Changeset 16417


Ignore:
Timestamp:
05/28/13 23:30:11 (11 years ago)
Author:
tbretz
Message:
removed the obsolete mightFail from the constructor; some little cosmetics; more checks for the validity of the file; improved performance of GetRow, mainly by not looking up something which should never change all the time.
File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/Mars/mcore/factfits.h

    r16285 r16417  
    66 */
    77
    8 #ifndef FACTFITS_H_
    9 #define FACTFITS_H_
     8#ifndef MARS_FACTFITS
     9#define MARS_FACTFITS
    1010
    1111#include "zfits.h"
    12 
    1312
    1413#ifndef __MARS__
    1514namespace std
    1615{
    17 #else
    18 using namespace std;
    1916#endif
    2017
    21 class factFits : public zfits
     18class factfits : public zfits
    2219{
    2320public:
    24     /*
    25      *  Default constructor
    26      */
    27     factFits(const string& fname,
    28              const string& tableName="",
    29              bool          force=false,
    30              bool          mightFail=false) : zfits(fname, tableName, force, mightFail),
    31                                               fOffsetCalibration(0),
    32                                               fStartCellOffset(0)
     21    // Default constructor
     22    factfits(const string& fname, const string& tableName="", bool force=false) :
     23        zfits(fname, tableName, force)
    3324    {
    34         readDrsCalib(fname);
    35         GetStartCellOffset();
     25        if (init())
     26            readDrsCalib(fname);
    3627    }
    37     /*
    38      *  Alternative constructor
    39      */
    40     factFits(const string& fname,
    41              const string& fout,
    42              const string& tableName="",
    43              bool          force=false,
    44              bool          mightFail=false): zfits(fname, fout, tableName, force, mightFail),
    45                                              fOffsetCalibration(0),
    46                                              fStartCellOffset(0)
     28
     29    // Alternative constructor
     30    factfits(const string& fname, const string& fout, const string& tableName, bool force=false) :
     31        zfits(fname, fout, tableName, force)
    4732    {
    48         readDrsCalib(fname);
    49         GetStartCellOffset();
     33        if (init())
     34            readDrsCalib(fname);
    5035    }
    51     /*
    52      *  Default destrctor
    53      */
    54     ~factFits()
    55     {}
    56     /*
    57      *  Overload of zfits.h
    58      */
     36
     37    //
    5938#if !defined(__MARS__) && !defined(__CINT__)
    60     virtual bool GetRow(size_t row, bool check=true)
     39    bool GetRow(size_t row, bool check=true)
    6140#else
    62     virtual bool GetRowNum(size_t row, bool check=true)
     41    bool GetRowNum(size_t row, bool check=true)
    6342#endif
    6443    {
    6544#if !defined(__MARS__) && !defined(__CINT__)
    66         const bool isGood = zfits::GetRow(row, check);
     45        if (!zfits::GetRow(row, check))
     46            return false;
    6747#else
    68         const bool isGood = zfits::GetRowNum(row, check);
     48        if (!zfits::GetRowNum(row, check))
     49            return false;
    6950#endif
    70         //row is loaded in internal memory. Should we un-apply the integer drs ?
    71         if (!isGood)                        return false;
    72         if (!fTable.isCompressed)           return true;
    73         if (fOffsetCalibration.size() == 0) return true;
    74 
    75         //now Drs un-Calibrate, if required
    76         const Pointers::iterator dtaIt = fPointers.find("Data");
    77         if (dtaIt == fPointers.end()) return true;
     51        // This file does not contain fact data or no calibration to be applied
     52        if (fOffsetCalibration.empty())
     53            return true;
    7854
    7955        //re-get the pointer to the data to access the offsets
    8056        const uint8_t offset = (row*fTable.bytes_per_row)%4;
    81         const char* ptr = fBufferRow.data() + offset;
    8257
    83         //get column details for Data
    84         const Table::Columns::const_iterator dataColIt = fTable.cols.find("Data");
    85         if (dataColIt == fTable.cols.end()) return false;
    86         const Table::Column& dataColumn = dataColIt->second;
    87         const uint32_t numSlices = dataColumn.num/1440;
     58        int16_t *startCell = reinterpret_cast<int16_t*>(fBufferRow.data() + offset + fOffsetStartCellData);
     59        int16_t *data      = reinterpret_cast<int16_t*>(fBufferRow.data() + offset + fOffsetData);
    8860
    89         //Drs un-calibrate !
    90         for (uint32_t i=0;i<1440;i++)
     61        for (uint32_t i=0; i<1440*1024; i+=1024, startCell++)
    9162        {
    92             const int32_t thisStartCell = reinterpret_cast<const int16_t*>(ptr+fStartCellOffset)[i];
    93             for (uint32_t j=0;j<numSlices;j++)
    94                 reinterpret_cast<int16_t*>(dtaIt->second)[numSlices*i+j] += fOffsetCalibration[1024*i + (thisStartCell+j)%1024];
     63            for (uint32_t j=0; j<fNumRoi; j++, data++)
     64                *data += fOffsetCalibration[i + (*startCell+j)%1024];
    9565        }
     66
    9667        return true;
    9768    }
     
    9970private:
    10071
    101     /*
    102      *  Read the Drs calibration data
    103      */
     72    bool init()
     73    {
     74        if (!HasKey("NPIX") || !HasKey("NROI"))
     75            return false;
     76
     77        if (Get<uint16_t>("NPIX")!=1440)
     78            return false;
     79
     80        fNumRoi = Get<uint16_t>("NROI");
     81        if (fNumRoi>1024)
     82            return false;
     83
     84        // check column details for Data
     85        const Table::Columns::const_iterator it = fTable.cols.find("Data");
     86        if (it==fTable.cols.end() || it->second.num!=1440*fNumRoi || it->second.type!='I')
     87            return false;
     88
     89        // check column details for StartCellData
     90        const Table::Columns::const_iterator is = fTable.cols.find("StartCellData");
     91        if (is==fTable.cols.end() || is->second.num!=1440 || is->second.type!='I')
     92            return false;
     93
     94        fOffsetStartCellData = is->second.offset;
     95        fOffsetData          = it->second.offset;
     96
     97        return true;
     98    }
     99
     100    //  Read the Drs calibration data
    104101    void readDrsCalib(const string& fileName)
    105102    {
    106         zfits calib(fileName, "DrsCalib", false, true);
     103        zfits calib(fileName, "DrsCalib");
     104        if (calib.bad())
     105        {
     106            clear(rdstate()|ios::badbit);
     107            return;
     108        }
    107109
    108         const bool isDrsCalibTable = (bool)calib;
    109         if (!isDrsCalibTable) return;
     110        if (calib.eof())
     111            return;
     112
    110113        // Check correct size and format of table
    111114        if (calib.GetNumRows() != 1)
    112115        {
     116            clear(rdstate()|ios::badbit);
    113117#ifdef __EXCEPTIONS
    114             throw runtime_error("ERROR: DrsCalib table found, but not with one row as expected");
     118            throw runtime_error("Table 'DrsCalib' found, but not with one row as expected");
    115119#else
    116             gLog << ___err___ << "ERROR: DrsCalib table found, but not with one row as expected" << endl;
     120            gLog << ___err___ << "ERROR - Table 'DrsCalib' found, but not with one row as expected" << endl;
    117121            return;
    118122#endif
     
    120124        if (calib.GetStr("TTYPE1") != "OffsetCalibration")
    121125        {
     126            clear(rdstate()|ios::badbit);
    122127#ifdef __EXCEPTIONS
    123             throw runtime_error("ERROR: DrsCalib table found, but first column is not the one expected");
     128            throw runtime_error("Table 'DrsCalib' found, but first column is not the one expected");
    124129#else
    125             gLog << ___err___ << "ERROR: DrsCalib table found, but first column is not the one expected" << endl;
     130            gLog << ___err___ << "ERROR - Table 'DrsCalib' found, but first column is not the one expected" << endl;
    126131            return;
    127132#endif
    128133        }
    129         if (calib.GetStr("TFORM1") != "1474560I")
     134        if (calib.GetStr("TFORM1") != "1474560I")  // 1024*1440
    130135        {
     136            clear(rdstate()|ios::badbit);
    131137#ifdef __EXCEPTIONS
    132             throw runtime_error("ERROR: DrsCalib table found, but has wrong column format");
     138            throw runtime_error("Table 'DrsCalib' has wrong column format (TFROM1)");
    133139#else
    134             gLog << ___err___ << "ERROR: DrsCalib table found, but has wrong column format" << endl;
     140            gLog << ___err___ << "ERROR - Table 'DrsCalib' has wrong column format (TFORM1)" << endl;
    135141            return;
    136142#endif
     
    138144
    139145        fOffsetCalibration.resize(1024*1440);
    140         calib.SetPtrAddress("OffsetCalibration",fOffsetCalibration.data());
    141146
    142         calib.GetNextRow();
    143     }
     147        calib.SetPtrAddress("OffsetCalibration", fOffsetCalibration.data());
     148        if (calib.GetNextRow())
     149            return;
    144150
    145     /*
    146      *  Get the offset of the StartCell column
    147      */
    148     void GetStartCellOffset()
    149     {
    150         for (Table::Columns::const_iterator jt=fTable.cols.begin(); jt != fTable.cols.end(); jt++)
    151         {
    152             if (jt->first == "StartCellData")
    153             {
    154                 fStartCellOffset = jt->second.offset;
    155                 break;
    156             }
    157         }
     151        clear(rdstate()|ios::badbit);
     152
     153#ifdef __EXCEPTIONS
     154        throw runtime_error("Reading column 'OffsetCalibration' failed.");
     155#else
     156        gLog << ___err___ << "ERROR - Reading column 'OffsetCalibration' failed." << endl;
     157#endif
     158
    158159    }
    159160
    160161    vector<int16_t> fOffsetCalibration; ///< integer values of the drs calibration used for compression
    161     size_t          fStartCellOffset;   ///< offset of the StartCellData column in the uncompressed data
     162
     163    size_t fOffsetData;
     164    size_t fOffsetStartCellData;
     165
     166    uint16_t fNumRoi;
     167
     168#warning Time marker channels currently unhandled
    162169
    163170}; //class factfits
     
    167174#endif
    168175
    169 #endif /* FACTFITS_H_ */
     176#endif
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.