source: trunk/FACT++/gui/RawEventsViewer/RawEventsViewer.cc @ 19387

Last change on this file since 19387 was 19387, checked in by tbretz, 7 months ago
Prefix file paths if they are not absolute (should not change anything as right now, --prefix is not defined.
File size: 75.2 KB
Line 
1/*
2 * QtGl.cpp
3 *
4 *  Created on: Jul 19, 2011
5 *      Author: lyard
6 *
7 ******
8 */
9#include <math.h>
10#include <fstream>
11
12#include <boost/date_time/local_time/local_time.hpp>
13
14#include "RawEventsViewer.h"
15
16#include <QFileDialog>
17#include <QMouseEvent>
18
19#include <qwt_symbol.h>
20#include <qwt_plot_grid.h>
21#pragma GCC diagnostic push
22#pragma GCC diagnostic ignored "-Woverloaded-virtual"
23#include <qwt_plot_zoomer.h>
24#pragma GCC diagnostic pop
25
26#include "src/Configuration.h"
27#include "externals/factfits.h"
28
29
30using namespace std;
31
32#undef ACTUAL_NUM_PIXELS
33#define ACTUAL_NUM_PIXELS 1440
34
35//bounding box for diplaying the impulse curve
36float bboxMin[2] = {-0.8,-0.9};
37float bboxMax[2] = {0.8,-0.3};
38/************************************************************
39 * CALC BLUR COLOR if in blur display mode, calculate the interpolated
40 * colour for a given vertex
41 ************************************************************/
42void RawDataViewer::calcBlurColor(int pixel,  int vertex)
43{
44    GLfloat color[3];
45    int first, second;
46    first = vertex-1;
47    second = vertex;
48    if (first < 0)
49        first = 5;
50
51    first = neighbors[pixel][first];
52    second = neighbors[pixel][second];
53//    cout << pixel << " " << vertex << " " << "first: " << first << " second: " << second << endl;
54    for (int i=0;i<3;i++)
55        color[i] = pixelsColor[pixel][i];
56    float divide = 1;
57    if (first != -1)
58    {
59        divide++;
60        for (int i=0;i<3;i++)
61            color[i] += pixelsColor[first][i];
62    }
63    if (second != -1)
64    {
65        divide++;
66        for (int i=0;i<3;i++)
67            color[i] += pixelsColor[second][i];
68    }
69    for (int i=0;i<3;i++)
70        color[i] /= divide;
71
72//    cout << color[0] << " " << color[1] << " " << color[2] << endl;
73
74    glColor3fv(color);
75}
76void RawDataViewer::calcMidBlurColor(int pixel, int vertex)
77{
78    GLfloat color[3];
79    int first;
80    first = vertex-1;
81    if (first < 0)
82        first = 5;
83    first = neighbors[pixel][first];
84    for (int i=0;i<3;i++)
85        color[i] = pixelsColor[pixel][i];
86    float divide = 1;
87    if (first != -1)
88    {
89        divide++;
90        for (int i=0;i<3;i++)
91            color[i] += pixelsColor[first][i];
92    }
93    for (int i=0;i<3;i++)
94        color[i] /= divide;
95    glColor3fv(color);
96}
97/************************************************************
98 * DRAW BLURRY HEXAGON. draws a solid hexagon, with interpolated colours
99 ************************************************************/
100void RawDataViewer::drawBlurryHexagon(int index)
101{
102
103//per-pixel mesh
104    GLfloat color[3];
105    for (int i=0;i<3;i++)
106        color[i] = pixelsColor[index][i];
107    glBegin(GL_TRIANGLES);
108    calcBlurColor(index, 0);
109    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][0]]);
110    glColor3fv(color);
111    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
112
113    calcBlurColor(index, 1);
114    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][1]]);
115
116    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][1]]);
117    glColor3fv(color);
118    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
119
120    calcBlurColor(index, 2);
121    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][2]]);
122
123    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][2]]);
124    glColor3fv(color);
125    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
126
127    calcBlurColor(index, 3);
128    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][3]]);
129
130    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][3]]);
131    glColor3fv(color);
132    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
133
134    calcBlurColor(index, 4);
135    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][4]]);
136
137    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][4]]);
138    glColor3fv(color);
139    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
140
141    calcBlurColor(index, 5);
142    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][5]]);
143
144    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][5]]);
145    glColor3fv(color);
146    glVertex2fv(pixelsCoords[index]);
147
148    calcBlurColor(index, 0);
149    glVertex2fv(verticesList[verticesIndices[index][0]]);
150    glEnd();
151
152    return;
153}
154
155/************************************************************
156 * DRAW CAMERA draws all the camera pixels
157 ************************************************************/
158void RawDataViewer::drawCamera(bool alsoWire)
159{
160    glLoadIdentity();
161    if (!drawImpulse)
162    {
163        glTranslatef(0,-0.44,0);
164        glRotatef(cameraRotation, 0,0,-1);
165        if (cameraRotation == 90)
166        {
167            glTranslatef(-0.45,-0.45,0);
168        }
169        if (cameraRotation == -90)
170        {
171            glTranslatef(0.45,-0.45,0);
172        }
173        glScalef(1.5,1.5,1);
174    }
175    else
176    {
177        glRotatef(cameraRotation, 0,0,-1);
178          if (cameraRotation == 90)
179        {
180            glTranslatef(-0.45/1.5,-0.45/1.5,0);
181        }
182        if (cameraRotation == -90)
183        {
184            glTranslatef(0.45/1.5,-0.45/1.5,0);
185        }
186  }
187    glColor3f(0.5,0.5,0.5);
188    glLineWidth(1.0);
189    float color;
190
191    for (int i=0;i<ACTUAL_NUM_PIXELS;i++)
192    {
193        if (!nRoi)
194          color = (float)(i)/(float)(ACTUAL_NUM_PIXELS);
195        else
196
197//        if (_softwareOrdering)
198//            color = float(eventData[nRoi*i + whichSlice] + (VALUES_SPAN/2))/(float)(VALUES_SPAN-1);
199//        else
200            color = float(eventData[nRoi*hardwareMapping[i] + whichSlice]+(VALUES_SPAN/2))/(float)(VALUES_SPAN-1);
201        if (logScale)
202        {
203            color *= 9;
204            color += 1;
205            color = log10(color);
206        }
207
208        if (color < ss[0])
209        {
210            pixelsColor[i][0] = tooLowValueCoulour[0];
211            pixelsColor[i][1] = tooLowValueCoulour[1];
212            pixelsColor[i][2] = tooLowValueCoulour[2];
213            continue;
214        }
215        if (color > ss[4])
216        {
217            pixelsColor[i][0] = tooHighValueCoulour[0];
218            pixelsColor[i][1] = tooHighValueCoulour[1];
219            pixelsColor[i][2] = tooHighValueCoulour[2];
220            continue;
221        }
222        int index = 0;
223        while (ss[index] < color && index < 4)
224            index++;
225        index--;
226        if (index < 0) index = 0;
227        float weight0 = (color-ss[index]) / (ss[index+1]-ss[index]);
228        if (weight0 > 1.0f) weight0 = 1.0f;
229        if (weight0 < 0.0f) weight0 = 0.0f;
230        float weight1 = 1.0f-weight0;
231        pixelsColor[i][0] = weight1*rr[index] + weight0*rr[index+1];
232        pixelsColor[i][1] = weight1*gg[index] + weight0*gg[index+1];
233        pixelsColor[i][2] = weight1*bb[index] + weight0*bb[index+1];
234    }
235
236    for (int i=0;i<ACTUAL_NUM_PIXELS;i++)
237    {
238
239        glColor3fv(pixelsColor[i]);
240        glLoadName(i);
241if (drawBlur)
242    drawBlurryHexagon(i);
243else
244    drawHexagon(i,true);
245
246    }
247    if (!alsoWire)
248        return;
249    glTranslatef(0,0,0.1f);
250    glColor3f(0.0f,0.0f,0.0f);
251    for (int i=0;i<ACTUAL_NUM_PIXELS;i++)
252    {
253
254        drawHexagon(i, false);
255    }
256
257}
258
259/************************************************************
260 * DRAW PIXEL CURVE. draws the raw impulse curve of the currently selected pixel
261 ************************************************************/
262void RawDataViewer::drawPixelCurve()
263{
264    float xRange = bboxMax[0] - bboxMin[0];
265    float yRange = bboxMax[1] - bboxMin[1];
266
267    glBegin(GL_LINES);
268    glLineWidth(1.0f);
269    glColor3f(0.0,0.0,0.0);
270    glVertex2f(bboxMin[0], bboxMin[1]);
271    glVertex2f(bboxMax[0], bboxMin[1]);
272    glVertex2f(bboxMin[0], bboxMin[1]);
273    glVertex2f(bboxMin[0], bboxMax[1]);
274    glVertex2f(bboxMin[0], (bboxMin[1]+bboxMax[1])/2.0f);
275    glVertex2f(bboxMax[0], (bboxMin[1]+bboxMax[1])/2.0f);
276    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*nRoi/(float)(nRoi+nRoiTM),
277               bboxMin[1]);
278    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*nRoi/(float)(nRoi+nRoiTM),
279               bboxMax[1]);
280   glEnd();
281    glTranslatef(0,0,0.1f);
282    if (!nRoi)
283          return;
284     glBegin(GL_LINES);
285    glColor3f(1.0f,1.0f,0.0f);
286    float divideMe = (float)(VALUES_SPAN-1);
287    float plusMe = (float)(VALUES_SPAN)/2;
288    if (divideMe <= 0)
289        divideMe = 1;
290
291    /*
292    if (drawCalibrationLoaded)
293        plusMe += 0;//VALUES_SPAN/2;
294    if (drawCalibrationLoaded && calibrationLoaded)
295    {
296        divideMe /=2;
297        plusMe = 0 ;///=2;
298        }*/
299
300//    int mapping = _softwareOrdering ? selectedPixel : hardwareMapping[selectedPixel];
301    int mapping = hardwareMapping[selectedPixel];
302    const int hw = mapping;
303    const PixelMapEntry& mapEntry = fPixelMap.index(selectedPixel);
304    const int pixelIdInPatch = mapEntry.pixel();
305    const int patchId = mapEntry.patch();
306    const int boardId = mapEntry.board();
307    const int crateId = mapEntry.crate();
308
309    if (selectedPixel != -1)
310    {
311    for (int i=0;i<nRoi-1;i++)
312    {
313        float d1 = eventData[nRoi*hw + i]+plusMe;
314        float d2 = eventData[nRoi*hw + i+1]+plusMe;
315        if (!finite(d1)) d1 = 20000;
316        if (!finite(d2)) d2 = 20000;
317        glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*i/(float)(nRoi+nRoiTM),
318                   bboxMin[1] + yRange*(d1) /divideMe);
319        glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*(i+1)/(float)(nRoi+nRoiTM),
320                   bboxMin[1] + yRange*(d2) /divideMe);
321    }
322    glEnd();
323
324    glColor3f(0.0f, 1.0f, 1.0f);
325    glBegin(GL_LINES);
326    if (pixelIdInPatch == 8)//this channel has a time marker
327    {
328
329        for (int i=0;i<nRoiTM-1;i++)
330        {
331            float d1 = eventData[nRoi*1440 + nRoiTM*(40*crateId + 4*boardId + patchId) + i] + plusMe;
332            float d2 = eventData[nRoi*1440 + nRoiTM*(40*crateId + 4*boardId + patchId) + i+1] + plusMe;
333            if (!finite(d1)) d1 = 20000;
334            if (!finite(d2)) d2 = 20000;
335            glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*(i+nRoi)/(float)(nRoi+nRoiTM),
336                       bboxMin[1] + yRange*(d1)/divideMe);
337            glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*(i+1+nRoi)/(float)(nRoi+nRoiTM),
338                       bboxMin[1] + yRange*(d2) / divideMe);
339        }
340    }
341
342    }
343    glEnd();
344    glTranslatef(0,0,0.1f);
345    glBegin(GL_LINES);
346    glColor3f(1.0,0.0,0.0);
347    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*whichSlice/(float)(nRoi+nRoiTM),
348               bboxMin[1]);
349    glVertex2f(bboxMin[0] + xRange*whichSlice/(float)(nRoi+nRoiTM),
350               bboxMax[1]);
351
352    glEnd();
353
354}
355/************************************************************
356 * CONSTRUCTOR.
357 ************************************************************/
358RawDataViewer::RawDataViewer(QWidget *cParent) : BasicGlCamera(cParent), RMSvalues(1440), Meanvalues(1440), Maxvalues(1440), PosOfMaxvalues(1440), VALUES_SPAN(4096)
359
360{
361
362    whichSlice = 0;
363
364    nRoi = 0;
365    nRoiTM = 0;
366    offSetRoi = 0;
367    eventNum = 0;
368    rowNum = -1;
369    eventStep = 1;
370    selectedPixel = 393;
371    inputFile = NULL;
372    drawPatch = false;
373    drawImpulse = true;
374    drawBlur = false;
375    loopCurrentEvent = false;
376    fIsDrsCalibration = false;
377    SetAutoRefresh(true);
378    runType = "unkown";
379
380
381}
382
383void RawDataViewer::assignPixelMapFile(const string& map)
384{
385    PixelMap mypMap;
386    if (map.empty())
387    {
388        if (!mypMap.Read("FACTmap111030.txt"))
389        {
390            if (!mypMap.Read("/swdev_nfs/FACT++/FACTmap111030.txt"))
391            {
392                if (!mypMap.Read("./FACTmap111030.txt"))
393                {
394                    cerr << "ERROR - Problems reading FACTmap111030.txt" << endl;
395                    exit(-1);
396                }
397            }
398        }
399    }
400    else
401    {
402        if (!mypMap.Read(map))
403        {
404            cerr << "ERROR - Problems reading mapping file '" << map << "'" << endl;
405            exit(-1);
406        }
407    }
408
409    assignPixelMap(mypMap);
410
411    for (int i=0;i<160;i++)
412    {
413        const float color[3] = { 0.5, 0.5, 0.3 };
414
415        for (int j=0;j<3;j++)
416            patchesColor[i][j] = color[j];
417    }
418    //fZeroArray = NULL;
419
420    _softwareOrdering = false;
421}
422/************************************************************
423 *  DESTRUCTOR
424 ************************************************************/
425RawDataViewer::~RawDataViewer()
426{
427    if (inputFile != NULL)
428    {
429        inputFile->close();
430        delete inputFile;
431    }
432    //if (fZeroArray != NULL)
433    //    delete[] fZeroArray;
434}
435/*
436void RawDataViewer::allocateZeroArray()
437{
438    if (fZeroArray == NULL)
439    {
440        fZeroArray = new char[8192];
441    }
442}
443*/
444/************************************************************
445 * PAINT GL. main drawing function.
446 ************************************************************/
447void RawDataViewer::paintGL()
448{
449    //Should not be required, but apparently it helps when piping it through X forwarding
450    glFinish();
451    glClear(GL_COLOR_BUFFER_BIT | GL_DEPTH_BUFFER_BIT);
452    glLoadIdentity();
453
454    glTranslatef(0,0,-0.5);
455
456    if (drawBlur)
457    {
458        glShadeModel(GL_SMOOTH);
459        drawCamera(false);
460    }
461    else
462    {
463        glShadeModel(GL_FLAT);
464        drawCamera(true);
465    }
466    glTranslatef(0,0,0.1f);
467    if (drawPatch)
468        drawPatches();
469    glTranslatef(0,0,0.1f);
470   if (!drawBlur && (selectedPixel != -1))
471   {
472        glLineWidth(1.0f);
473        glColor3f(1.0,1.0,1.0);
474        drawHexagon(selectedPixel, false);
475   }
476   glTranslatef(0,0,0.1f);
477   if (drawImpulse)
478   {
479    //   glRotatef(cameraRotation, 0,0,1);
480       glLoadIdentity();
481       glLineWidth(2.0);
482       drawPixelCurve();
483   }
484   glTranslatef(0,0,0.1f);
485   DrawScale();
486}
487
488/************************************************************
489 * MOUSE PRESS EVENT. mouse click handler.
490 ************************************************************/
491void RawDataViewer::mousePressEvent(QMouseEvent *cEvent)
492{
493    if (cEvent->pos().x() > width()-(width()/50.f))
494    {
495        toggleInterfaceDisplay();
496        return;
497    }
498    lastPos = cEvent->pos();
499    if (setCorrectSlice(cEvent))
500        return;
501    int face = PixelAtPosition(cEvent->pos());
502
503        selectedPixel = face;
504        emit signalCurrentPixel(face);
505
506    updateGL();
507}
508
509/************************************************************
510 * SET CORRECT SLICE. if displayed, figures out if the graph was
511 * clicked, and if so, which slice should be displayed
512 ************************************************************/
513bool RawDataViewer::setCorrectSlice(QMouseEvent* cEvent)
514{
515    if (!drawImpulse)
516        return false;
517    float cx = (float)cEvent->x() * pixelSize - shownSizex/2;
518    float cy = ((float)height()-(float)cEvent->y())*pixelSize - shownSizey/2;
519    if (cx < bboxMin[0] ||
520        cx > bboxMax[0] ||
521        cy < bboxMin[1] ||
522        cy > bboxMax[1])
523        return false;
524    whichSlice = (cx - bboxMin[0])*(nRoi+nRoiTM)/(bboxMax[0] - bboxMin[0]);
525    if (whichSlice >= nRoi)
526        whichSlice = nRoi-1;
527    emit signalCurrentSlice(whichSlice);
528    return true;
529}
530
531/************************************************************
532 * MOUSE MOVE EVENT. used to track the dragging of slices display
533 ************************************************************/
534void RawDataViewer::mouseMoveEvent(QMouseEvent *cEvent)
535{
536    if (cEvent->buttons() & Qt::LeftButton) {
537        setCorrectSlice(cEvent);
538        updateGL();
539    } else if (cEvent->buttons() & Qt::RightButton) {
540        updateGL();
541    }
542    lastPos = cEvent->pos();
543}
544
545/************************************************************
546 * MOUSE DOUBLE CLICK EVENT. used to select pixels
547 ************************************************************/
548void RawDataViewer::mouseDoubleClickEvent(QMouseEvent *cEvent)
549{
550    int face = PixelAtPosition(cEvent->pos());
551    if (face != -1) {
552        selectedPixel = face;
553        emit signalCurrentPixel(face);
554        updateGL();
555        }
556}
557
558/************************************************************
559 * OPEN FILE. opens a new fits file
560 ************************************************************/
561void RawDataViewer::openFile(string file, bool reopen)
562{
563    if (inputFile)
564    {
565        inputFile->close();
566        delete inputFile;
567    }
568    try {
569        inputFile = reopen && fIsDrsCalibration ? new zfits(file, "Events") :  new factfits(file, "Events");
570    }
571    catch (std::runtime_error e)
572    {
573        cout << "Something went wrong while loading fits. Aborting: " << e.what() << endl;
574        return;
575    }
576    if (!*inputFile)
577    {
578        delete inputFile;
579        inputFile = NULL;
580        return;
581    }
582    vector<string> entriesToCheck;
583    if (inputFile->IsCompressedFITS())
584        entriesToCheck.push_back("ZNAXIS2");
585    else
586        entriesToCheck.push_back("NAXIS2");
587    entriesToCheck.push_back("NROI");
588    entriesToCheck.push_back("REVISION");
589    entriesToCheck.push_back("RUNID");
590    entriesToCheck.push_back("NBOARD");
591    entriesToCheck.push_back("NPIX");
592    entriesToCheck.push_back("NROITM");
593    entriesToCheck.push_back("TIMESYS");
594    entriesToCheck.push_back("DATE");
595    entriesToCheck.push_back("NIGHT");
596    entriesToCheck.push_back("CAMERA");
597    entriesToCheck.push_back("DAQ");
598    entriesToCheck.push_back("TSTART");
599    entriesToCheck.push_back("TSTOP");
600
601
602    for (vector<string>::const_iterator it=entriesToCheck.begin(); it != entriesToCheck.end(); it++)
603    {
604        try {
605        if (!inputFile->HasKey(*it)){
606            cout << "Warning: header keyword " << *it << " missing." << endl;
607            }
608        }
609        catch (std::runtime_error e)
610        {
611            cout << e.what() << endl;
612            return;
613        }
614    }
615
616    nRows = 0;
617    if (inputFile->IsCompressedFITS())
618        nRows = inputFile->HasKey("ZNAXIS2") ? inputFile->GetInt("ZNAXIS2") : 0;
619    else
620        nRows = inputFile->HasKey("NAXIS2") ? inputFile->GetInt("NAXIS2") : 0;
621    nRoi =           inputFile->HasKey("NROI") ?  inputFile->GetInt("NROI") : 0;
622    runNumber =      inputFile->HasKey("RUNID") ?  inputFile->GetInt("RUNID") : -1;
623    nTM =            inputFile->HasKey("NTMARK") ? inputFile->GetInt("NTMARK") : 0;
624
625    runType = "unkown";
626    if (inputFile->HasKey("RUNTYPE"))
627    {
628        runType = inputFile->GetStr("RUNTYPE");
629        if (runType == "")
630            runType = "unkown";
631    }
632    firstDataTime =  inputFile->HasKey("TSTART") ? inputFile->GetInt("TSTART") : -1;
633    lastDataTime =   inputFile->HasKey("TSTOP") ? inputFile->GetInt("TSTOP"): -1;
634    nRoiTM =         inputFile->HasKey("NROITM") ? inputFile->GetInt("NROITM") : 0;
635    revision =       inputFile->HasKey("REVISION") ? inputFile->GetInt("REVISION") : -1;
636    builderVersion = inputFile->HasKey("BLDVER") ? inputFile->GetInt("BLDVER") : -1;
637    nBoards =        inputFile->HasKey("NBOARD") ? inputFile->GetInt("NBOARD") : 0;
638    nPixels =        inputFile->HasKey("NPIX") ?  inputFile->GetInt("NPIX") : 0;
639    timeSystem =     inputFile->HasKey("TIMESYS") ? inputFile->GetStr("TIMESYS") : "";
640    creationDate =   inputFile->HasKey("DATE") ? inputFile->GetStr("DATE") : "";
641    nightInt =       inputFile->HasKey("NIGHT") ? inputFile->GetInt("NIGHT") : 0;
642    camera =         inputFile->HasKey("CAMERA") ? inputFile->GetStr("CAMERA") : "";
643    daq =            inputFile->HasKey("DAQ") ? inputFile->GetStr("DAQ") : "";
644    adcCount =       inputFile->HasKey("ADCRANGE") ? inputFile->GetFloat("ADCRANGE") : 2000;
645    if (nPixels == 0)
646    {
647        cout << "could not read num pixels from fits header. Assuming 1440 (FACT)." << endl;
648        nPixels = 1440;
649    }
650    if (nRoi == 0 && !inputFile->HasKey("NROI"))
651    {//let's try to figure out the roi from the column's format
652        const fits::Table::Columns& cols = inputFile->GetColumns();
653        if (cols.find("Data") == cols.end())
654        {
655            cout << "ERROR: Column \"Data\" could not be found. abortin load." << endl;
656            return;
657        }
658        const fits::Table::Columns::const_iterator col = cols.find("Data");
659        if (col->second.type != 'I')
660        {
661            cout << "ERROR: Data Column has type " << col->second.type << " while viewer expects I" << endl;
662            return;
663        }
664        if (col->second.num % nPixels != 0)
665        {
666            cout << "ERROR: Num pixels (" << nPixels << ") does not match Data length (" << col->second.num << "). Aborting" << endl;
667            return;
668        }
669        nRoi = col->second.num/nPixels;
670        cout << "Estimate num samples per pixels to be " << nRoi;
671        _softwareOrdering = true;
672    }
673    else
674        _softwareOrdering = inputFile->Get<string>("ISMC", "F")=="T";
675
676    if (inputFile->HasKey("OFFSET"))
677        offSetRoi = inputFile->GetInt("OFFSET");
678
679    nbOk = 0;//inputFile->GetInt("NBEVTOK");
680    nbRej = 0;//inputFile->GetInt("NBEVTREJ");
681    nbBad = 0;//inputFile->GetInt("NBEVTBAD");
682
683    eventNum = 1;
684
685    eventData.resize(1440*nRoi + 160*nRoiTM);
686    rawEventData.resize(1440*nRoi + 160*nRoiTM);
687    waveLetArray.resize(1024*1440);
688    try
689    {
690        inputFile->SetPtrAddress("Data", rawEventData.data());
691        if (inputFile->HasColumn("EventNum"))
692            inputFile->SetPtrAddress("EventNum", &eventNum);
693        else
694            cout << "Warning: could not find column \"EventNum\"" << endl;
695        if (inputFile->HasColumn("TriggerType"))
696            inputFile->SetPtrAddress("TriggerType", &triggerType);
697        else
698            cout << "Warning: could not find column \"TriggerType\"" << endl;
699        if (inputFile->HasColumn("SoftTrig"))
700            inputFile->SetPtrAddress("SoftTrig", &softTrig);
701        else
702            cout << "Warning: could not find column \"SoftTrig\"" << endl;
703        if (inputFile->HasColumn("BoardTime"))
704            inputFile->SetPtrAddress("BoardTime", boardTime);
705        else
706            cout << "Warning: could not find column \"BoardTime\"" << endl;
707        if (inputFile->HasColumn("StartCellData"))
708            inputFile->SetPtrAddress("StartCellData", startPix);
709        else
710            cout << "Warning: could not find column \"StartCellData\"" << endl;
711        if (inputFile->HasColumn("StartCellTimeMarker"))
712            inputFile->SetPtrAddress("StartCellTimeMarker", startTM);
713        else
714            cout << "Warning: could not find column \"StartCellTimeMarker\"" << endl;
715        if (inputFile->HasColumn("TimeMarker"))
716            inputFile->SetPtrAddress("TimeMarker", rawEventData.data()+1440*nRoi);
717        else
718            cout << "Warning: could not find column \"TimeMarker\"" << endl;
719    }
720    catch (const runtime_error &e)
721    {
722        cout << e.what() << endl;
723        cout << "Loading aborted." << endl;
724
725        nRoi = nRows = 0;
726
727        return;
728    }
729
730    try
731    {
732        pcTime[0] = pcTime[1] = 0;
733        if (inputFile->HasColumn("UnixTimeUTC"))
734            inputFile->SetPtrAddress("UnixTimeUTC", pcTime);
735    }
736    catch (const runtime_error&)
737    {
738            try
739        {
740            if (inputFile->HasColumn("PCTime"))
741                inputFile->SetPtrAddress("PCTime", pcTime);
742            else
743                cout << "Warning: could not find column \"UnixTimeUTC\" nor \"PCTime\"" << endl;
744
745        }
746        catch (const runtime_error&)
747        {
748
749        }
750    }
751
752
753    if (!reopen)
754    {
755        int backupStep = eventStep;
756        rowNum = -1;
757        eventStep = 1;
758        plusEvent();
759        eventStep = backupStep;
760    }
761    else
762        readEvent();
763
764    emit newFileLoaded();
765    emit signalCurrentPixel(selectedPixel);
766}
767
768void RawDataViewer::openCalibFile(string& file)
769{
770    //calibrationLoaded = false;
771    string msg;
772    try
773    {
774        msg = fDrsCalib.ReadFitsImp(file);
775        if (msg.empty())
776        {
777            emit newFileLoaded();
778            updateGL();
779            return;
780        }
781    }
782    catch (const runtime_error &e)
783    {
784        msg = string("Something went wrong while loading Drs Calib: ") + e.what() + string(".. Aborting file loading");
785    }
786    cerr << msg << endl;
787    fDrsCalib.Clear();
788}
789
790template <typename T>
791void RawDataViewer::getCalibrationDataForDisplay(const CalibDataTypes/* calibTypes*/,
792                                                 const vector<T>& inputData,
793                                                 const int roi,
794                                                 const int roiTM)
795{
796    eventData.assign(inputData.begin(), inputData.end());
797    nRoi=roi;
798    nRoiTM=roiTM;
799
800    long long min, max, mean;
801    min = max = inputData[0];
802    mean=0;
803    for (int i=0;i<1440*roi + 160*roiTM;i++) {
804        mean += inputData[i];
805        if (inputData[i] > max)
806            max = inputData[i];
807        if (inputData[i] < min)
808            min = inputData[i];
809    }
810    mean /= 1440*roi + 160*roiTM;
811    for (int i=0;i<1440*roi + 160*roiTM;i++)
812        eventData[i] -= (float)mean;
813    VALUES_SPAN = max - min;
814//    cout << VALUES_SPAN << " " << min << " " << max << " " << mean << endl;
815//    cout << 1440*roi + 160*roiTM << " " << roi << " " << roiTM << " " << inputData.size() << endl;
816}
817/************************************************************
818 * PLUS EVENT
819 ************************************************************/
820void RawDataViewer::plusEvent()
821{
822    eventStepping(true);
823}
824/************************************************************
825 * MINUS EVENT
826 ************************************************************/
827void RawDataViewer::minusEvent()
828{
829    eventStepping(false);
830}
831/************************************************************
832 * SET EVENT STEP
833 ************************************************************/
834void RawDataViewer::setEventStep(int step)
835{
836    eventStep = step;
837}
838/************************************************************
839 * EVENT STEPPING
840 ************************************************************/
841
842void RawDataViewer::ApplyCalibration()
843{
844    eventData.assign(rawEventData.begin(), rawEventData.end());
845
846    if (fIsDrsCalibration)
847    {
848        fDrsCalib.Apply(eventData.data(), rawEventData.data(), startPix, nRoi);
849        DrsCalibrate::RemoveSpikes3(eventData.data(), nRoi*1440);
850        //TODO apply calibration to the Time markers
851    }
852
853    vector<float> pixelStatsData(1440*4);
854    DrsCalibrate::GetPixelStats(pixelStatsData.data(), eventData.data(), nRoi, 15, nRoiTM>0?5:60);
855
856    for (vector<PixelMapEntry>::const_iterator it=fPixelMap.begin(); it!=fPixelMap.end(); it++)
857    {
858        Meanvalues[it->index]     = pixelStatsData[0*1440+it->hw()];
859        RMSvalues[it->index]      = pixelStatsData[1*1440+it->hw()];
860        Maxvalues[it->index]      = pixelStatsData[2*1440+it->hw()];
861        PosOfMaxvalues[it->index] = pixelStatsData[3*1440+it->hw()];
862    }
863
864    if (isVisible())
865        updateGL();
866}
867
868void RawDataViewer::eventStepping(bool plus)
869{
870    if (plus)
871        rowNum += eventStep;
872    else
873        rowNum -= eventStep;
874    if (rowNum >= nRows)
875        rowNum -= nRows;
876    if (rowNum < 0)
877        rowNum += nRows;
878
879    readEvent();
880}
881
882void RawDataViewer::readEvent()
883{
884    if (inputFile == NULL)
885        return;
886    inputFile->GetRow(rowNum);
887    if (_softwareOrdering)
888    {//remap pixels data according to hardware id
889        if (nRoiTM != 0)
890            cout << "Warning: did not expect Time Markers data from Monte-Carlo simulations. These will not be mapped properly." << endl;
891        //first copy the data
892        vector<int16_t> tempData(rawEventData.begin(), rawEventData.begin()+1440*nRoi);
893        //copy back the data and re-map it on the fly
894        for (int i=0;i<1440;i++)
895            for (int j=0;j<nRoi;j++)
896                rawEventData[i*nRoi + j] = tempData[softwareMapping[i]*nRoi + j];
897    }
898//    cout << "Getting row " << rowNum << endl;
899
900
901    ApplyCalibration();
902
903    emit signalCurrentEvent(eventNum);
904    emit signalCurrentPixel(selectedPixel);
905}
906
907/************************************************************
908 * NEXT SLICE. deprec ?
909 ************************************************************/
910void RawDataViewer::nextSlice()
911{
912    whichSlice++;
913    if (whichSlice >= nRoi)
914    {
915        whichSlice = 0;
916        if (!loopCurrentEvent)
917        {
918            int backupStep = eventStep;
919            eventStep = 1;
920            eventStepping(true);
921            eventStep = backupStep;
922        }
923    }
924    emit signalCurrentSlice(whichSlice);
925    updateGL();
926}
927void RawDataViewer::previousSlice()
928{
929    whichSlice--;
930    if (whichSlice < 0)
931    {
932        whichSlice = nRoi-1;
933        if (!loopCurrentEvent)
934        {
935            int backupStep = eventStep;
936            eventStep = 1;
937            eventStepping(false);
938            eventStep = backupStep;
939        }
940    }
941    emit signalCurrentSlice(whichSlice);
942    updateGL();
943}
944void RawDataViewer::setCurrentPixel(int pix)
945{
946 //   if (pix == -1)
947 //       return;
948    selectedPixel = pix;
949    if (isVisible())
950    updateGL();
951     emit signalCurrentPixel(pix);
952}
953/*
954void RawDataViewer::computePulsesStatistics()
955{
956    if (!inputFile)
957    {
958        cout << "A FITS file must be open in order to complete this operation" << endl;
959        return;
960    }
961
962
963//    for (int i=0;i<nRows;i++)//for all events
964//    {
965//        inputFile->GetRow(rowNum);
966//        for (int i=0;i<(1440+160)*nRoi;i++)
967//            eventData[i] = (float)rawEventData[i];
968
969//        for (int j=0;j<ACTUAL_NUM_PIXELS;j++)
970///        {
971    int j = selectedPixel;
972    if (j == -1)
973        return;
974            for (int i=0;i<nRoi;i++)
975            {
976                aMeas[i] = eventData[j*nRoi+i];// * adcCount;
977
978            }
979            for (int i=0;i<nRoi;i++)
980            {
981                if (i==0)
982                    n1mean[i] = aMeas[i+1];
983                else
984                {
985                    if (i==1023)
986                        n1mean[i] = aMeas[i-1];
987                    else
988                        n1mean[i] = (aMeas[i-1]+aMeas[i+1])/2.f;
989                }
990            }
991            //find spike
992            for (int i=0;i<nRoi-3;i++)
993            {
994                const float fract = 0.8f;
995                float xx, xp, xpp;
996                vCorr[i] = 0;//aMeas[i];
997                xx = aMeas[i] - n1mean[i];
998                if (xx < -8.f)
999                {
1000                    xp = aMeas[i+1] - n1mean[i+1];
1001                    xpp = aMeas[i+2] - n1mean[i+2];
1002                    if ((aMeas[i+2] - (aMeas[i] + aMeas[i+3])/2.f) > 10.f)
1003                    {
1004                        vCorr[i+1] = (aMeas[i] + aMeas[i+3])/2.f;
1005                        vCorr[i+2] = (aMeas[i] + aMeas[i+3])/2.f;
1006                        i = i+2;
1007                    }
1008                    else
1009                    {
1010                        if ((xp > -2.*xx*fract) && (xpp < -10.f))
1011                        {
1012                            vCorr[i+1] = n1mean[i+1];
1013                            n1mean[i+2] = aMeas[i+1] - aMeas[i+3]/2.f;
1014                            i++;
1015                        }
1016                    }
1017                }
1018            }
1019            for (int i=0;i<nRoi;i++)
1020                n1mean[i] = aMeas[i]-n1mean[i];
1021 //       }
1022 //   }
1023}
1024*/
1025/************************************************************
1026 * UICONNECTOR CONSTRUCTOR
1027 ************************************************************/
1028UIConnector::UIConnector(QWidget *p)
1029{
1030    setupUi(this);
1031    initHistograms();
1032
1033    updateSpinnerDisplay = true;
1034    updating = false;
1035
1036    timer.setInterval(10.0);
1037    QObject::connect(&timer, SIGNAL(timeout()),
1038                     this, SLOT(nextSlicePlease()));
1039
1040    QButtonGroup &scaleGroup = *new QButtonGroup(p);// = new QButtonGroup(canvas);
1041    QButtonGroup &animateGroup = *new QButtonGroup(p);// = new QButtonGroup(canvas);
1042
1043    scaleGroup.addButton(currentPixelScale);
1044    scaleGroup.addButton(entireCameraScale);
1045
1046    animateGroup.addButton(playEventsRadio);
1047    animateGroup.addButton(playSlicesRadio);
1048    animateGroup.addButton(playPixelsRadio);
1049
1050    entireCameraScale->setChecked(true);
1051
1052    RMS_window->enableText(false);
1053    Mean_window->enableText(false);
1054    PosOfMax_window->enableText(false);
1055    Max_window->enableText(false);
1056
1057 //   RMS_window->ShowPatchCursor(true);
1058
1059    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(colorPaletteHasChanged()),
1060                     this, SLOT(on_autoScaleColor_clicked()));
1061    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(signalCurrentSlice(int)),
1062                     this, SLOT(currentSliceHasChanged(int)));
1063    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(signalCurrentEvent(int)),
1064                     this, SLOT(currentEventHasChanged(int)));
1065    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1066                     this, SLOT(pixelChanged(int)));
1067    QObject::connect(GLWindow, SIGNAL(newFileLoaded()),
1068                     this, SLOT(newFileLoaded()));
1069
1070    QObject::connect(RMS_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1071                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1072    QObject::connect(Max_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1073                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1074    QObject::connect(PosOfMax_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1075                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1076    QObject::connect(Mean_window, SIGNAL(signalCurrentPixel(int)),
1077                     GLWindow, SLOT(setCurrentPixel(int)));
1078
1079
1080
1081    show();
1082}
1083UIConnector::~UIConnector()
1084{
1085    grid1->detach();
1086    grid2->detach();
1087    grid3->detach();
1088    grid4->detach();
1089    grid5->detach();
1090    grid6->detach();
1091    boardsTimeHistoItem.detach();
1092    startCellHistoItem.detach();
1093    startTimeMarkHistoItem.detach();
1094    pixelValueCurveItem.detach();
1095    pixelAverageCurveItem.detach();
1096    aMeanCurveItem.detach();
1097    vCorrCurveItem.detach();
1098    meanCurveItem.detach();
1099}
1100void UIConnector::slicesPlusPlus()
1101{
1102    GLWindow->nextSlice();
1103}
1104void UIConnector::slicesMinusMinus()
1105{
1106    GLWindow->previousSlice();
1107}
1108void UIConnector::on_calibratedCheckBox_stateChanged(int state)
1109{
1110    GLWindow->fIsDrsCalibration = state;
1111
1112    if (currentCalibFile.empty())
1113        GLWindow->openFile(currentFile, true);
1114
1115    GLWindow->ApplyCalibration();
1116
1117    threeD_Window->setData(GLWindow->eventData.data());
1118
1119    if (autoScaleColor->isChecked())
1120        on_autoScaleColor_clicked();
1121    pixelChanged(GLWindow->selectedPixel);
1122
1123}
1124/************************************************************
1125 * DRAW PATCHES CHECK CHANGE. checkbox handler
1126 ************************************************************/
1127void UIConnector::on_drawPatchCheckBox_stateChanged(int state)
1128{
1129    GLWindow->drawPatch = state;
1130    GLWindow->updateGL();
1131    RMS_window->fDrawPatch = state;
1132    RMS_window->updateGL();
1133    Mean_window->fDrawPatch = state;
1134    Mean_window->updateGL();
1135    Max_window->fDrawPatch = state;
1136    Max_window->updateGL();
1137    PosOfMax_window->fDrawPatch = state;
1138    PosOfMax_window->updateGL();
1139}
1140/************************************************************
1141 * DRAW IMPULSE CHECK CHANGE. checkbox handler
1142 ************************************************************/
1143void UIConnector::on_drawImpulseCheckBox_stateChanged(int state)
1144{
1145    GLWindow->drawImpulse = state;
1146    TriggerOffset_window->drawImpulse = state;
1147    Gain_window->drawImpulse = state;
1148    Baseline_window->drawImpulse = state;
1149    GLWindow->updateGL();
1150    TriggerOffset_window->updateGL();
1151    Gain_window->updateGL();
1152    Baseline_window->updateGL();
1153}
1154/************************************************************
1155 * DRAW BLUR CHECK CHANGE. checkbox handler
1156 ************************************************************/
1157void UIConnector::on_drawBlurCheckBox_stateChanged(int state)
1158{
1159    GLWindow->drawBlur = state;
1160    GLWindow->updateGL();
1161}
1162void UIConnector::on_loopOverCurrentEventBox_stateChanged(int state)
1163{
1164    GLWindow->loopCurrentEvent = state;
1165}
1166
1167/************************************************************
1168 * NEXT SLICE PLEASE
1169 ************************************************************/
1170void UIConnector::nextSlicePlease()
1171{
1172    if (playEventsRadio->isChecked ())
1173        GLWindow->eventStepping(true);
1174    else
1175        if (playPixelsRadio->isChecked())
1176            GLWindow->setCurrentPixel((GLWindow->getCurrentPixel()+1)%1440);
1177        else
1178            GLWindow->nextSlice();
1179}
1180
1181/************************************************************
1182 * SET VIEWER.
1183 ************************************************************/
1184//void UIConnector::setViewer(RawDataViewer* v)
1185//{
1186//    viewer = v;
1187//}
1188/************************************************************
1189 * SLICES PER SECOND CHANGED. timing ui handler
1190 ************************************************************/
1191void UIConnector::slicesPerSecondChanged(double value)
1192{
1193    timer.setInterval(1000.0/value);
1194}
1195
1196void UIConnector::on_colorRange0_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1197void UIConnector::on_colorRange1_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1198void UIConnector::on_colorRange2_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1199void UIConnector::on_colorRange3_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1200void UIConnector::on_colorRange4_valueChanged(double value) { GLWindow->ss[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1201
1202void UIConnector::on_redValue0_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1203void UIConnector::on_redValue1_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1204void UIConnector::on_redValue2_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1205void UIConnector::on_redValue3_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1206void UIConnector::on_redValue4_valueChanged(double value) { GLWindow->rr[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1207
1208void UIConnector::on_greenValue0_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1209void UIConnector::on_greenValue1_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1210void UIConnector::on_greenValue2_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1211void UIConnector::on_greenValue3_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1212void UIConnector::on_greenValue4_valueChanged(double value) { GLWindow->gg[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1213
1214void UIConnector::on_blueValue0_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[0] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1215void UIConnector::on_blueValue1_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[1] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1216void UIConnector::on_blueValue2_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[2] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1217void UIConnector::on_blueValue3_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[3] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1218void UIConnector::on_blueValue4_valueChanged(double value) { GLWindow->bb[4] = (float)value; GLWindow->updateGL(); }
1219
1220/************************************************************
1221 * LOAD NEW FILE CLICKED. button handler
1222 ************************************************************/
1223void UIConnector::on_loadNewFileButton_clicked()
1224{
1225    QFileDialog dialog;
1226    dialog.setFileMode(QFileDialog::ExistingFile);
1227    dialog.open(this, SLOT(fileSelected(QString)));
1228    dialog.setVisible(true);
1229    dialog.exec();
1230}
1231void UIConnector::on_loadDRSCalibButton_clicked()
1232{
1233    QFileDialog dialog;
1234    dialog.setFileMode(QFileDialog::ExistingFile);
1235    dialog.open(this, SLOT(calibFileSelected(QString)));
1236    dialog.setVisible(true);
1237    dialog.exec();
1238}
1239/************************************************************
1240 * FILE SELECTED. return of the file open dialog handler
1241 ************************************************************/
1242void UIConnector::fileSelected(QString file)
1243{
1244    const bool reopen = !currentFile.empty();
1245
1246    currentFile = file.toStdString();
1247    if (!currentFile.empty())
1248        GLWindow->openFile(currentFile, reopen && currentCalibFile.empty());
1249}
1250void UIConnector::calibFileSelected(QString file)
1251{
1252    const bool reopen = currentCalibFile.empty();
1253
1254    currentCalibFile = file.toStdString();
1255    if (reopen && !currentFile.empty())
1256        GLWindow->openFile(currentFile, true);
1257    if (currentCalibFile != "")
1258        GLWindow->openCalibFile(currentCalibFile);
1259
1260
1261    if (GLWindow->fDrsCalib.fRoi != 0)
1262    {//spread the calibration data to the displayers
1263        Baseline_window->getCalibrationDataForDisplay(RawDataViewer::CALIB_BASELINE,
1264                                                      GLWindow->fDrsCalib.fOffset,
1265                                                      GLWindow->fDrsCalib.fRoi,
1266                                                      GLWindow->fDrsCalib.fNumTm);
1267
1268        Gain_window->getCalibrationDataForDisplay(RawDataViewer::CALIB_GAIN,
1269                                                  GLWindow->fDrsCalib.fGain,
1270                                                  GLWindow->fDrsCalib.fRoi,
1271                                                  GLWindow->fDrsCalib.fNumTm);
1272
1273        TriggerOffset_window->getCalibrationDataForDisplay(RawDataViewer::CALIB_TRIG_OFFSET,
1274                                                           GLWindow->fDrsCalib.fTrgOff,
1275                                                           GLWindow->fDrsCalib.fRoi,
1276                                                           GLWindow->fDrsCalib.fNumTm);
1277
1278    }
1279}
1280/************************************************************
1281 * NEW FILE LOADED. update of the UI after a new file has been loaded
1282 ************************************************************/
1283void UIConnector::newFileLoaded()
1284{
1285    ostringstream str;
1286
1287    //extract the file name only (no path) from the full name
1288    str << "File: ";
1289    if (currentFile.size() > 2)
1290        str << currentFile.substr(currentFile.find_last_of("//")+1, currentFile.size()) << "\n";
1291    else
1292        str << "--\n";
1293    str << "Calibration: ";
1294    if (currentCalibFile.size() > 2)
1295        str << currentCalibFile.substr(currentCalibFile.find_last_of("//")+1, currentCalibFile.size()) << "\n";
1296    else
1297        str << "--\n";
1298//    fileLoadedLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1299//    str.str("");
1300    str << "Run number: " << GLWindow->runNumber << "\n";
1301//    runNumberLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1302//    str.str("");
1303    str << "Number of Events: " << GLWindow->nRows << "\n";
1304
1305    displayingEventBox->setMaximum(GLWindow->nRows-1);
1306
1307    str << "Number of Slices: " << GLWindow->nRoi << "\n";// << "/1024";
1308//    numberOfSlicesLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1309//    str.str("");
1310    str << "Number of Time Marks: " << GLWindow->nTM << "\n";
1311//    numberOfTimeMarksLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1312
1313//    str.str("");
1314    str << "Run Type: " << GLWindow->runType << "\n";
1315//    runTypeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1316//    str.str("");
1317    str << "Time of 1st data: " << GLWindow->firstDataTime << "\n";
1318//    firstTimeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1319//    str.str("");
1320    str << "Time of last data: " << GLWindow->lastDataTime << "\n";
1321//    lastTimeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1322//    str.str("");
1323    str << "SVN revision: " << GLWindow->revision << '\n';
1324    str << "Number of boards: " << GLWindow->nBoards << '\n';
1325    str << "Number of pixels: " << GLWindow->nPixels << '\n';
1326    str << "Number of Slices TM: " << GLWindow->nRoiTM << '\n';
1327    str << "Time system: " << GLWindow->timeSystem << '\n';
1328    str << "Date: " << GLWindow->creationDate << '\n';
1329    str << "Night: " << GLWindow->nightInt << '\n';
1330    str << "Camera: " << GLWindow->camera << '\n';
1331    str << "DAQ: " << GLWindow->daq << '\n';
1332    str << "ADC Count: " << GLWindow->adcCount << '\n';
1333    str << "NB Evts OK:" << GLWindow->nbOk << '\n';
1334    str << "NB Evts Rejected: " << GLWindow->nbRej << '\n';
1335    str << "NB Evts Bad: " << GLWindow->nbBad << '\n';
1336    extraInfoLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1337
1338    /*
1339    if (GLWindow->calibrationLoaded)
1340    {
1341        drawCalibrationCheckBox->setEnabled(true);
1342    }*/
1343
1344
1345}
1346/************************************************************
1347 * PLAY PAUSE CLICKED. ui handler
1348 ************************************************************/
1349void UIConnector::on_playPauseButton_clicked()
1350{
1351    if (timer.isActive())
1352        timer.stop();
1353    else
1354        timer.start();
1355}
1356
1357void UIConnector::displaySliceValue()
1358{
1359    if (!GLWindow->nRoi)
1360        return;
1361    if (GLWindow->selectedPixel == -1)
1362    {
1363        ostringstream str;
1364        str << " Current Pixel val.: --";
1365        currentPixelValue->setText(QString(str.str().c_str()));
1366        return;
1367    }
1368//    int mapping = GLWindow->_softwareOrdering ? GLWindow->selectedPixel : GLWindow->hardwareMapping[GLWindow->selectedPixel];
1369    int mapping = GLWindow->hardwareMapping[GLWindow->selectedPixel];
1370    const int idx = GLWindow->nRoi*mapping + GLWindow->whichSlice;
1371
1372    ostringstream str;
1373    str << "Current Pixel val.: " << GLWindow->eventData[idx];
1374    currentPixelValue->setText(QString(str.str().c_str()));
1375}
1376
1377/************************************************************
1378 * CURRENT SLICE HAS CHANGE. ui handler
1379 ************************************************************/
1380void UIConnector::currentSliceHasChanged(int slice)
1381{
1382    if (!GLWindow->nRoi)
1383        return;
1384
1385    if (updateSpinnerDisplay)
1386        displayingSliceBox->setValue(slice);
1387
1388    displaySliceValue();
1389}
1390
1391/*****
1392 *******************************************************
1393 * CURRENT EVENT HAS CHANGED. ui handler
1394 ************************************************************/
1395
1396double xval[50000];
1397double yval[50000];
1398void UIConnector::on_displayingEventBox_valueChanged(int cEvent)
1399{
1400//    cout << "Here " << updateSpinnerDisplay << endl;
1401    if (!updateSpinnerDisplay)
1402        return;
1403    updateSpinnerDisplay = false;
1404//    currentEventHasChanged(cEvent);
1405    GLWindow->rowNum = cEvent - GLWindow->eventStep;
1406    GLWindow->eventStepping(true);
1407    updateSpinnerDisplay = true;
1408
1409//    GLWindow->updateGL();
1410}
1411void UIConnector::on_slicesPerSecValue_valueChanged(double value)
1412{
1413    timer.setInterval(1000.0/value);
1414}
1415void UIConnector::on_displayingSliceBox_valueChanged(int cSlice)
1416{
1417    updateSpinnerDisplay = false;
1418    currentSliceHasChanged(cSlice);
1419    updateSpinnerDisplay = true;
1420    GLWindow->whichSlice = cSlice;
1421    GLWindow->updateGL();
1422}
1423void UIConnector::currentEventHasChanged(int )
1424{
1425
1426    RMS_window->SetData(GLWindow->RMSvalues);
1427    Mean_window->SetData(GLWindow->Meanvalues);
1428    PosOfMax_window->SetData(GLWindow->PosOfMaxvalues);
1429    Max_window->SetData(GLWindow->Maxvalues);
1430    threeD_Window->setData(GLWindow->eventData.data());//rawEventData);
1431
1432    if (RMS_window->isVisible())
1433        RMS_window->updateGL();
1434    if (Mean_window->isVisible())
1435        Mean_window->updateGL();
1436    if (PosOfMax_window->isVisible())
1437        PosOfMax_window->updateGL();
1438    if (Max_window->isVisible())
1439        Max_window->updateGL();
1440    ostringstream str;
1441//    str << "Displaying Event " << cEvent;
1442//    QString qstr(str.str().c_str());
1443//    emit updateCurrentEventDisplay(qstr);
1444    if (updateSpinnerDisplay)
1445    {
1446        updateSpinnerDisplay = false;
1447        displayingEventBox->setValue(GLWindow->rowNum);
1448        updateSpinnerDisplay = true;
1449    }
1450
1451 //   GLWindow->doWaveLetOnCurrentEventPlease();
1452
1453        //retrieve the data that we want to display
1454    boost::posix_time::ptime hrTime( boost::gregorian::date(1970, boost::gregorian::Jan, 1),
1455            boost::posix_time::seconds(GLWindow->pcTime[0]) +  boost::posix_time::microsec(GLWindow->pcTime[1]));
1456
1457    str.str("");
1458    str << "PC Time: " << boost::posix_time::to_iso_extended_string(hrTime);
1459    PCTimeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1460
1461    str.str("");
1462    str << "Software Trigger: " << GLWindow->softTrig;
1463    softwareTriggerLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1464
1465    str.str("");
1466    str << "Trigger Type: " << GLWindow->triggerType;
1467    triggerTypeLabel->setText(QString(str.str().c_str()));
1468
1469    displaySliceValue();
1470
1471    if (autoScaleColor->isChecked())
1472        emit GLWindow->colorPaletteHasChanged();//autoScalePressed();
1473
1474    boardsTimeList->clear();
1475    startPixelsList->clear();
1476    startTimeMarksList->clear();
1477    triggerDelayList->clear();
1478    std::map<int, int> boardsHistoMap;
1479    for (int i=0;i <NBOARDS; i++)
1480    {
1481        str.str("");
1482        str << i;
1483        if (i<10) str << " ";
1484        if (i<100) str << " ";
1485        if (i<1000) str << " ";
1486        str << ": " << GLWindow->boardTime[i];
1487        boardsTimeList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1488        if (boardsHistoMap.find(GLWindow->boardTime[i]) != boardsHistoMap.end())
1489            boardsHistoMap[GLWindow->boardTime[i]]++;
1490        else
1491            boardsHistoMap[GLWindow->boardTime[i]] = 1;
1492    }
1493    std::map<int, int> pixelHistoMap;
1494    for (int i=0;i <NPIX; i++)
1495    {
1496        str.str("");
1497        str << i;
1498        if (i<10) str << " ";
1499        if (i<100) str << " ";
1500        if (i<1000) str << " ";
1501        str << ": " << GLWindow->startPix[i];
1502        startPixelsList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1503        if (pixelHistoMap.find(GLWindow->startPix[i]) != pixelHistoMap.end())
1504            pixelHistoMap[GLWindow->startPix[i]]++;
1505        else
1506            pixelHistoMap[GLWindow->startPix[i]] = 1;
1507    }
1508
1509    std::map<int, int> timeMarksMap;
1510    for (int i=0;i <NTMARK; i++)
1511    {
1512        str.str("");
1513        str << i;
1514        if (i<10) str << " ";
1515        if (i<100) str << " ";
1516        if (i<1000) str << " ";
1517        str << ": " << GLWindow->startTM[i];
1518        startTimeMarksList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1519        if (timeMarksMap.find(GLWindow->startTM[i]) != timeMarksMap.end())
1520            timeMarksMap[GLWindow->startTM[i]]++;
1521        else
1522            timeMarksMap[GLWindow->startTM[i]] = 1;
1523    }
1524    std::map<int,int> delayMap;
1525    triggerDelayList->addItem(QString("Patch | Slice:Delay Slice:Delay..."));
1526    for (int i=0;i<NTMARK; i++)
1527    {
1528        str.str("");
1529        str << i << " | ";
1530        for (int j=0;j<GLWindow->nRoiTM;j++)
1531        {
1532            int value = GLWindow->eventData[1440*GLWindow->nRoi + i*GLWindow->nRoiTM + j];
1533            if (delayMap.find(value) != delayMap.end())
1534                 delayMap[value]++;
1535             else
1536                 delayMap[value] = 1;
1537            str << j << ":" << value << " ";
1538         }
1539        triggerDelayList->addItem(QString(str.str().c_str()));
1540    }
1541
1542    std::map<int,int>::iterator it = boardsHistoMap.begin();
1543    int nsamples = 0;
1544    int previousValue = it->first-10;
1545    for (unsigned int i=0;i<boardsHistoMap.size();i++)
1546    {
1547        if (previousValue != it->first-1)
1548        {
1549            xval[nsamples] = previousValue+1;
1550            yval[nsamples] = 0;
1551            nsamples++;
1552            xval[nsamples] = it->first-1;
1553            yval[nsamples] = 0;
1554            nsamples++;
1555        }
1556        xval[nsamples] = it->first;
1557        yval[nsamples] = it->second;
1558        previousValue = it->first;
1559        it++;
1560        nsamples++;
1561        xval[nsamples] = previousValue;
1562        yval[nsamples] = 0;
1563        nsamples++;
1564        if (nsamples > 4090)
1565        {
1566            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1567            break;
1568        }
1569    }
1570    xval[nsamples] = it==boardsHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1571    yval[nsamples] = 0;
1572    nsamples++;
1573 //   if (nsamples > 5)
1574#if QWT_VERSION < 0x060000
1575       boardsTimeHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1576#else
1577       boardsTimeHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1578#endif
1579
1580    it = pixelHistoMap.begin();
1581    nsamples = 0;
1582    previousValue = it->first-10;
1583    for (unsigned int i=0;i<pixelHistoMap.size();i++)
1584    {
1585        if (previousValue != it->first-1)
1586        {
1587            xval[nsamples] = previousValue+1;
1588            yval[nsamples] = 0;
1589            nsamples++;
1590            xval[nsamples] = it->first-1;
1591            yval[nsamples] = 0;
1592            nsamples++;
1593        }
1594        xval[nsamples] = it->first;
1595        yval[nsamples] = it->second;
1596        previousValue = it->first;
1597        it++;
1598        nsamples++;
1599        xval[nsamples] = previousValue;
1600        yval[nsamples] = 0;
1601        nsamples++;
1602        if (nsamples > 4090)
1603        {
1604            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1605            break;
1606        }
1607   }
1608    xval[nsamples] = it==pixelHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1609    yval[nsamples] = 0;
1610    nsamples++;
1611//    if (nsamples > 5)
1612#if QWT_VERSION < 0x060000
1613       startCellHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1614#else
1615       startCellHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1616#endif
1617
1618    it = timeMarksMap.begin();
1619    nsamples = 0;
1620    previousValue = it->first-10;
1621    for (unsigned int i=0;i<timeMarksMap.size();i++)
1622    {
1623        if (previousValue != it->first-1)
1624        {
1625            xval[nsamples] = previousValue+1;
1626            yval[nsamples] = 0;
1627            nsamples++;
1628            xval[nsamples] = it->first-1;
1629            yval[nsamples] = 0;
1630            nsamples++;
1631        }
1632        xval[nsamples] = it->first;
1633        yval[nsamples] = it->second;
1634        previousValue = it->first;
1635        it++;
1636        nsamples++;
1637        xval[nsamples] = previousValue;
1638        yval[nsamples] = 0;
1639        nsamples++;
1640        if (nsamples > 4090)
1641        {
1642            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1643            break;
1644        }
1645    }
1646    xval[nsamples] = it==timeMarksMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1647    yval[nsamples] = 0;
1648    nsamples++;
1649 //   if (nsamples > 5)
1650#if QWT_VERSION < 0x060000
1651       startTimeMarkHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1652#else
1653       startTimeMarkHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1654#endif
1655
1656    it = delayMap.begin();
1657    nsamples = 0;
1658    previousValue = it->first-10;
1659    for (unsigned int i=0;i<delayMap.size();i++)
1660    {
1661        if (previousValue != it->first-1)
1662        {
1663            xval[nsamples] = previousValue+1;
1664            yval[nsamples] = 0;
1665            nsamples++;
1666            xval[nsamples] = it->first-1;
1667            yval[nsamples] = 0;
1668            nsamples++;
1669        }
1670        xval[nsamples] = it->first;
1671        yval[nsamples] = it->second;
1672        previousValue = it->first;
1673        it++;
1674        nsamples++;
1675        xval[nsamples] = previousValue;
1676        yval[nsamples] = 0;
1677        nsamples++;
1678        if (nsamples > 4090)
1679        {
1680            cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1681            break;
1682        }
1683    }
1684    xval[nsamples] = it==delayMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1685    yval[nsamples] = 0;
1686    nsamples++;
1687  //  if (nsamples > 5)
1688#if QWT_VERSION < 0x060000
1689       triggerDelayHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1690#else
1691       triggerDelayHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1692#endif
1693       //WAVELETS HACK
1694/*       std::map<int, int> valuesHistoMap;
1695       std::map<int, int> waveletHistoMap;
1696       for (int i=0;i<1024*1440;i++)
1697       {
1698           if (valuesHistoMap.find(GLWindow->rawEventData[i]) != valuesHistoMap.end())
1699               valuesHistoMap[GLWindow->rawEventData[i]]++;
1700           else
1701               valuesHistoMap[GLWindow->rawEventData[i]] = 1;
1702           if (waveletHistoMap.find(GLWindow->waveLetArray[i]) != waveletHistoMap.end())
1703               waveletHistoMap[GLWindow->waveLetArray[i]]++;
1704           else
1705               waveletHistoMap[GLWindow->waveLetArray[i]] = 1;
1706       }
1707
1708       it = valuesHistoMap.begin();
1709       nsamples = 0;
1710       previousValue = it->first-10;
1711       cout << "Num values Original: " << valuesHistoMap.size() << endl;
1712       for (unsigned int i=0;i<valuesHistoMap.size();i++)
1713       {
1714           if (previousValue != it->first-1)
1715           {
1716               xval[nsamples] = previousValue+1;
1717               yval[nsamples] = 0;
1718               nsamples++;
1719               xval[nsamples] = it->first-1;
1720               yval[nsamples] = 0;
1721               nsamples++;
1722           }
1723           xval[nsamples] = it->first;
1724           yval[nsamples] = it->second;
1725           previousValue = it->first;
1726           it++;
1727           nsamples++;
1728           xval[nsamples] = previousValue;
1729           yval[nsamples] = 0;
1730           nsamples++;
1731           if (nsamples > 50000)
1732           {
1733               cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1734               break;
1735           }
1736       }
1737       xval[nsamples] = it==valuesHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1738       yval[nsamples] = 0;
1739       nsamples++;
1740     //  if (nsamples > 5)
1741   #if QWT_VERSION < 0x060000
1742          triggerDelayHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1743   #else
1744          triggerDelayHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1745   #endif
1746
1747          it = waveletHistoMap.begin();
1748          nsamples = 0;
1749          previousValue = it->first-10;
1750          cout << "Num values WaveLets: " << waveletHistoMap.size() << endl;
1751          for (unsigned int i=0;i<waveletHistoMap.size();i++)
1752          {
1753              if (previousValue != it->first-1)
1754              {
1755                  xval[nsamples] = previousValue+1;
1756                  yval[nsamples] = 0;
1757                  nsamples++;
1758                  xval[nsamples] = it->first-1;
1759                  yval[nsamples] = 0;
1760                  nsamples++;
1761              }
1762              xval[nsamples] = it->first;
1763              yval[nsamples] = it->second;
1764              previousValue = it->first;
1765              it++;
1766              nsamples++;
1767              xval[nsamples] = previousValue;
1768              yval[nsamples] = 0;
1769              nsamples++;
1770              if (nsamples > 50000)
1771              {
1772                  cout << "Error: Maximum number of samples reached for histograms. skipping what's remaining" << endl;
1773                  break;
1774              }
1775          }
1776          xval[nsamples] = it==waveletHistoMap.begin() ? 0 : (--it)->first+1;
1777          yval[nsamples] = 0;
1778          nsamples++;
1779        //  if (nsamples > 5)
1780      #if QWT_VERSION < 0x060000
1781          startTimeMarkHistoItem.setData(xval, yval, nsamples);
1782      #else
1783          startTimeMarkHistoItem.setSamples(xval, yval, nsamples);
1784      #endif
1785*/
1786//END OF WAVELETS HACK
1787       //    startCellHistoZoom->setZoomBase(startCellHistoItem.boundingRect());
1788    QStack< QRectF > stack;
1789//    QRectF cRectangle = boardsTimeHistoItem.boundingRect();
1790    stack.push(scaleBoundingRectangle(boardsTimeHistoItem.boundingRect(), 1.05f));//cRectangle);//boardsTimeHistoItem.boundingRect());
1791    boardsTimeHistoZoom->setZoomStack(stack);
1792    stack.pop();
1793    stack.push(scaleBoundingRectangle(startCellHistoItem.boundingRect(), 1.05f));
1794    startCellHistoZoom->setZoomStack(stack);
1795    stack.pop();
1796    stack.push(scaleBoundingRectangle(startTimeMarkHistoItem.boundingRect(), 1.05f));
1797    startTimeMarkHistoZoom->setZoomStack(stack);
1798    stack.pop();
1799    stack.push(scaleBoundingRectangle(triggerDelayHistoItem.boundingRect(), 1.05f));
1800    triggerDelayHistoZoom->setZoomStack(stack);
1801    stack.pop();
1802
1803    pixelChanged(GLWindow->selectedPixel);
1804}
1805//can't use a ref to rectangle, as the type must be converted first
1806QRectF UIConnector::scaleBoundingRectangle(QRectF rectangle, float scale)
1807{
1808    QPointF bottomRight = rectangle.bottomRight();
1809    QPointF topLeft = rectangle.topLeft();
1810    QPointF center = rectangle.center();
1811    return QRectF(topLeft + (topLeft-center)*(scale-1.0f), //top left
1812                  bottomRight + (bottomRight-center)*(scale-1.0f)); //bottom right
1813}
1814void UIConnector::initHistograms()
1815{
1816//    QwtPlot*     boardsTimeHisto;
1817//    QwtPlotHistogram boardsTimeHistoItem;
1818    grid1 = new QwtPlotGrid;
1819    grid1->enableX(false);
1820    grid1->enableY(true);
1821    grid1->enableXMin(false);
1822    grid1->enableYMin(false);
1823    grid1->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1824    grid1->attach(boardsTimeHisto);
1825
1826    grid2 = new QwtPlotGrid;
1827    grid2->enableX(false);
1828    grid2->enableY(true);
1829    grid2->enableXMin(false);
1830    grid2->enableYMin(false);
1831    grid2->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1832    grid2->attach(startCellsHisto);
1833
1834    grid3 = new QwtPlotGrid;
1835    grid3->enableX(false);
1836    grid3->enableY(true);
1837    grid3->enableXMin(false);
1838    grid3->enableYMin(false);
1839    grid3->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1840    grid3->attach(startTimeMarkHisto);
1841
1842    grid4 = new QwtPlotGrid;
1843    grid4->enableX(false);
1844    grid4->enableY(true);
1845    grid4->enableXMin(false);
1846    grid4->enableYMin(false);
1847    grid4->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1848    grid4->attach(pixelValueCurve);
1849
1850    grid6 = new QwtPlotGrid;
1851    grid6->enableX(false);
1852    grid6->enableY(true);
1853    grid6->enableXMin(false);
1854    grid6->enableYMin(false);
1855    grid6->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1856    grid6->attach(pixelAverageCurve);
1857
1858    grid5 = new QwtPlotGrid;
1859    grid5->enableX(false);
1860    grid5->enableY(true);
1861    grid5->enableXMin(false);
1862    grid5->enableYMin(false);
1863    grid5->setMajPen(QPen(Qt::black, 0, Qt::DotLine));
1864    grid5->attach(triggerDelayHisto);
1865
1866    boardsTimeHisto->setAutoReplot(true);
1867    startCellsHisto->setAutoReplot(true);
1868    startTimeMarkHisto->setAutoReplot(true);
1869    pixelValueCurve->setAutoReplot(true);
1870    pixelAverageCurve->setAutoReplot(true);
1871    triggerDelayHisto->setAutoReplot(true);
1872    boardsTimeHisto->setTitle("Boards time values");
1873    startCellsHisto->setTitle("Start Cell values");
1874    startTimeMarkHisto->setTitle("Start Time Marks values");
1875    pixelValueCurve->setTitle("Current pixel values");
1876    pixelAverageCurve->setTitle("Average pixels values");
1877    triggerDelayHisto->setTitle("Trigger Delays");
1878
1879 //   boardsTimeHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1880//    startCellHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1881//    startTimeMarkHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1882//    triggerDelayHistoItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1883//    pixelValueCurveItem.setBrush(QBrush(Qt::red));
1884
1885    boardsTimeHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1886    boardsTimeHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1887    startCellHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1888    startCellHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1889    startTimeMarkHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1890    startTimeMarkHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1891    triggerDelayHistoItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1892    triggerDelayHistoItem.setStyle(QwtPlotCurve::Steps);
1893
1894    boardsTimeHistoItem.attach(boardsTimeHisto);
1895    startCellHistoItem.attach(startCellsHisto);
1896    startTimeMarkHistoItem.attach(startTimeMarkHisto);
1897    triggerDelayHistoItem.attach(triggerDelayHisto);
1898
1899    //curve
1900//    pixelValueCurveItem.setSymbol(new QwtSymbol(QwtSymbol::Cross, Qt::NoBrush, QPen(Qt::black), QSize(5,5)));
1901    pixelValueCurveItem.setPen(QColor(Qt::black));
1902    pixelAverageCurveItem.setPen(QColor(Qt::black));
1903    aMeanCurveItem.setPen(QColor(Qt::darkGreen));
1904    vCorrCurveItem.setPen(QColor(Qt::red));
1905    meanCurveItem.setPen(QColor(Qt::blue));
1906    pixelValueCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1907    pixelAverageCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1908    aMeanCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1909    vCorrCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1910    meanCurveItem.setStyle(QwtPlotCurve::Lines);
1911
1912//    pixelValueCurveItem.setCurveAttribute(QwtPlotCurve::Fitted);
1913    pixelValueCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1914    pixelAverageCurveItem.attach(pixelAverageCurve);
1915//    aMeanCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1916 //   vCorrCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1917//    meanCurveItem.attach(pixelValueCurve);
1918
1919    //FIXME delete these pointers with the destructor
1920    curveZoom = new QwtPlotZoomer(pixelValueCurve->canvas());
1921    curveZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1922    curveZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1923    averageCurveZoom = new QwtPlotZoomer(pixelAverageCurve->canvas());
1924    averageCurveZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1925    averageCurveZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1926
1927    boardsTimeHistoZoom = new QwtPlotZoomer(boardsTimeHisto->canvas());
1928    boardsTimeHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1929    boardsTimeHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1930
1931    startCellHistoZoom = new QwtPlotZoomer(startCellsHisto->canvas());
1932    startCellHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1933    startCellHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1934
1935    startTimeMarkHistoZoom = new QwtPlotZoomer(startTimeMarkHisto->canvas());
1936    startTimeMarkHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1937    startTimeMarkHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1938
1939    triggerDelayHistoZoom = new QwtPlotZoomer(triggerDelayHisto->canvas());
1940    triggerDelayHistoZoom->setRubberBandPen(QPen(Qt::gray, 2, Qt::DotLine));
1941    triggerDelayHistoZoom->setTrackerPen(QPen(Qt::gray));
1942
1943
1944}
1945
1946void UIConnector::pixelChanged(int pixel)
1947{
1948    RMS_window->fWhite = pixel;
1949    Mean_window->fWhite = pixel;
1950    Max_window->fWhite = pixel;
1951    PosOfMax_window->fWhite = pixel;
1952    if (pixel != -1)
1953    {
1954        RMS_window->fWhitePatch = RMS_window->pixelsPatch[pixel];
1955        Mean_window->fWhitePatch = Mean_window->pixelsPatch[pixel];
1956        Max_window->fWhitePatch = Max_window->pixelsPatch[pixel];
1957        PosOfMax_window->fWhitePatch = PosOfMax_window->pixelsPatch[pixel];
1958    }
1959    else
1960    {
1961        RMS_window->fWhitePatch = -1;
1962        Mean_window->fWhitePatch = -1;
1963        Max_window->fWhitePatch = -1;
1964        PosOfMax_window->fWhitePatch = -1;
1965    }
1966    if (pixel == -1)
1967        return;
1968    int softwarePix = pixel;
1969//    if (!GLWindow->_softwareOrdering)
1970        pixel = GLWindow->hardwareMapping[pixel];
1971
1972    HwIDBox->setValue(pixel);
1973
1974    if (!GLWindow->nRoi)
1975        return;
1976
1977int currentPixel = pixel;
1978
1979    for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
1980    {
1981        xval[i] = i;
1982        yval[i] = GLWindow->eventData[GLWindow->nRoi*currentPixel + i];
1983    }
1984
1985int realNumSamples = GLWindow->nRoi;
1986    if (GLWindow->nRoiTM != 0)
1987    {
1988        const PixelMapEntry& mapEntry = GLWindow->fPixelMap.index(softwarePix);
1989        const int pixelIdInPatch = mapEntry.pixel();
1990        const int patchId = mapEntry.patch();
1991        const int boardId = mapEntry.board();
1992        const int crateId = mapEntry.crate();
1993        if (pixelIdInPatch == 8)
1994        {
1995            int TMIndex = 0;
1996            int xIndex = GLWindow->nRoi;
1997            int arrayIndex = GLWindow->nRoi;
1998            if (GLWindow->offSetRoi < 0)
1999                TMIndex -= GLWindow->offSetRoi;
2000            if (GLWindow->offSetRoi > 0)
2001                xIndex += GLWindow->offSetRoi;
2002            for (int i=TMIndex;i<GLWindow->nRoiTM;i++, xIndex++, arrayIndex++)
2003            {
2004                xval[arrayIndex] = xIndex;
2005                yval[arrayIndex] = GLWindow->eventData[GLWindow->nRoi*1440 + GLWindow->nRoiTM*(40*crateId + 4*boardId + patchId) + i];
2006            }
2007            realNumSamples += GLWindow->nRoiTM - TMIndex;
2008        }
2009      //  cout << pixelIdInPatch << " " ;
2010    }
2011
2012#if QWT_VERSION < 0x060000
2013    pixelValueCurveItem.setData(xval, yval, realNumSamples);
2014#else
2015       pixelValueCurveItem.setSamples(xval, yval, realNumSamples);
2016#endif
2017
2018//now compute the average value of all pixels
2019       currentPixel = 0;
2020       for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2021           yval[i] = 0;
2022       for (int j=0;j<1440;j++) {
2023           currentPixel = j;
2024           for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2025           {
2026               xval[i] = i;
2027               yval[i] += GLWindow->eventData[GLWindow->nRoi*currentPixel + i];
2028           }
2029       }
2030       for (int i=0;i<GLWindow->nRoi;i++)
2031           yval[i] /= 1440;
2032#if QWT_VERSION < 0x060000
2033       pixelAverageCurveItem.setData(xval, yval, GLWindow->nRoi);
2034#else
2035    pixelAverageCurveItem.setSamples(xval, yval, realNumSamples);
2036#endif
2037
2038    QStack< QRectF > stack;
2039    stack.push(scaleBoundingRectangle(pixelValueCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2040    curveZoom->setZoomBase(scaleBoundingRectangle(pixelValueCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2041    curveZoom->setZoomStack(stack);
2042    stack.pop();
2043    stack.push(scaleBoundingRectangle(pixelAverageCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2044    averageCurveZoom->setZoomBase(scaleBoundingRectangle(pixelAverageCurveItem.boundingRect(), 1.5f));
2045    averageCurveZoom->setZoomStack(stack);
2046    stack.pop();
2047
2048    displaySliceValue();
2049    if (autoScaleColor->isChecked())
2050        on_autoScaleColor_clicked();
2051}
2052
2053void UIConnector::on_HwIDBox_valueChanged(int)
2054{
2055    updating = true;
2056
2057    const int hwID = HwIDBox->value();
2058
2059    const int crateID =  hwID/360;
2060    const int boardID = (hwID%360)/36;
2061    const int patchID = (hwID%36 )/9;
2062    const int pixelID =  hwID%9;
2063
2064    SwIDBox->setValue(GLWindow->softwareMapping[hwID]);
2065
2066    crateIDBox->setValue(crateID);
2067    boardIDBox->setValue(boardID);
2068    patchIDBox->setValue(patchID);
2069    pixelIDBox->setValue(pixelID);
2070
2071    updating = false;
2072
2073    GLWindow->selectedPixel = GLWindow->softwareMapping[hwID];
2074    GLWindow->updateGL();
2075
2076    pixelChanged(GLWindow->selectedPixel);
2077}
2078
2079void UIConnector::cbpxChanged()
2080{
2081    if (updating)
2082        return;
2083
2084    const int hwid = crateIDBox->value()*360 + boardIDBox->value()*36 + patchIDBox->value()*9 + pixelIDBox->value();
2085    HwIDBox->setValue(hwid);
2086}
2087
2088void UIConnector::on_SwIDBox_valueChanged(int swid)
2089{
2090    if (updating)
2091        return;
2092
2093//    if (GLWindow->_softwareOrdering)
2094//        HwIDBox->setValue(swid);
2095//    else
2096        HwIDBox->setValue(GLWindow->hardwareMapping[swid]);
2097}
2098
2099void UIConnector::on_autoScaleColor_clicked()
2100{
2101    if (!autoScaleColor->isChecked())
2102    {
2103        GLWindow->ss[0] = 0.496;
2104        GLWindow->ss[1] = 0.507;
2105        GLWindow->ss[2] = 0.518;
2106        GLWindow->ss[3] = 0.529;
2107        GLWindow->ss[4] = 0.540;;
2108        colorRange0->setValue(GLWindow->ss[0]);
2109        colorRange1->setValue(GLWindow->ss[1]);
2110        colorRange2->setValue(GLWindow->ss[2]);
2111        colorRange3->setValue(GLWindow->ss[3]);
2112        colorRange4->setValue(GLWindow->ss[4]);
2113        return;
2114    }
2115    if (!GLWindow->nRoi)
2116        return;
2117
2118    int start = 0;
2119    int end   = 1440;
2120
2121    if (!entireCameraScale->isChecked())
2122    {
2123        start = GLWindow->selectedPixel;
2124        end   = GLWindow->selectedPixel+1;
2125        if (end == 0)
2126        {
2127            start = 0;
2128            end = 1440;
2129        }
2130    }
2131
2132    int min =  100000; //real min = -2048, int_16 = -32768 to 32767
2133    int max = -100000; //real max = 2047
2134
2135    long average = 0;
2136    long numSamples = 0;
2137    int errorDetected = -1;
2138
2139    for (int i=start;i<end;i++)
2140    {
2141        if (i==863)//keep crazy pixel out of the autoscale
2142            continue;
2143        for (int j=10;j<GLWindow->nRoi-50;j++)
2144        {
2145            int cValue = GLWindow->eventData[i*GLWindow->nRoi+j];
2146            if (cValue > max && cValue < 32767)
2147                max = cValue;
2148            if (cValue < min && cValue > -32768)
2149               min = cValue;
2150            if (cValue < 32767 && cValue > -32768)
2151            {
2152                average+=cValue;
2153                numSamples++;
2154            }
2155            else
2156            {
2157                errorDetected = i;
2158            }
2159//            numSamples++;
2160        }
2161    }
2162    average /= numSamples;
2163    if (errorDetected != -1)
2164    {
2165        cout << "Overflow detected at pixel " << errorDetected << " (at least)" << endl;
2166    }
2167//    cout << "min: " << min << " max: " << max << " average: " << average << endl;
2168    float minRange = (float)(min+(GLWindow->VALUES_SPAN/2))/(float)(GLWindow->VALUES_SPAN-1);
2169    float maxRange = (float)(max+(GLWindow->VALUES_SPAN/2))/(float)(GLWindow->VALUES_SPAN-1);
2170    float midRange = (float)(average+(GLWindow->VALUES_SPAN/2))/(float)(GLWindow->VALUES_SPAN-1);
2171    if (GLWindow->logScale)
2172    {
2173        minRange *= 9;
2174        maxRange *= 9;
2175//        midRange *= 9;
2176        minRange += 1;
2177        maxRange += 1;
2178//        midRange += 1;
2179        minRange = log10(minRange);
2180        maxRange = log10(maxRange);
2181//        midRange = (minRange + maxRange)/2.f;
2182        midRange = log10(midRange);
2183    }
2184
2185    GLWindow->ss[0] = minRange;
2186    colorRange0->setValue(GLWindow->ss[0]);
2187    GLWindow->ss[4] = maxRange;
2188    colorRange4->setValue(GLWindow->ss[4]);
2189//    GLWindow->ss[2] = midRange;
2190//    range2->setValue(GLWindow->ss[2]);
2191//    GLWindow->ss[1] = (minRange+midRange)/2;
2192//    range1->setValue(GLWindow->ss[1]);
2193//    GLWindow->ss[3] = (maxRange+midRange)/2;
2194//    range3->setValue(GLWindow->ss[3]);
2195
2196    GLWindow->ss[2] = (maxRange+minRange)/2;
2197    colorRange2->setValue(GLWindow->ss[2]);
2198
2199    GLWindow->ss[1] = minRange+(maxRange-minRange)/4;
2200    colorRange1->setValue(GLWindow->ss[1]);
2201
2202    GLWindow->ss[3] = minRange+3*(maxRange-minRange)/4;
2203    colorRange3->setValue(GLWindow->ss[3]);
2204}
2205
2206void PrintUsage()
2207{
2208    cout << "\n"
2209        "The FACT++ raw data viewer.\n"
2210        "\n"
2211        "Usage: viewer [OPTIONS] [datafile.fits[.gz|.fz] [calibration.drs.fits[.gz]]]\n"
2212        "  or:  viewer [OPTIONS]\n";
2213    cout << endl;
2214
2215}
2216
2217void PrintHelp()
2218{
2219    cout <<
2220            "\n"
2221         << endl;
2222}
2223
2224int UIConnector::SetupConfiguration(Configuration &conf)
2225{
2226    RawDataViewer *canvas = GLWindow;
2227
2228    if (conf.Has("mappingFile"))
2229    {
2230        canvas->assignPixelMapFile(conf.GetPrefixedString("mappingFile"));
2231    }
2232    else
2233        canvas->assignPixelMapFile("");
2234
2235    if (!canvas->isFACT())
2236    {
2237        HwIDBox->setMaximum(71);
2238        SwIDBox->setMaximum(71);
2239        SwIDBox->setValue(0);
2240        HwIDBox->setValue(19);
2241        crateIDBox->setMaximum(0);
2242        crateIDBox->setEnabled(false);
2243        boardIDBox->setMaximum(1);
2244    }
2245
2246    if (conf.Has("color.range"))
2247    {
2248        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.range");
2249        if (value.size() != 5)
2250        {
2251            cout << "Error, colorRange option should have exactly 5 double values" << endl;
2252            return -1;
2253        }
2254        for (int i=0;i<5;i++)
2255            canvas->ss[i] = value[i];
2256    }
2257
2258    if (conf.Has("color.red"))
2259    {
2260        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.red");
2261        if (value.size() != 5)
2262        {
2263            cout << "Error, colorRed option should have exactly 5 double values" << endl;
2264            return -1;
2265        }
2266        for (int i=0;i<5;i++)
2267            canvas->rr[i] = value[i];
2268    }
2269
2270    if (conf.Has("color.green"))
2271    {
2272        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.green");
2273        if (value.size() != 5)
2274        {
2275            cout << "Error, colorGreen option should have exactly 5 double values" << endl;
2276            return -1;
2277        }
2278        for (int i=0;i<5;i++)
2279            canvas->gg[i] = value[i];
2280    }
2281
2282    if (conf.Has("color.blue"))
2283    {
2284        vector<double> value = conf.Vec<double>("color.blue");
2285        if (value.size() != 5)
2286        {
2287            cout << "Error, colorBlue option should have exactly 5 double values" << endl;
2288            return -1;
2289        }
2290        for (int i=0;i<5;i++)
2291            canvas->bb[i] = value[i];
2292    }
2293
2294    colorRange0->setValue(canvas->ss[0]);
2295    colorRange1->setValue(canvas->ss[1]);
2296    colorRange2->setValue(canvas->ss[2]);
2297    colorRange3->setValue(canvas->ss[3]);
2298    colorRange4->setValue(canvas->ss[4]);
2299    redValue0->setValue(canvas->rr[0]);
2300    redValue1->setValue(canvas->rr[1]);
2301    redValue2->setValue(canvas->rr[2]);
2302    redValue3->setValue(canvas->rr[3]);
2303    redValue4->setValue(canvas->rr[4]);
2304    greenValue0->setValue(canvas->gg[0]);
2305    greenValue1->setValue(canvas->gg[1]);
2306    greenValue2->setValue(canvas->gg[2]);
2307    greenValue3->setValue(canvas->gg[3]);
2308    greenValue4->setValue(canvas->gg[4]);
2309    blueValue0->setValue(canvas->bb[0]);
2310    blueValue1->setValue(canvas->bb[1]);
2311    blueValue2->setValue(canvas->bb[2]);
2312    blueValue3->setValue(canvas->bb[3]);
2313    blueValue4->setValue(canvas->bb[4]);
2314
2315    if (conf.Has("drs"))
2316    {
2317        const QString qstr(conf.Get<string>("drs").c_str());
2318        calibFileSelected(qstr);
2319    }
2320
2321    if (conf.Has("file"))
2322    {
2323        const QString qstr(conf.Get<string>("file").c_str());
2324        fileSelected(qstr);
2325    }
2326
2327
2328    return 0;
2329}
2330
2331void SetupConfiguration(Configuration& conf)
2332{
2333    po::options_description configs("Raw Events Viewer Options");
2334    configs.add_options()
2335        ("color.range", vars<double>(), "Range of the display colours")
2336        ("color.red",   vars<double>(), "Range of red values")
2337        ("color.green", vars<double>(), "Range of green values")
2338        ("color.blue",  vars<double>(), "Range of blue values")
2339        ("file,f",      var<string>(),  "File to be loaded")
2340        ("drs,d",       var<string>(),  "DRS calibration file to be loaded")
2341        ("mappingFile", var<string>(),  "Which pixels mapping file to use")
2342        ;
2343    conf.AddOptions(configs);
2344
2345    po::positional_options_description p;
2346    p.add("file", 1); // The first positional options
2347    p.add("drs",  2); // The first positional options
2348    conf.SetArgumentPositions(p);
2349
2350}
2351
2352/************************************************************
2353 * MAIN PROGRAM FUNCTION.
2354 ************************************************************/
2355int main(int argc, const char *argv[])
2356{
2357    QApplication app(argc, const_cast<char**>(argv));
2358
2359    if (!QGLFormat::hasOpenGL()) {
2360        std::cerr << "This system has no OpenGL support" << std::endl;
2361        return 1;
2362    }
2363
2364    Configuration conf(argv[0]);
2365    conf.SetPrintUsage(PrintUsage);
2366    SetupConfiguration(conf);
2367    if (!conf.DoParse(argc, argv, PrintHelp))
2368        return 2;
2369
2370    UIConnector myUi;
2371    if (myUi.SetupConfiguration(conf)<0)
2372        return 3;
2373
2374    return app.exec();
2375}
2376
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.