventData.data(), nRoi);
879
880    for (vector<PixelMapEntry>::const_iterator it=fPixelMap.begin(); it!=fPixelMap.end(); it++)
881    {
882        Meanvalues[it->index]     = pixelStatsData[0*1440+it->hw()];
883        RMSvalues[it->index]      = pixelStatsData[1*1440+it->hw()];
884        Maxvalues[it->index]      = pixelStatsData[2*1440+it->hw()];
885        PosOfMaxvalues[it->index] = pixelStatsData[3*1440+it->hw()];
886    }
887    if (nRoiTM == 0)//move back the data back in place
888    {
889        for (int i=0;i<1440;i++)
890        {
891            const PixelMapEntry& mapEntry = fPixelMap.index(i);
892            const int pixelIdInPatch = mapEntry.pixel();
893            const int patchId = mapEntry.patch();
894            const int boardId = mapEntry.board();
895            const int crateId = mapEntry.crate();
896            if (patchId > 160)
897                cout << "Voila mon probleme: " << patchId << endl;
898            const int hw = mapEntry.hw();
899            if (pixelIdInPatch == 8)
900            {
901 //               cout << "|" << crateId << " " << boardId << " " << patchId << " " << hw << "| ";
902                for (int j=0;j<nSlicesToRemove;j++)
903                {
904                    eventData[(hw*nRoi) + (nRoi - nSlicesToRemove) + j] = backupData[(40*crateId + 4*boardId + patchId)*nSlicesToRemove+j];
905                }
906            }
907        }
908        delete[] backupData;
909    }
910    if (isVisible())
911        updateGL();
912}
913
914void RawDataViewer::eventStepping(bool plus)
915{
916    if (plus)
917        rowNum += eventStep;
918    else
919        rowNum -= eventStep;
920    if (rowNum >= nRows)
921        rowNum -= nRows;
922    if (rowNum < 0)
923        rowNum += nRows;
924
925    readEvent();
926}
927
928void RawDataViewer::readEvent()
929{
930    if (inputFile == NULL)
931        return;
932    inputFile->GetRow(rowNum);
933    if (_softwareOrdering)
934    {//remap pixels data according to hardware id
935        if (nRoiTM != 0)
936            cout << "Warning: did not expect Time Markers data from Monte-Carlo simulations. These will not be mapped properly." << endl;
937        //first copy the data
938        vector<int16_t> tempData(rawEventData.begin(), rawEventData.begin()+1440*nRoi);
939        //copy back the data and re-map it on the fly
940        for (int i=0;i<1440;i++)
941            for (int j=0;j<nRoi;j++)
942                rawEventData[i*nRoi + j] = tempData[softwareMapping[i]*nRoi + j];
943    }
944//    cout << "Getting row " << rowNum << endl;
945
946
947    ApplyCalibration();
948
949    emit signalCurrentEvent(eventNum);
950    emit signalCurrentPixel(selectedPixel);
951}
952
953/************************************************************
954 * NEXT SLICE. deprec ?
955 ************************************************************/
956void RawDataViewer::nextSlice()
957{
958    whichSlice++;
959    if (whichSlice >= nRoi)
960    {
961        whichSlice = 0;
962        if (!loopCurrentEvent)
963        {
964            int backupStep = eventStep;
965            eventStep = 1;
966            eventStepping(true);
967            eventStep = backupStep;
968        }
969    }
970    emit signalCurrentSlice(whichSlice);
971    updateGL();
972}
973void RawDataViewer::previousSlice()
974{
975    whichSlice--;
976    if (whichSlice < 0)
977    {
978        whichSlice = nRoi-1;
979        if (!loopCurrentEvent)
980        {
981            int backupStep = eventStep;
982            eventStep = 1;
983            eventStepping(false);
984            eventStep = backupStep;
985        }
986    }
987    emit signalCurrentSlice(whichSlice);
988    updateGL();
989}
990void RawDataViewer::setCurrentPixel(int pix)
991{
992 //   if (pix == -1)
993 //       return;
994    selectedPixel = pix;
995    if (isVisible())
996    updateGL();
997     emit signalCurrentPixel(pix);
998}
999void RawDataViewer::computePulsesStatistics()
1000{
1001    if (!inputFile)
1002    {
1003        cout << "A FITS file must be open in order to complete this operation" << endl;
1004        return;
1005    }
1006
1007
1008//    for (int i=0;i<nRows;i++)//for all events
1009//    {
1010//        inputFile->GetRow(rowNum);
1011//        for (int i=0;i<(1440+160)*nRoi;i++)
1012//            eventData[i] = (float)rawEventData[i];
1013
1014//        for (int j=0;j<ACTUAL_NUM_PIXELS;j++)
1015///        {
1016    int j = selectedPixel;
1017    if (j == -1)
1018        return;
1019            for (int i=0;i<nRoi;i++)
1020            {
1021                aMeas[i] = eventData[j*nRoi+i];// * adcCount;
1022
1023            }
1024            for (int i=0;i<nRoi;i++)
1025            {
1026                if (i==0)
1027                    n1mean[i] = aMeas[i+1];
1028                else
1029                {
1030                    if (i==1023)
1031                        n1mean[i] = aMeas[i-1];
1032                    else
1033                        n1mean[i] = (aMeas[i-1]+aMeas[i+1])/2.f;
1034                }
1035            }
1036            //find spike
1037            for (int i=0;i<nRoi-3;i++)
1038            {
1039                const float fract = 0.8f;
1040                float xx, xp, xpp;
1041                vCorr[i] = 0;//aMeas[i];
1042                xx = aMeas[i] - n1mean[i];
1043                if (xx < -8.f)
1044                {
1045                    xp = aMeas[i+1] - n1mean[i+1];
1046                    xpp = aMeas[i+2] - n1mean[i+2];
1047                    if ((aMeas[i+2] - (aMeas[i] + aMeas[i+3])/2.f) > 10.f)
1048                    {
1049                        vCorr[i+1] = (aMeas[i] + aMeas[i+3])/2.f;
1050                        vCorr[i+2] = (aMeas[i] + aMeas[i+3])/2.f;
1051                        i = i+2;
1052                    }
1053                    else
1054                    {
1055                        if ((xp > -2.*xx*fract) && (xpp < -10.f))
1056                        {
1057                            vCorr[i+1] = n1mean[i+1];
1058                            n1mean[i+2] = aMeas[i+1] - aMeas[i+3]/2.f;
1059                            i++;
1060                        }
1061                    }
1062                }
1063            }
1064            for (int i=0;i<nRoi;i++)
1065                n1mean[i] = aMeas[i]-n1mean[i];
1066 //       }
1067 //   }
1068}
1069/************************************************************
1070 * UICONNECTOR CONSTRUCTOR
1071 ************************************************************/
1072UIConnector::UIConnector(QWidget *p)
1073{
1074    setupUi(this);
1075    initHistograms();
1076
1077    updateSpinnerDisplay = true;
1078    updating = false;
1079
1080    timer.setInterval(10.0);
1081    QObject::connect(&timer, SIGNAL(timeout()),
1082                     this, SLOT(nextSlicePlease()));
1083
1084    QButtonGroup &scaleGroup = *new QButtonGroup(p);// = new QButtonGroup(canvas);
1085    QButtonGroup &animateGroup = *new QButtonGroup(p);// = new QButtonGroup(canvas);
1086
1087    scaleGroup.addButton(currentPixelScale);
1088    scaleGroup.addButton(entireCameraScale);
1089
1090    animateGroup.addButton(playEventsRadio);
1091    animateGroup.addButton(playSlicesRadio);
1092    animateGroup.addButton(playPixelsRadio);
1093
1094    entireCameraScale->setChecked(true);
1095
1096    RMS_window->enableText(false);
1097    Mean_window->enableText(false);
1098    PosOfMax_window->enableText(false);
1099    Max_window->enableText(false);
1100
1101 //   RMS_window->ShowPatchCursor(true);
1102
1103    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(colorPaletteHasChanged()),
1104                     this, SLOT(on_autoScaleColor_clicked()));
1105    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(signalCurrentSlice(int)),
1106                     this, SLOT(currentSliceHasChanged(int)));
1107    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(signalCurrentEvent(int)),
1108                     this, SLOT(currentEventHasChanged(int)));
1109    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1110                     this, SLOT(pixelChanged(int)));
1111    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(newFileLoaded()),
1112                     this, SLOT(newFileLoaded()));
1113
1114    QObject::connect(RMS_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1115                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1116    QObject::connect(Max_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1117                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1118    QObject::connect(PosOfMax_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1119                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1120    QObject::connect(Mean_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1121                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1122
1123
1124
1125    show();
1126}
1127UIConnector::~UIConnector()
1128{
1129    grid1->detach();
1130    grid2->detach();
1131    grid3->detach();
1132    grid4->detach();
1133    grid5->detach();
1134    grid6->detach();
1135    boardsTimeHistoItem.detach();
1136    startCellHistoItem.detach();
1137    startTimeMarkHistoItem.detach();
1138    pixelValueCurveItem.detach();
1139    pixelAverageCurveItem.detach();
1140    aMeanCurveItem.detach();
1141    vCorrCurveItem.detach();
1142    meanCurveItem.detach();
1143}
1144void UIConnector::slicesPlusPlus()
1145{
1146    GLWindow->nextSlice();
1147}
1148void UIConnector::slicesMinusMinus()
1149{
1150    GLWindow->previousSlice();
1151}
1152void UIConnector::on_calibratedCheckBox_stateChanged(int state)
1153{
1154    GLWindow->fIsDrsCalibration = state;
1155
1156    if (currentCalibFile.empty())
1157        GLWindow->openFile(currentFile, true);
1158
1159    GLWindow->ApplyCalibration();
1160
1161    threeD_Window->setData(GLWindow->eventData.data());
1162
1163    on_autoScaleColor_clicked();
1164    pixelChanged(GLWindow->selectedPixel);
1165
1166}
1167/************************************************************
1168 * DRAW PATCHES CHECK CHANGE. checkbox handler
1169 ************************************************************/
1170void UIConnector::on_drawPatchCheckBox_stateChanged(int state)
1171{
1172    GLWindow->drawPatch = state;
1173    GLWindow->updateGL();
1174    RMS_window->fDrawPatch = state;
1175    RMS_window->updateGL();
1176    Mean_window->fDrawPatch = state;
1177    Mean_window->updateGL();
1178    Max_window->fDrawPatch = state;
1179    Max_window->updateGL();
1180    PosOfMax_window->fDrawPatch = state;
1181    PosOfMax_window->updateGL();
1182}
1183/************************************************************
1184 * DRAW IMPULSE CHECK CHANGE. checkbox handler
1185 ************************************************************/
1186void UIConnector::on_drawImpulseCheckBox_stateChanged(int state)
1187{
1188    GLWindow->drawImpulse = state;
1189    TriggerOffset_window->drawImpulse = state;
1190    Gain_window->drawImpulse = state;
1191    Baseline_window->drawImpulse = state;
1192    GLWindow->updateGL();
1193    TriggerOffset_window->updateGL();
1194    Gain_window->updateGL();
1195    Baseline_window->updateGL();
1196}
1197/************************************************************
1198 * DRAW BLUR CHECK CHANGE. checkbox handler
1199 ************************************************************/
1200void UIConnector::on_drawBlurCheckBox_stateChanged(int state)
1201{
1202    GLWindow->drawBlur = state;
1203    GLWindow->updateGL();
1204}
1205void UIConnector::on_loopOverCurrentEventBox_stateChanged(int state)
1206{
1207    GLWindow->loopCurrentEvent = state;
1208}
1209
1210/************************************************************
1211 * NEXT SLICE PLEASE
1212 ************************************************************/
1213void UIConnector::nextSlicePlease()
1214{
1215    if (playEventsRadio->isChecked ())
1216        GLWindow->eventStepping(true);
1217    else
1218        if (playPixelsRadio->isChecked())
1219            GLWindow->setCurrentPixel((GLWindow->getCurrentPixel()+1)%1440);
1220        else
1221            GLWindow->nextSlice();
1222}
1223
1224/************************************************************
1225 * SET VIEWER.
1226 ************************************************************/
1227//void UIConnector::setViewer(RawDataViewer* v)
1228//{
1229//    viewer = v;
1230//}
1231/************************************************************
1232 * SLICES PER SECOND CHANGED. timing ui handler
1233 ************************************************************/
1234void UIConnector::slicesPerSecondChanged(double value)
1235{
1236    timer.setInterval(1000.0/value);
1237}
1238
1239void UIConnector::on_colorRange0_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1240void UIConnector::on_colorRange1_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1241void UIConnector::on_colorRange2_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1242void UIConnector::on_colorRange3_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1243void UIConnector::on_colorRange4_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1244
1245void UIConnector::on_redValue0_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1246void UIConnector::on_redValue1_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1247void UIConnector::on_redValue2_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1248void UIConnector::on_redValue3_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1249void UIConnector::on_redValue4_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1250
1251void UIConnector::on_greenValue0_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1252void UIConnector::on_greenValue1_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1253void UIConnector::on_greenValue2_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1254void UIConnector::on_greenValue3_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1255void UIConnector::on_greenValue4_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1256
1257void UIConnector::on_blueValue0_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1258void UIConnector::on_blueValue1_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1259void UIConnector::on_blueValue2_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1260void UIConnector::on_blueValue3_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1261void UIConnector::on_blueValue4_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1262
1263/************************************************************
1264 * LOAD NEW FILE CLICKED. button handler
1265 ************************************************************/
1266void UIConnector::on_loadNewFileButton_clicked()
1267{
1268    QFileDialog dialog;
1269    dialog.setFileMode(QFileDialog::ExistingFile);
1270    dialog.open(this, SLOT(fileSelected(QString)));
1271    dialog.setVisible(true);
1272    dialog.exec();
1273}
1274void UIConnector::on_loadDRSCalibButton_clicked()
1275{
1276    QFileDialog dialog;
1277    dialog.setFileMode(QFileDialog::ExistingFile);
1278    dialog.open(this, SLOT(calibFileSelected(QString)));
1279    dialog.setVisible(true);
1280    dialog.exec();
1281}
1282/************************************************************
1283 * FILE SELECTED. return of the file open dialog handler
1284 ************************************************************/
1285void UIConnector::fileSelected(QString file)
1286{
1287    const bool reopen = !currentFile.empty();
1288
1289    currentFile = file.toStdString();
1290    if (!currentFile.empty())
1291        GLWindow->openFile(currentFile, reopen && currentCalibFile.empty());
1292}
1293void UIConnector::calibFileSelected(QString file)
1294{
1295    const bool reopen = currentCalibFile.empty();
1296
1297    currentCalibFile = file.toStdString();
1298    if (reopen && !currentFile.empty())
1299        GLWindow->openFile(currentFile, true);
1300    if (currentCalibFile != "")
1301        GLWindow->openCalibFile(currentCalibFile);
1302
1303
1304    if (GLWindow->fDrsCalib.fRoi != 0)
1305    {//spread the calibration data to the displayers
1306        Baseline_window->getCalibrationDataForDisplay(RawDataViewer::CALIB_BASELINE,
1307                                                      GLWindow->fDrsCalib.fOffset,
1308                                                      GLWindow->fDrsCalib.fRoi,
1309                                                      GLWindow->fDrsCalib.fNumTm);
1310
1311        Gain_window->getCalibrationDataForDisplay(RawDataViewer::CALIB_GAIN,
1312                                                  GLWindow->fDrsCalib.fGain,
1313                                                  GLWindow->fDrsCalib.fRoi,
1314                                                  GLWindow->fDrsCalib.fNumTm);
1315
1316        TriggerOffset_window->getCalibrationDataForDisplay(RawDataViewer::CALIB_TRIG_OFFSET,
1317                                                           GLWindow->fDrsCalib.fTrgOff,
1318                                                           GLWindow->fDrsCalib.fRoi,
1319                                                           GLWindow->fDrsCalib.fNumTm);
1320
1321    }
1322}
1323/************************************************************
1324 * NEW FILE LOADED. update of the UI after a new file has been loaded
1325 ************************************************************/
1326void UIConnector::newFileLoaded()
1327{
1328    ostringstream str;
1329
1330    //extract the file name only (no path) from the full name
1331    str << "File: ";
1332    if (currentFile.size() > 2)
1333        str << currentFile.substr(currentFile.find_last_of("//")+1, currentFile.size()) << "\n";
1334    else
1335        str << "--\n";
1336    str << "Calibration: ";
1337    if (currentCalibFile.size() > 2)
1338        str << currentCalibFile.substr(currentCalibFile.find_last_of("//")+1, currentCalibFile.size()) << "\n";
1339    else
1340        str << "--\n";
1341//    fileLoadedLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1342//    str.str("");
1343    str << "Run number: " << GLWindow->runNumber << "\n";
1344//    runNumberLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1345//    str.str("");
1346    str << "Number of Events: " << GLWindow->nRows << "\n";
1347
1348    displayingEventBox->setMaximum(GLWindow->nRows-1);
1349
1350    str << "Number of Slices: " << GLWindow->nRoi << "\n";// << "/1024";
1351//    numberOfSlicesLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1352//    str.str("");
1353    str << "Number of Time Marks: " << GLWindow->nTM << "\n";
1354//    numberOfTimeMarksLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1355
1356//    str.str("");
1357    str << "Run Type: " << GLWindow->runType << "\n";
1358//    runTypeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1359//    str.str("");
1360    str << "Time of 1st data: " << GLWindow->firstDataTime << "\n";
1361//    firstTimeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1362//    str.str("");
1363    str << "Time of last data: " << GLWindow->lastDataTime << "\n";
1364//    lastTimeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1365//    str.str("");
1366    str << "SVN revision: " << GLWindow->revision << '\n';
1367    str << "Number of boards: " << GLWindow->nBoards << '\n';
1368    str << "Number of pixels: " << GLWindow->nPixels << '\n';
1369    str << "Number of Slices TM: " << GLWindow->nRoiTM << '\n';
1370    str << "Time system: " << GLWindow->timeSystem << '\n';
1371    str << "Date: " << GLWindow->creationDate << '\n';
1372    str << "Night: " << GLWindow->nightInt << '\n';
1373    str << "Camera: " << GLWindow->camera << '\n';
1374    str << "DAQ: " << GLWindow->daq << '\n';
1375    str << "ADC Count: " << GLWindow->adcCount << '\n';
1376    str << "NB Evts OK:" << GLWindow->nbOk << '\n';
1377    str << "NB Evts Rejected: " << GLWindow->nbRej << '\n';
1378    str << "NB Evts Bad: " << GLWindow->nbBad << '\n';
1379    extraInfoLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1380
1381    /*
1382    if (GLWindow->calibrationLoaded)
1383    {
1384        drawCalibrationCheckBox->setEnabled(true);
1385    }*/
1386
1387
1388}
1389/************************************************************
1390 * PLAY PAUSE CLICKED. ui handler
1391 ************************************************************/
1392void UIConnector::on_playPauseButton_clicked()
1393{
1394    if (timer.isActive())
1395        timer.stop();
1396    else
1397        timer.start();
1398}
1399
1400void UIConnector::displaySliceValue()
1401{
1402    if (!GLWindow->nRoi)
1403        return;
1404    if (GLWindow->selectedPixel == -1)
1405    {
1406        ostringstream str;
1407        str << " Current Pixel val.: --";
1408        currentPixelValue->setText(QString(str.str().c_str()));
1409        return;
1410    }
1411//    int mapping = GLWindow->_softwareOrdering ? GLWindow->selectedPixel : GLWindow->hardwareMapping[GLWindow->selectedPixel];
1412    int mapping = GLWindow->hardwareMapping[GLWindow->selectedPixel];
1413    const int idx = GLWindow->nRoi*mapping + GLWindow->whichSlice;
1414
1415    ostringstream str;
1416    str << "Current Pixel val.: " << GLWindow->eventData[idx];
1417    currentPixelValue->setText(QString(str.str().c_str()));
1418}
1419
1420/************************************************************
1421 * CURRENT SLICE HAS CHANGE. ui handler
1422 ************************************************************/
1423void UIConnector::currentSliceHasChanged(int slice)
1424{
1425    if (!GLWindow->nRoi)
1426        return;
1427
1428    if (updateSpinnerDisplay)
1429        displayingSliceBox->setValue(slice);
1430
1431    displaySliceValue();
1432}
1433
1434/*****
1435 *******************************************************
1436 * CURRENT EVENT HAS CHANGED. ui handler
1437 ************************************************************/
1438
1439double xval[50000];
1440double yval[50000];
1441void UIConnector::on_displayingEventBox_valueChanged(int cEvent)
1442{
1443//    cout << "Here " << updateSpinnerDisplay << endl;
1444    if (!updateSpinnerDisplay)
1445        return;
1446    updateSpinnerDisplay = false;
1447//    currentEventHasChanged(cEvent);
1448    GLWindow->rowNum = cEvent - GLWindow->eventStep;
1449    GLWindow->eventStepping(true);
1450    updateSpinnerDisplay = true;
1451
1452//    GLWindow->updateGL();
1453}
1454void UIConnector::on_slicesPerSecValue_valueChanged(double value)
1455{
1456    timer.setInterval(1000.0/value);
1457}
1458void UIConnector::on_displayingSliceBox_valueChanged(int cSlice)
1459{
1460    updateSpinnerDisplay = false;
1461    currentSliceHasChanged(cSlice);
1462    updateSpinnerDisplay = true;
1463    GLWindow->whichSlice = cSlice;
1464    GLWindow->updateGL();
1465}
1466void UIConnector::currentEventHasChanged(int )
1467{
1468
1469    RMS_window->SetData(GLWindow->RMSvalues);
1470    Mean_window->SetData(GLWindow->Meanvalues);
1471    PosOfMax_window->SetData(GLWindow->PosOfMaxvalues);
1472    Max_window->SetData(GLWindow->Maxvalues);
1473    threeD_Window->setData(GLWindow->eventData.data());//rawEventData);
1474
1475    if (RMS_window->isVisible())
1476        RMS_window->updateGL();
1477    if (Mean_window->isVisible())
1478        Mean_window->updateGL();
1479    if (PosOfMax_window->isVisible())
1480        PosOfMax_window->updateGL();
1481    if (Max_window->isVisible())
1482        Max_window->updateGL();
1483    ostringstream str;
1484//    str << "Displaying Event " << cEvent;
1485//    QString qstr(str.str().c_str());
1486//    emit updateCurrentEventDisplay(qstr);
1487    if (updateSpinnerDisplay)
1488    {
1489        updateSpinnerDisplay = false;
1490        displayingEventBox->setValue(GLWindow->rowNum);
1491        updateSpinnerDisplay = true;
1492    }
1493
1494 //   GLWindow->doWaveLetOnCurrentEventPlease();
1495
1496        //retrieve the data that we want to display
1497    boost::posix_time::ptime hrTime( boost::gregorian::date(1970, boost::gregorian::Jan, 1),
1498            boost::posix_time::seconds(GLWindow->pcTime[0]) +  boost::posix_time::microsec(GLWindow->pcTime[1]));
1499
1500    str.str("");
1501    str << "PC Time: " << boost::posix_time::to_iso_extended_string(hrTime);
1502    PCTimeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1503
1504    str.str("");
1505    str << "Software Trigger: " << GLWindow->softTrig;
1506    softwareTriggerLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1507
1508    str.str("");
1509    str << "Trigger Type: " << GLWindow->triggerType;
1510    triggerTypeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1511
1512    displaySliceValue();
1513
1514    if (autoScaleColor->isChecked())
1515        emit GLWindow->colorPaletteHasChanged();//autoScalePressed();
1516
1517    boardsTimeList->clear();
1518    startPixelsList->clear();
1519    startTimeMarksList->clear();
1520    triggerDelayList->clear();
1521    std::map<int, int> boardsHistoMap;
1522    for (int i=0;i <NBOARDS; i++)
1523    {
1524        str.str("");
1525        str << i;
1526        if (i<10) str << " ";
1527        if (i<100) str << " ";
1528        if (i<1000) str << " ";
1529        str << ": " << GLWindow->boardTime[i];
1530        boardsTimeList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1531        if (boardsHistoMap.find(GLWindow->boardTime[i]) != boardsHistoMap.end())
1532            boardsHistoMap[GLWindow->boardTime[i]]++;
1533        else
1534            boardsHistoMap[GLWindow->boardTime[i]] = 1;
1535    }
1536    std::map<int, int> pixelHistoMap;
1537    for (int i=0;i <NPIX; i++)
1538    {
1539        str.str("");
1540        str << i;
1541        if (i<10) str << " ";
1542        if (i<100) str << " ";
1543        if (i<1000) str << " ";
1544        str << ": " << GLWindow->startPix[i];
1545        startPixelsList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1546        if (pixelHistoMap.find(GLWindow->startPix[i]) != pixelHistoMap.end())
1547            pixelHistoMap[GLWindow->startPix[i]]++;
1548        else
1549            pixelHistoMap[GLWindow->startPix[i]] = 1;
1550    }
1551
1552    std::map<int, int> timeMarksMap;
1553    for (int i=0;i <NTMARK; i++)
1554    {
1555        str.str("");
1556        str << i;
1557        if (i<10) str << " ";
1558        if (i<100) str << " ";
1559        if (i<1000) str << " ";
1560        str << ": " << GLWindow->startTM[i];
1561        startTimeMarksList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1562        if (timeMarksMap.find(GLWindow->startTM[i]) != timeMarksMap.end())
1563            timeMarksMap[GLWindow->startTM[i]]++;
1564        else
1565            timeMarksMap[GLWindow->startTM[i]] = 1;
1566    }
1567    std::map<int,int> delayMap;
1568    triggerDelayList->addItem(QString("Patch | Slice:Delay Slice:Delay..."));
1569    for (int i=0;i<NTMARK; i++)
1570    {
1571        str.str("");
1572        str << i << " | ";
1573        for (int j=0;j<GLWindow->nRoiTM;j++)
1574        {
1575            int value = GLWindow->eventData[1440*GLWindow->nRoi + i*GLWindow->nRoiTM + j];
1576            if (delayMap.find(value) != delayMap.end())
1577                 delayMap[value]++;
1578             else
1579                 delayMap[value] = 1;
1580            str << j << ":" << value << " ";
1581         }
1582        triggerDelayList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1583    }
1584
1585    std::map<int,int>::iterator it = boardsHistoMap.begin();
1586    int nsamples = 0;
1587    int previousValue = it->first-10;
1588    for (unsigned int i=0;i<boardsHistoMap.size();i++)
1589    {
1590        if (previousValue != it->first-1)
1591        {
1592            xval[nsamples] = previousValue+1;
1593            yval[nsamples] = 0;
1594            nsamples++;
1595            xval[nsamples] = it->first-1;
1596            yval[nsamples] = 0;
1597            nsamples++;
1598        }
1599        xval[nsamples] = it->first;
1600        yval[nsamples] = it->second;
1601        previousValue = it->first;
1602        it++;
1603        nsamples++;
1604        xval[nsamples] = previousValue;
1605        yval[nsamples] = 0;
1606        nsamples++;
1607        if (nsamples > 4090)
1608        {
1609            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1610            break;
1611        }
1612    }
1613    xval[nsamples] = it==boardsHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1614    yval[nsamples] = 0;
1615    nsamples++;
1616 //   if (nsamples > 5)
1617#if QWT_VERSION < 0x060000
1618       boardsTimeHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1619#else
1620       boardsTimeHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1621#endif
1622
1623    it = pixelHistoMap.begin();
1624    nsamples = 0;
1625    previousValue = it->first-10;
1626    for (unsigned int i=0;i<pixelHistoMap.size();i++)
1627    {
1628        if (previousValue != it->first-1)
1629        {
1630            xval[nsamples] = previousValue+1;
1631            yval[nsamples] = 0;
1632            nsamples++;
1633            xval[nsamples] = it->first-1;
1634            yval[nsamples] = 0;
1635            nsamples++;
1636        }
1637        xval[nsamples] = it->first;
1638        yval[nsamples] = it->second;
1639        previousValue = it->first;
1640        it++;
1641        nsamples++;
1642        xval[nsamples] = previousValue;
1643        yval[nsamples] = 0;
1644        nsamples++;
1645        if (nsamples > 4090)
1646        {
1647            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1648            break;
1649        }
1650   }
1651    xval[nsamples] = it==pixelHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1652    yval[nsamples] = 0;
1653    nsamples++;
1654//    if (nsamples > 5)
1655#if QWT_VERSION < 0x060000
1656       startCellHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1657#else
1658       startCellHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1659#endif
1660
1661    it = timeMarksMap.begin();
1662    nsamples = 0;
1663    previousValue = it->first-10;
1664    for (unsigned int i=0;i<timeMarksMap.size();i++)
1665    {
1666        if (previousValue != it->first-1)
1667        {
1668            xval[nsamples] = previousValue+1;
1669            yval[nsamples] = 0;
1670            nsamples++;
1671            xval[nsamples] = it->first-1;
1672            yval[nsamples] = 0;
1673            nsamples++;
1674        }
1675        xval[nsamples] = it->first;
1676        yval[nsamples] = it->second;
1677        previousValue = it->first;
1678        it++;
1679        nsamples++;
1680        xval[nsamples] = previousValue;
1681        yval[nsamples] = 0;
1682        nsamples++;
1683        if (nsamples > 4090)
1684        {
1685            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1686            break;
1687        }
1688    }
1689    xval[nsamples] = it==timeMarksMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1690    yval[nsamples] = 0;
1691    nsamples++;
1692 //   if (nsamples > 5)
1693#if QWT_VERSION < 0x060000
1694       startTimeMarkHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1695#else
1696       startTimeMarkHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1697#endif
1698
1699    it = delayMap.begin();
1700    nsamples = 0;
1701    previousValue = it->first-10;
1702    for (unsigned int i=0;i<delayMap.size();i++)
1703    {
1704        if (previousValue != it->first-1)
1705        {
1706            xval[nsamples] = previousValue+1;
1707            yval[nsamples] = 0;
1708            nsamples++;
1709            xval[nsamples] = it->first-1;
1710            yval[nsamples] = 0;
1711            nsamples++;
1712        }
1713        xval[nsamples] = it->first;
1714        yval[nsamples] = it->second;
1715        previousValue = it->first;
1716        it++;
1717        nsamples++;
1718        xval[nsamples] = previousValue;
1719        yval[nsamples] = 0;
1720        nsamples++;
1721        if (nsamples > 4090)
1722        {
1723            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1724            break;
1725        }
1726    }
1727    xval[nsamples] = it==delayMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1728    yval[nsamples] = 0;
1729    nsamples++;
1730  //  if (nsamples > 5)
1731#if QWT_VERSION < 0x060000
1732       triggerDelayHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1733#else
1734       triggerDelayHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1735#endif
1736       //WAVELETS HACK
1737/*       std::map<int, int> valuesHistoMap;
1738       std::map<int, int> waveletHistoMap;
1739       for (int i=0;i<1024*1440;i++)
1740       {
1741           if (valuesHistoMap.find(GLWindow->rawEventData[i]) != valuesHistoMap.end())
1742               valuesHistoMap[GLWindow->rawEventData[i]]++;
1743           else
1744               valuesHistoMap[GLWindow->rawEventData[i]] = 1;
1745           if (waveletHistoMap.find(GLWindow->waveLetArray[i]) != waveletHistoMap.end())
1746               waveletHistoMap[GLWindow->waveLetArray[i]]++;
1747           else
1748               waveletHistoMap[GLWindow->waveLetArray[i]] = 1;
1749       }
1750
1751       it = valuesHistoMap.begin();
1752       nsamples = 0;
1753       previousValue = it->first-10;
1754       cout << "Num values Original: " << valuesHistoMap.size() << endl;
1755       for (unsigned int i=0;i<valuesHistoMap.size();i++)
1756       {
1757           if (previousValue != it->first-1)
1758           {
1759               xval[nsamples] = previousValue+1;
1760               yval[nsamples] = 0;
1761               nsamples++;
1762               xval[nsamples] = it->first-1;
1763               yval[nsamples] = 0;
1764               nsamples++;
1765           }
1766           xval[nsamples] = it->first;
1767           yval[nsamples] = it->second;
1768           previousValue = it->first;
1769           it++;
1770           nsamples++;
1771           xval[nsamples] = previousValue;
1772           yval[nsamples] = 0;
1773           nsamples++;
1774           if (nsamples > 50000)
1775           {
1776               cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1777               break;
1778           }
1779       }
1780       xval[nsamples] = it==valuesHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1781       yval[nsamples] = 0;
1782       nsamples++;
1783     //  if (nsamples > 5)
1784   #if QWT_VERSION < 0x060000
1785          triggerDelayHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1786   #else
1787          triggerDelayHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1788   #endif
1789
1790          it = waveletHistoMap.begin();
1791          nsamples = 0;
1792          previousValue = it->first-10;
1793          cout << "Num values WaveLets: " << waveletHistoMap.size() << endl;
1794          for (unsigned int i=0;i<waveletHistoMap.size();i++)
1795          {
1796              if (previousValue != it->first-1)
1797              {
1798                  xval[nsamples] = previousValue+1;
1799                  yval[nsamples] = 0;
1800                  nsamples++;
1801                  xval[nsamples] = it->first-1;
1802                  yval[nsamples] = 0;
1803                  nsamples++;
1804              }
1805              xval[nsamples] = it->first;
1806              yval[nsamples] = it->second;
1807              previousValue = it->first;
1808              it++;
1809              nsamples++;
1810              xval[nsamples] = previousValue;
1811              yval[nsamples] = 0;
1812              nsamples++;
1813              if (nsamples > 50000)
1814              {
1815                  cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1816                  break;
1817              }
1818          }
1819          xval[nsamples] = it==waveletHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1820          yval[nsamples] = 0;
1821          nsamples++;
1822        //  if (nsamples > 5)
1823      #if QWT_VERSION < 0x060000
1824          startTimeMarkHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1825      #else
1826          startTimeMarkHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1827      #endif
1828*/
1829//END OF WAVELETS HACK
1830       //    startCellHistoZoom->setZoomBase(startCellHistoItem.boundingRect());
1831    QStack< QRectF > stack;
1832//    QRectF cRectangle = boardsTimeHistoItem.boundingRect();
1833    stack.push(scaleBoundingRectangle(boardsTimeHistoItem.boundingRect(), 1.05f));//cRectangle);//boardsTimeHistoItem.boundingRect());
1834    boardsTimeHistoZoom->setZoomStack(stack);
1835    stack.pop();
1836    stack.push(scaleBoundingRectangle(startCellHistoItem.boundingRect(), 1.05f));
1837    startCellHistoZoom->setZoomStack(stack);
1838    stack.pop();
1839    stack.push(scaleBoundingRectangle(startTimeMarkHistoItem.boundingRect(), 1.05f));
1840    startTimeMarkHistoZoom->setZoomStack(stack);
1841    stack.pop();
1842    stack.push(scaleBoundingRectangle(triggerDelayHistoItem.boundingRect(), 1.05f));
1843    triggerDelayHistoZoom->setZoomStack(stack);
1844    stack.pop();
1845
1846    pixelChanged(GLWindow->selectedPixel);
1847}
1848//can't use a ref to rectangle, as the type must be converted first
1849QRectF UIConnector::scaleBoundingRectangle(QRectF rectangle, float scale)
1850{
1851    QPointF bottomRight = rectangle.bottomRight();
1852    QPointF topLeft = rectangle.topLeft();
1853    QPointF center = rectangle.center();
1854    return QRectF(topLeft + (topLeft-center)*(scale-1.0f), //top left
1855                  bottomRight + (bottomRight-center)*(scale-1.0f)); //bottom right
1856}
1857void UIConnector::initHistograms()
1858{
1859//    QwtPlot*     boardsTimeHisto;
1860//    QwtPlotHistogram boardsTimeHistoItem;
1861    grid1 = new QwtPlotGrid;
1862    grid1->enableX(false);
1863    grid1->enableY(true);
1864    grid1->enableXMin(false);
1865    grid1->enableYMin(false);
1866    grid1->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1867    grid1->attach(boardsTimeHisto);
1868
1869    grid2 = new QwtPlotGrid;
1870    grid2->enableX(false);
1871    grid2->enableY(true);
1872    grid2->enableXMin(false);
1873    grid2->enableYMin(false);
1874    grid2->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1875    grid2->attach(startCellsHisto);
1876
1877    grid3 = new QwtPlotGrid;
1878    grid3->enableX(false);
1879    grid3->enableY(true);
1880    grid3->enableXMin(false);
1881    grid3->enableYMin(false);
1882    grid3->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1883    grid3->attach(startTimeMarkHisto);
1884
1885    grid4 = new QwtPlotGrid;
1886    grid4->enableX(false);
1887    grid4->enableY(true);
1888    grid4->enableXMin(false);
1889    grid4->enableYMin(false);
1890    grid4->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1891    grid4->attach(pixelValueCurve);
1892
1893    grid6 = new QwtPlotGrid;
1894    grid6->enableX(false);
1895    grid6->enableY(true);
1896    grid6->enableXMin(false);
1897    grid6->enableYMin(false);
1898    grid6->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1899    grid6->attach(pixelAverageCurve);
1900
1901    grid5 = new QwtPlotGrid;
1902    grid5->enableX(false);
1903    grid5->enableY(true);
1904    grid5->enableXMin(false);
1905    grid5->enableYMin(false);
1906    grid5->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1907    grid5->attach(triggerDelayHisto);
1908
1909    boardsTimeHisto->setAutoReplot(true);
1910    startCellsHisto->setAutoReplot(true);
1911    startTimeMarkHisto->setAutoReplot(true);
1912    pixelValueCurve->setAutoReplot(true);
1913    pixelAverageCurve->setAutoReplot(true);
1914    triggerDelayHisto->setAutoReplot(true);
1915    boardsTimeHisto->setTitle("Boards time values");
1916    startCellsHisto->setTitle("Start Cell values");
1917    startTimeMarkHisto->setTitle("Start Time Marks values");
1918    pixelValueCurve->setTitle("Current pixel values");
1919    pixelAverageCurve->setTitle("Average pixels values");
1920    triggerDelayHisto->setTitle("Trigger Delays");
1921
1922 //   boardsTimeHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1923//    startCellHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1924//    startTimeMarkHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1925//    triggerDelayHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1926//    pixelValueCurveItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1927
1928    boardsTimeHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1929    boardsTimeHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1930    startCellHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1931    startCellHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1932    startTimeMarkHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1933    startTimeMarkHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1934    triggerDelayHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1935    triggerDelayHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1936
1937    boardsTimeHistoItem.attach(boardsTimeHisto);
1938    startCellHistoItem.attach(startCellsHisto);
1939    startTimeMarkHistoItem.attach(startTimeMarkHisto);
1940    triggerDelayHistoItem.attach(triggerDelayHisto);
1941
1942    //curve
1943//    pixelValueCurveItem.setSymbol(new QwtSymbol(QwtSymbol::Cross, Qt::NoBrush, QPen(Qt::black), QSize(5,5)));
1944    pixelValueCurveItem.setPen(QColor(Qt::black));
1945    pixelAverageCurveItem.setPen(QColor(Qt::black));
1946    aMeanCurveItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1947    vCorrCurveItem.setPen(QColor(Qt::red));
1948    meanCurveItem.setPen(QColor(Qt::blue));
1949    pixelValueCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1950    pixelAverageCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1951    aMeanCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1952    vCorrCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1953    meanCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1954
1955//    pixelValueCurveItem.setCurveAttribute(QwtPlotCurve::Fitted);
1956    pixelValueCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1957    pixelAverageCurveItem.attach(pixelAverageCurve);
1958//    aMeanCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1959 //   vCorrCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1960//    meanCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1961
1962    //FIXME delete these pointers with the destructor
1963    curveZoom = new QwtPlotZoomer(pixelValueCurve->canvas());
1964    curveZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1965    curveZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1966    averageCurveZoom = new QwtPlotZoomer(pixelAverageCurve->canvas());
1967    averageCurveZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1968    averageCurveZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1969
1970    boardsTimeHistoZoom = new QwtPlotZoomer(boardsTimeHisto->canvas());
1971    boardsTimeHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1972    boardsTimeHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1973
1974    startCellHistoZoom = new QwtPlotZoomer(startCellsHisto->canvas());
1975    startCellHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1976    startCellHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1977
1978    startTimeMarkHistoZoom = new QwtPlotZoomer(startTimeMarkHisto->canvas());
1979    startTimeMarkHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1980    startTimeMarkHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1981
1982    triggerDelayHistoZoom = new QwtPlotZoomer(triggerDelayHisto->canvas());
1983    triggerDelayHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1984    triggerDelayHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1985
1986
1987}
1988
1989void UIConnector::pixelChanged(int pixel)
1990{
1991    RMS_window->fWhite = pixel;
1992    Mean_window->fWhite = pixel;
1993    Max_window->fWhite = pixel;
1994    PosOfMax_window->fWhite = pixel;
1995    if (pixel != -1)
1996    {
1997        RMS_window->fWhitePatch = RMS_window->pixelsPatch[pixel];
1998        Mean_window->fWhitePatch = Mean_window->pixelsPatch[pixel];
1999        Max_window->fWhitePatch = Max_window->pixelsPatch[pixel];
2000        PosOfMax_window->fWhitePatch = PosOfMax_window->pixelsPatch[pixel];
2001    }
2002    else
2003    {
2004        RMS_window->fWhitePatch = -1;
2005        Mean_window->fWhitePatch = -1;
2006        Max_window->fWhitePatch = -1;
2007        PosOfMax_window->fWhitePatch = -1;
2008    }
2009    if (pixel == -1)
2010        return;
2011    int softwarePix = pixel;
2012//    if (!GLWindow->_softwareOrdering)
2013        pixel = GLWindow->hardwareMapping[pixel];
2014
2015    HwIDBox->setValue(pixel);
2016
2017    if (!GLWindow->nRoi)
2018        return;
2019
2020int currentPixel = pixel;
2021
2022    for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2023    {
2024        xval[i] = i;
2025        yval[i] = GLWindow->eventData[GLWindow->nRoi*currentPixel + i];
2026    }
2027
2028int realNumSamples = GLWindow->nRoi;
2029    if (GLWindow->nRoiTM != 0)
2030    {
2031        const PixelMapEntry& mapEntry = GLWindow->fPixelMap.index(softwarePix);
2032        const int pixelIdInPatch = mapEntry.pixel();
2033        const int patchId = mapEntry.patch();
2034        const int boardId = mapEntry.board();
2035        const int crateId = mapEntry.crate();
2036        if (pixelIdInPatch == 8)
2037        {
2038            int TMIndex = 0;
2039            int xIndex = GLWindow->nRoi;
2040            int arrayIndex = GLWindow->nRoi;
2041            if (GLWindow->offSetRoi < 0)
2042                TMIndex -= GLWindow->offSetRoi;
2043            if (GLWindow->offSetRoi > 0)
2044                xIndex += GLWindow->offSetRoi;
2045            for (int i=TMIndex;i<GLWindow->nRoiTM;i++, xIndex++, arrayIndex++)
2046            {
2047                xval[arrayIndex] = xIndex;
2048                yval[arrayIndex] = GLWindow->eventData[GLWindow->nRoi*1440 + GLWindow->nRoiTM*(40*crateId + 4*boardId + patchId) + i];
2049            }
2050            realNumSamples += GLWindow->nRoiTM - TMIndex;
2051        }
2052      //  cout << pixelIdInPatch << " " ;
2053    }
2054
2055#if QWT_VERSION < 0x060000
2056    pixelValueCurveItem.setData(xval, yval, realNumSamples);
2057#else
2058       pixelValueCurveItem.setSamples(xval, yval, realNumSamples);
2059#endif
2060
2061//now compute the average value of all pixels
2062       currentPixel = 0;
2063       for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2064           yval[i] = 0;
2065       for (int j=0;j<1440;j++) {
2066           currentPixel = j;
2067           for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2068           {
2069               xval[i] = i;
2070               yval[i] += GLWindow->eventData[GLWindow->nRoi*currentPixel + i];
2071           }
2072       }
2073       for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2074           yval[i] /= 1440;
2075#if QWT_VERSION < 0x060000
2076       pixelAverageCurveItem.setData(xval, yval, GLWindow->nRoi);
2077#else
2078    pixelAverageCurveItem.setSamples(xval, yval, realNumSamples);
2079#endif
2080
2081    QStack< QRectF > stack;
2082    stack.push(scaleBoundingRectangle(pixelValueCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2083    curveZoom->setZoomBase(scaleBoundingRectangle(pixelValueCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2084    curveZoom->setZoomStack(stack);
2085    stack.pop();
2086    stack.push(scaleBoundingRectangle(pixelAverageCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2087    averageCurveZoom->setZoomBase(scaleBoundingRectangle(pixelAverageCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2088    averageCurveZoom->setZoomStack(stack);
2089    stack.pop();
2090
2091    displaySliceValue();
2092    on_autoScaleColor_clicked();
2093}
2094
2095void UIConnector::on_HwIDBox_valueChanged(int)
2096{
2097    updating = true;
2098
2099    const int hwID = HwIDBox->value();
2100
2101    const int crateID =  hwID/360;
2102    const int boardID = (hwID%360)/36;
2103    const int patchID = (hwID%36 )/9;
2104    const int pixelID =  hwID%9;
2105
2106    SwIDBox->setValue(GLWindow->softwareMapping[hwID]);
2107
2108    crateIDBox->setValue(crateID);
2109    boardIDBox->setValue(boardID);
2110    patchIDBox->setValue(patchID);
2111    pixelIDBox->setValue(pixelID);
2112
2113    updating = false;
2114
2115    GLWindow->selectedPixel = GLWindow->softwareMapping[hwID];
2116    GLWindow->updateGL();
2117
2118    pixelChanged(GLWindow->selectedPixel);
2119}
2120
2121void UIConnector::cbpxChanged()
2122{
2123    if (updating)
2124        return;
2125
2126    const int hwid = crateIDBox->value()*360 + boardIDBox->value()*36 + patchIDBox->value()*9 + pixelIDBox->value();
2127    HwIDBox->setValue(hwid);
2128}
2129
2130void UIConnector::on_SwIDBox_valueChanged(int swid)
2131{
2132    if (updating)
2133        return;
2134
2135//    if (GLWindow->_softwareOrdering)
2136//        HwIDBox->setValue(swid);
2137//    else
2138        HwIDBox->setValue(GLWindow->hardwareMapping[swid]);
2139}
2140
2141void UIConnector::on_autoScaleColor_clicked()
2142{
2143    if (!autoScaleColor->isChecked())
2144    {
2145        GLWindow->ss[0] = 0.496;
2146        GLWindow->ss[1] = 0.507;
2147        GLWindow->ss[2] = 0.518;
2148        GLWindow->ss[3] = 0.529;
2149        GLWindow->ss[4] = 0.540;;
2150        colorRange0->setValue(GLWindow->ss[0]);
2151        colorRange1->setValue(GLWindow->ss[1]);
2152        colorRange2->setValue(GLWindow->ss[2]);
2153        colorRange3->setValue(GLWindow->ss[3]);
2154        colorRange4->setValue(GLWindow->ss[4]);
2155        return;
2156    }
2157    if (!GLWindow->nRoi)
2158        return;
2159
2160    int start = 0;
2161    int end   = 1440;
2162
2163    if (!entireCameraScale->isChecked())
2164    {
2165        start = GLWindow->selectedPixel;
2166        end   = GLWindow->selectedPixel+1;
2167        if (end == 0)
2168        {
2169            start = 0;
2170            end = 1440;
2171        }
2172    }
2173
2174    int min =  100000; //real min = -2048, int_16 = -32768 to 32767
2175    int max = -100000; //real max = 2047
2176
2177    long average = 0;
2178    long numSamples = 0;
2179    int errorDetected = -1;
2180
2181    for (int i=start;i<end;i++)
2182    {
2183        if (i==863)//keep crazy pixel out of the autoscale
2184            continue;
2185        for (int j=10;j<GLWindow->nRoi-50;j++)
2186        {
2187            int cValue = GLWindow->eventData[i*GLWindow->nRoi+j];
2188            if (cValue > max && cValue < 32767)
2189                max = cValue;
2190            if (cValue < min && cValue > -32768)
2191               min = cValue;
2192            if (cValue < 32767 && cValue > -32768)
2193            {
2194                average+=cValue;
2195                numSamples++;
2196            }
2197            else
2198            {
2199                errorDetected = i;
2200            }
2201//            numSamples++;
2202        }
2203    }
2204    average /= numSamples;
2205    if (errorDetected != -1)
2206    {
2207        cout << "Overflow detected at pixel " << errorDetected << " (at least)" << endl;
2208    }
2209//    cout << "min: " << min << " max: " << max << " average: " << average << endl;
2210    float minRange = (float)(min+(GLWindow->VALUES_SPAN/2))/(float)(GLWindow->VALUES_SPAN-1);
2211    float maxRange = (float)(max+(GLWindow->VALUES_SPAN/2))/(float)(GLWindow->VALUES_SPAN-1);
2212    float midRange = (float)(average+(GLWindow->VALUES_SPAN/2))/(float)(GLWindow->VALUES_SPAN-1);
2213    if (GLWindow->logScale)
2214    {
2215        minRange *= 9;
2216        maxRange *= 9;
2217//        midRange *= 9;
2218        minRange += 1;
2219        maxRange += 1;
2220//        midRange += 1;
2221        minRange = log10(minRange);
2222        maxRange = log10(maxRange);
2223//        midRange = (minRange + maxRange)/2.f;
2224        midRange = log10(midRange);
2225    }
2226
2227    GLWindow->ss[0] = minRange;
2228    colorRange0->setValue(GLWindow->ss[0]);
2229    GLWindow->ss[4] = maxRange;
2230    colorRange4->setValue(GLWindow->ss[4]);
2231//    GLWindow->ss[2] = midRange;
2232//    range2->setValue(GLWindow->ss[2]);
2233//    GLWindow->ss[1] = (minRange+midRange)/2;
2234//    range1->setValue(GLWindow->ss[1]);
2235//    GLWindow->ss[3] = (maxRange+midRange)/2;
2236//    range3->setValue(GLWindow->ss[3]);
2237
2238    GLWindow->ss[2] = (maxRange+minRange)/2;
2239    colorRange2->setValue(GLWindow->ss[2]);
2240
2241    GLWindow->ss[1] = minRange+(maxRange-minRange)/4;
2242    colorRange1->setValue(GLWindow->ss[1]);
2243
2244    GLWindow->ss[3] = minRange+3*(maxRange-minRange)/4;
2245    colorRange3->setValue(GLWindow->ss[3]);
2246}
2247
2248void PrintUsage()
2249{
2250    cout << "\n"
2251        "The FACT++ raw data viewer.\n"
2252        "\n"
2253        "Usage: viewer [OPTIONS] [datafile.fits[.gz|.fz] [calibration.drs.fits[.gz]]]\n"
2254        "  or:  viewer [OPTIONS]\n";
2255    cout << endl;
2256
2257}
2258
2259void PrintHelp()
2260{
2261    cout <<
2262            "\n"
2263         << endl;
2264}
2265
2266int UIConnector::SetupConfiguration(Configuration &conf)
2267{
2268    RawDataViewer *canvas = GLWindow;
2269
2270    if (conf.Has("mappingFile"))
2271    {
2272        canvas->assignPixelMapFile(conf.Get<string>("mappingFile"));
2273    }
2274    else
2275        canvas->assignPixelMapFile("");
2276
2277    if (!canvas->isFACT())
2278    {
2279        HwIDBox->setMaximum(71);
2280        SwIDBox->setMaximum(71);
2281        SwIDBox->setValue(0);
2282        HwIDBox->setValue(19);
2283        crateIDBox->setMaximum(0);
2284        crateIDBox->setEnabled(false);
2285        boardIDBox->setMaximum(1);
2286    }
2287
2288    if (conf.Has("color.range"))
2289    {
2290        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.range");
2291        if (value.size() != 5)
2292        {
2293            cout << "Error, colorRange option should have exactly 5 double values" << endl;
2294            return -1;
2295        }
2296        for (int i=0;i<5;i++)
2297            canvas->ss[i] = value[i];
2298    }
2299
2300    if (conf.Has("color.red"))
2301    {
2302        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.red");
2303        if (value.size() != 5)
2304        {
2305            cout << "Error, colorRed option should have exactly 5 double values" << endl;
2306            return -1;
2307        }
2308        for (int i=0;i<5;i++)
2309            canvas->rr[i] = value[i];
2310    }
2311
2312    if (conf.Has("color.green"))
2313    {
2314        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.green");
2315        if (value.size() != 5)
2316        {
2317            cout << "Error, colorGreen option should have exactly 5 double values" << endl;
2318            return -1;
2319        }
2320        for (int i=0;i<5;i++)
2321            canvas->gg[i] = value[i];
2322    }
2323
2324    if (conf.Has("color.blue"))
2325    {
2326        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.blue");
2327        if (value.size() != 5)
2328        {
2329            cout << "Error, colorBlue option should have exactly 5 double values" << endl;
2330            return -1;
2331        }
2332        for (int i=0;i<5;i++)
2333            canvas->bb[i] = value[i];
2334    }
2335
2336    colorRange0->setValue(canvas->ss[0]);
2337    colorRange1->setValue(canvas->ss[1]);
2338    colorRange2->setValue(canvas->ss[2]);
2339    colorRange3->setValue(canvas->ss[3]);
2340    colorRange4->setValue(canvas->ss[4]);
2341    redValue0->setValue(canvas->rr[0]);
2342    redValue1->setValue(canvas->rr[1]);
2343    redValue2->setValue(canvas->rr[2]);
2344    redValue3->setValue(canvas->rr[3]);
2345    redValue4->setValue(canvas->rr[4]);
2346    greenValue0->setValue(canvas->gg[0]);
2347    greenValue1->setValue(canvas->gg[1]);
2348    greenValue2->setValue(canvas->gg[2]);
2349    greenValue3->setValue(canvas->gg[3]);
2350    greenValue4->setValue(canvas->gg[4]);
2351    blueValue0->setValue(canvas->bb[0]);
2352    blueValue1->setValue(canvas->bb[1]);
2353    blueValue2->setValue(canvas->bb[2]);
2354    blueValue3->setValue(canvas->bb[3]);
2355    blueValue4->setValue(canvas->bb[4]);
2356
2357    if (conf.Has("drs"))
2358    {
2359        const QString qstr(conf.Get<string>("drs").c_str());
2360        calibFileSelected(qstr);
2361    }
2362
2363    if (conf.Has("file"))
2364    {
2365        const QString qstr(conf.Get<string>("file").c_str());
2366        fileSelected(qstr);
2367    }
2368
2369
2370    return 0;
2371}
2372
2373void SetupConfiguration(Configuration& conf)
2374{
2375    po::options_description configs("Raw Events Viewer Options");
2376    configs.add_options()
2377        ("color.range", vars<double>(), "Range of the display colours")
2378        ("color.red",   vars<double>(), "Range of red values")
2379        ("color.green", vars<double>(), "Range of green values")
2380        ("color.blue",  vars<double>(), "Range of blue values")
2381        ("file,f",      var<string>(),  "File to be loaded")
2382        ("drs,d",       var<string>(),  "DRS calibration file to be loaded")
2383        ("mappingFile", var<string>(),  "Which pixels mapping file to use")
2384        ;
2385    conf.AddOptions(configs);
2386
2387    po::positional_options_description p;
2388    p.add("file", 1); // The first positional options
2389    p.add("drs",  2); // The first positional options
2390    conf.SetArgumentPositions(p);
2391
2392}
2393
2394/************************************************************
2395 * MAIN PROGRAM FUNCTION.
2396 ************************************************************/
2397int main(int argc, const char *argv[])
2398{
2399    QApplication app(argc, const_cast<char**>(argv));
2400
2401    if (!QGLFormat::hasOpenGL()) {
2402        std::cerr << "This system has no OpenGL support" << std::endl;
2403        return 1;
2404    }
2405
2406    Configuration conf(argv[0]);
2407    conf.SetPrintUsage(PrintUsage);
2408    SetupConfiguration(conf);
2409    if (!conf.DoParse(argc, argv, PrintHelp))
2410        return 2;
2411
2412    UIConnector myUi;
2413    if (myUi.SetupConfiguration(conf)<0)
2414        return 3;
2415
2416    return app.exec();
2417}
2418
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.