Changeset 3754 for trunk


Ignore:
Timestamp:
04/15/04 16:29:37 (21 years ago)
Author:
gaug
Message:
*** empty log message ***
Location:
trunk/MagicSoft/Mars
Files:
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • trunk/MagicSoft/Mars/Changelog

    r3753 r3754  
    2121
    2222   * macros/calibration.C
    23      - added a function FindColor to extract the colour by filename,
     23     - added a function FindColor() to extract the colour by filename,
    2424       works if there is indeed a colour or if the run nubmer is smaller
    2525       than 20000 -> take ct1
     26
     27   * macros/bootcampstandardanalysis.C
     28     - updated the macro to the cvs-standard used at the Udine bootcamp
     29
    2630
    2731   * mcalib/MCalibrateRelTimes.[h,cc]

  • trunk/MagicSoft/Mars/macros/bootcampstandardanalysis.C

    r3436 r3754  
    1717!
    1818!   Author(s): Javier López, 12/2003 <mailto:jlopez@ifae.es>
    19 !
    20 !   Copyright: MAGIC Software Development, 2000-2003
     19!              Markus Gaug , 04/2004 <mailto:markus@ifae.es>
     20!
     21!   Copyright: MAGIC Software Development, 2000-2004
    2122!
    2223!
    2324\* ======================================================================== */
     25/////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
     26//
     27//  bootcampstandardanalysis.C
     28//
     29//  Updated version of the macro designed at the Wuerzburg bootcamp and
     30//  compatible with the latest changes in Mars for general usage at the
     31//  Udine bootcamp.
     32//
     33//  Needs as arguments the run number of a pedestal file ("*_P_*.root"),
     34//  one of a calibration file ("*_C_*.root") and one of a data file
     35//  ("*_D_*.root"). Performs the pedestal calculation, the calibration
     36/// constants calculation and the calibration of the data.
     37//
     38//  The TString inpath has to be set correctly.
     39//
     40//  The macro searches for the pulser colour which corresponds to the calibration
     41//  run number. If the run number is smaller than 20000, pulser colour "CT1"
     42//  is assumed, otherwise, it searches for the strings "green", "blue", "uv" or
     43//  "ct1" in the filenames. If no colour or multiple colours are found, the
     44//  execution is aborted. 
     45//
     46//////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
     47const TString inpath = "/mnt/Data/rootdata/CrabNebula/2004_02_10/";
     48const Int_t dpedrun  = 14607;
     49const Int_t dcalrun1 = 14608;
     50const Int_t dcalrun2 = 0;
     51const Int_t ddatrun1 = 14609;
     52const Int_t ddatrun2 = 14614;
     53const Bool_t usedisplay = kTRUE;
     54
     55void bootcampstandardanalysis(const Int_t prun=dpedrun, // pedestal file
     56                              const Int_t crun1=dcalrun1, const Int_t crun2=dcalrun2, // calibration file(s)
     57                              const Int_t drun1=ddatrun1, const Int_t drun2=ddatrun2 // data files(s)
     58                              )
     59                             
     60{
     61
     62  MRunIter pruns;
     63  MRunIter cruns;
     64  MRunIter druns;
     65
     66  pruns.AddRun(prun,inpath);
     67
     68  if (crun2==0)
     69    cruns.AddRun(crun1,inpath);
     70  else
     71    cruns.AddRuns(crun1,crun2,inpath);
     72
     73  MCalibrationCam::PulserColor_t color;
     74
     75  if (crun1 < 20000)
     76    color = MCalibrationCam::kCT1;
     77  else
     78    color = FindColor((MDirIter*)&cruns);
     79
     80  if (color == MCalibrationCam::kNONE)
     81    {
     82      TTimer timer("gSystem->ProcessEvents();", 50, kFALSE);
     83     
     84      while (1)
     85        {
     86          timer.TurnOn();
     87          TString input = Getline("Could not find the correct colour: Type 'q' to exit, "
     88                                  "green, blue, uv or ct1 to go on: ");
     89          timer.TurnOff();
     90         
     91          if (input=="q\n")
     92            return ;
     93         
     94          if (input=="green")
     95            color = MCalibrationCam::kGREEN;
     96          if (input=="blue")
     97            color = MCalibrationCam::kBLUE;
     98          if (input=="uv")
     99            color = MCalibrationCam::kUV;
     100          if (input=="ct1")
     101            color = MCalibrationCam::kCT1;
     102        }
     103    }
     104 
     105  if (drun2==0)
     106    druns.AddRun(drun1,inpath);
     107  else
     108    druns.AddRuns(drun1,drun2,inpath);
     109 
     110  //
     111  // Now setup the tasks and tasklist for the pedestals:
     112  // ---------------------------------------------------
     113  //
     114  MBadPixelsCam     badcam;
     115  MGeomCamMagic     geomcam;
     116  MGeomApply        geomapl;
     117  //
     118  // If you want to exclude pixels from the beginning, read
     119  // an ascii-file with the corr. pixel numbers (see MBadPixelsCam)
     120  //
     121  //  badcam.AsciiRead("badpixels.dat");
     122 
     123  /************************************/
     124  /* FIRST LOOP: PEDESTAL COMPUTATION */
     125  /************************************/
     126
     127  MJPedestal pedloop;
     128  pedloop.SetInput(&pruns);
     129  if (usedisplay)
     130    {
     131      MStatusDisplay *display = new MStatusDisplay;
     132      display->SetUpdateTime(3000);
     133      display->Resize(850,700);
     134      pedloop.SetDisplay(display);
     135    }
     136  pedloop.SetBadPixels(badcam);
     137
     138  if (!pedloop.Process())
     139    return;
     140
     141  /****************************************/
     142  /* SECOND LOOP: CALIBRATION COMPUTATION */
     143  /****************************************/
     144
     145  //
     146  // Now setup the new tasks for the calibration:
     147  // ---------------------------------------------------
     148  //
     149  MCalibrationQECam qecam;
     150  MJCalibration     calloop;
     151  calloop.SetColor(color);
     152  calloop.SetInput(&cruns);
     153  //
     154  // Use as signal extractor MExtractSignal:
     155  //
     156  calloop.SetExtractorLevel(1);
     157  //
     158  // Set the corr. cams:
     159  //
     160  calloop.SetQECam(qecam);
     161  calloop.SetBadPixels(pedloop.GetBadPixels());
     162  //
     163  // The next two commands are for the display:
     164  //
     165  if (usedisplay)
     166    {
     167      calloop.SetDisplay(display);
     168      calloop.SetDataCheck();
     169    }
     170 
     171  //
     172  // Apply rel. time calibration:
     173  //
     174  calloop.SetRelTimeCalibration();
     175  //
     176  // Use as arrival time extractor MArrivalTimeCalc2:
     177  //
     178  calloop.SetArrivalTimeLevel(2);
     179 
     180  //
     181  // Do the event-loop:
     182  //
     183  if (!calloop.Process(pedloop.GetPedestalCam()))
     184    return;
     185 
     186
     187  /*************************************/
     188  /* THIRD LOOP: PEDESTAL CALIBRATION  */
     189  /*************************************/
     190
     191  //
     192  // Create a empty Parameter List and an empty Task List
     193  //
     194  MParList  plist3;
     195  MTaskList tlist3;
     196  plist3.AddToList(&tlist3);
     197 
     198  //
     199  // Now setup the tasks and tasklist to calculate the pedestal rms in number of photons
     200  // -----------------------------------------------------------------------------------
     201  //
     202 
     203  MCerPhotEvt    nphot;
     204  MPedPhotCam    nphotrms;
     205 
     206  plist3.AddToList(&geomcam);
     207
     208  //
     209  // Retrieve the cameras from the previous runs:
     210  //
     211  plist3.AddToList(&pedloop.GetPedestalCam());
     212  plist3.AddToList(&calloop.GetCalibrationCam());
     213  plist3.AddToList(&calloop.GetQECam());
     214  plist3.AddToList(&calloop.GetRelTimeCam());
     215  plist3.AddToList(&calloop.GetBadPixels());
     216  plist3.AddToList(&nphot);
     217  plist3.AddToList(&nphotrms);
     218 
     219  //tasks
     220  MReadMarsFile read3("Events");
     221  read3.DisableAutoScheme();
     222  static_cast<MRead&>(read3).AddFiles(pruns); 
     223
     224  MExtractSignal   extsig;
     225  MCalibrate       photcalc;
     226  photcalc.SetCalibrationMode(MCalibrate::kFfactor);
     227  //    MPedPhotCalc  photrmscalc;  //It doesn't exist yet
     228 
     229  tlist3.AddToList(&read3);
     230  tlist3.AddToList(&geomapl);
     231  tlist3.AddToList(&extsig);
     232  tlist3.AddToList(&photcalc);
     233  //    tlist3.AddToList(&photrmscalc);
     234 
     235  //
     236  // Create and setup the eventloop
     237  //
     238  MEvtLoop evtloop3;
     239  evtloop3.SetParList(&plist3);
     240 
     241  //
     242  // Execute first analysis
     243  //
     244  if (!evtloop3.Eventloop())
     245    return;
     246 
     247  tlist3.PrintStatistics();
     248 
     249  /*************************************/
     250  /* FOURTH LOOP: DATA CALIBRATION     */
     251  /*************************************/
     252
     253  //
     254  // Create a empty Parameter List and an empty Task List
     255  //
     256  MParList  plist4;
     257  MTaskList tlist4;
     258  plist4.AddToList(&tlist4);
     259 
     260  //
     261  // Now setup the tasks and tasklist to analize the data
     262  // -----------------------------------------------------
     263  //
     264 
     265  plist4.AddToList(&geomcam);
     266  //
     267  // Retrieve the cameras from the previous runs:
     268  //
     269  plist4.AddToList(&pedloop.GetPedestalCam());
     270  plist4.AddToList(&calloop.GetCalibrationCam());
     271  plist4.AddToList(&calloop.GetQECam());
     272  plist4.AddToList(&calloop.GetRelTimeCam());
     273  plist4.AddToList(&calloop.GetBadPixels());
     274  plist4.AddToList(&nphot);
     275  plist4.AddToList(&nphotrms);
     276
     277  MArrivalTime times;
     278  plist4.AddToList(&times);
     279 
     280  //tasks
     281  MReadMarsFile read4("Events");
     282  read4.DisableAutoScheme();
     283  static_cast<MRead&>(read4).AddFiles(druns); 
     284 
     285  MArrivalTimeCalc2   timecalc;
     286  MCalibrateRelTimes  timecal;
     287
     288  tlist4.AddToList(&read4);
     289  tlist4.AddToList(&geomapl);
     290  tlist4.AddToList(&extsig);
     291  tlist4.AddToList(&timecalc);
     292  tlist4.AddToList(&photcalc);
     293  tlist4.AddToList(&timecal);
     294 
     295  //
     296  // Create and setup the eventloop
     297  //
     298  MEvtLoop evtloop4;
     299  evtloop4.SetParList(&plist4);
     300
     301  if (!evtloop4.PreProcess())
     302
     303    return;
     304 
     305  TCanvas *c1 = new TCanvas;
     306  MHCamera disp1(geomcam);
     307  disp1.SetPrettyPalette();
     308  //disp1.SetInvDeepBlueSeaPalette()
     309  disp1.Draw();
     310  gPad->SetLogy();
     311  gPad->cd(1);
     312 
     313  /*
     314  TCanvas *c2 = new TCanvas;
     315  MHCamera disp2(geomcam);
     316  disp2.SetPrettyPalette();
     317  //disp2.SetInvDeepBlueSeaPalette()
     318  disp2.Draw();
     319  gPad->SetLogy();
     320  gPad->cd(1);
     321  */
     322  while (tlist4.Process())
     323    {
     324      disp1.SetCamContent(nphot);
     325     
     326      gPad->Modified();
     327      gPad->Update();
     328
     329      /*   
     330      disp2.SetCamContent(times);
     331     
     332      gPad->Modified();
     333      gPad->Update();
     334      */
     335
     336      // Remove the comments if you want to go through the file
     337      // event-by-event:
     338      if (!HandleInput())
     339        break;
     340    }
     341
     342  evtloop4.PostProcess();
     343 
     344}
    24345
    25346Bool_t HandleInput()
    … …  
    46367}
    47368
    48 void bootcampstandardanalysis(
    49 TString pedname="/mnt/magic_data/Data/rootdata/2003_11_29/20031128_03127_P_Crab-Nebula_E.root",
    50 TString calname="/mnt/magic_data/Data/rootdata/2003_11_29/20031128_03128_C_Crab-Nebula_E.root",
    51 TString dataname="/mnt/magic_data/Data/rootdata/2003_11_29/20031128_03200_D_Crab-Nebula_E.root")
     369MCalibrationCam::PulserColor_t FindColor(MDirIter* run)
    52370{
    53 
    54 // Before starting be sure you have the pedestal, calibration and data runs names
    55 //    if (pedname != NULL)
    56 //      cout << endl << "usage: bootcampstandardanalysis.C()" << endl;
    57 
    58     //
    59     // Create a empty Parameter List and an empty Task List
    60     // The tasklist is identified in the eventloop by its name
    61     //
    62     MParList plist;
    63 
    64     MTaskList tlist;
    65     plist.AddToList(&tlist);
    66 
    67     //
    68     // Now setup the tasks and tasklist for the pedestals:
    69     // ---------------------------------------------------
    70     //
    71 
    72     MPedestalCam   pedcam;
    73     plist.AddToList(&pedcam);
    74 
    75 
    76     //tasks
    77     MReadMarsFile read("Events", pedname);
    78     read.DisableAutoScheme();
    79 
    80     MGeomApply     geomapl;
    81     MPedCalcPedRun pedcalc;
    82     MGeomCamMagic  geomcam;
    83 
    84     tlist.AddToList(&read);
    85     tlist.AddToList(&geomapl);
    86     tlist.AddToList(&pedcalc);
    87 
    88     //
    89     // Create and setup the eventloop
    90     //
    91     MEvtLoop evtloop;
    92     evtloop.SetParList(&plist);
    93 
    94     //
    95     // Execute first analysis
    96     //
    97     if (!evtloop.Eventloop())
    98         return;
    99 
    100     tlist.PrintStatistics();
    101 
    102     //
    103     // Create a empty Parameter List and an empty Task List
    104     //
    105     MParList  plist2;
    106 
    107     MTaskList tlist2;
    108     plist2.AddToList(&tlist2);
    109 
    110 
    111     //
    112     // Now setup the new tasks and tasklist for the calibration
    113     // ---------------------------------------------------
    114     //
    115    
    116     MBadPixelsCam           badcam;
    117     MCalibrationChargeCam   calcam;
    118     MExtractedSignalCam     sigcam;
    119     MCalibrationChargePINDiode pindiode;
    120     MCalibrationChargeBlindPix blindpix;
    121    
    122     //
    123     // As long, as we don't have digital modules,
    124     // we have to set the color of the pulser LED by hand
    125     //
    126     //    calcam.SetColor(MCalibrationChargeCam::kECT1);
    127     blindpix.SetColor(MCalibrationChargeBlindpix:kECT1);
    128 
    129     plist2.AddToList(&geomcam);
    130     plist2.AddToList(&badcam);
    131     plist2.AddToList(&pedcam);
    132     plist2.AddToList(&calcam);
    133     plist2.AddToList(&sigcam);
    134     plist2.AddToList(&pindiode);
    135     plist2.AddToList(&blindpix);
    136 
    137    // hists
    138     MFillH fillpin(  "MHCalibrationChargePINDiode", "MExtractedSignalPINDiode");
    139     MFillH fillblind("MHCalibrationChargeBlindPix", "MExtractedSignalBlindPix");
    140     MFillH fillcam(  "MHCalibrationChargeCam"     , "MExtractedSignalCam");
    141 
    142     //tasks
    143     MReadMarsFile read2("Events", calname);
    144     read2.DisableAutoScheme();
    145 
    146     MExtractPINDiode       pincalc;
    147     MExtractBlindPixel     blindcalc;
    148     MExtractSignal         sigsig;
    149     MCalibrationChargeCalc calcalc;
    150 
    151     //
    152     // Apply a filter against cosmics
    153     // (was directly in MCalibrationCalc in earlier versions)
    154     //
    155     MFCosmics            cosmics;
    156     MContinue            cont(&cosmics);
    157 
    158     tlist2.AddToList(&read2);
    159     tlist2.AddToList(&geomapl);
    160     tlist2.AddToList(&blindcalc);
    161     tlist2.AddToList(&pincalc);
    162     tlist2.AddToList(&sigsig);
    163     //
    164     // In case, you want to skip the cosmics rejection,
    165     // uncomment the next line
    166     //
    167     tlist2.AddToList(&cont);
    168     //
    169     //    tlist2.AddToList(&fillpin);
    170     tlist2.AddToList(&fillblind);
    171     tlist2.AddToList(&fillcam);
    172     tlist2.AddToList(&calcalc);
    173     //
    174     // Create and setup the eventloop
    175     //
    176     MEvtLoop evtloop2;
    177     evtloop2.SetParList(&plist2);
    178 
    179     //
    180     // Execute second analysis
    181     //
    182     if (!evtloop2.Eventloop())
    183         return;
    184 
    185     tlist2.PrintStatistics();
    186  
    187 
    188     //
    189     // Create a empty Parameter List and an empty Task List
    190     //
    191     MParList  plist3;
    192 
    193     MTaskList tlist3;
    194     plist3.AddToList(&tlist3);
    195 
    196     //
    197     // Now setup the tasks and tasklist to calculate the pedestal rms in number of photons
    198     // -----------------------------------------------------------------------------------
    199     //
    200 
    201     MCerPhotEvt    nphot;
    202     MPedPhotCam    nphotrms;
    203 
    204     plist3.AddToList(&geomcam);
    205     plist3.AddToList(&pedcam);
    206     plist3.AddToList(&calcam);
    207     plist3.AddToList(&nphot);
    208     plist3.AddToList(&nphotrms);
    209 
    210     //tasks
    211     MReadMarsFile read3("Events", pedname);
    212     read3.DisableAutoScheme();
    213 
    214     MExtractSignal     extsig;
    215     MCalibrate       photcalc;
    216 //    MPedPhotCalc  photrmscalc;  //It doesn't exist yet
    217 
    218     tlist3.AddToList(&read3);
    219     tlist3.AddToList(&geomapl);
    220     tlist3.AddToList(&extsig);
    221     tlist3.AddToList(&photcalc);
    222 //    tlist3.AddToList(&photrmscalc);
    223 
    224     //
    225     // Create and setup the eventloop
    226     //
    227     MEvtLoop evtloop3;
    228     evtloop3.SetParList(&plist3);
    229 
    230 
    231     //
    232     // Execute first analysis
    233     //
    234     if (!evtloop3.Eventloop())
    235         return;
    236 
    237     tlist3.PrintStatistics();
    238 
    239     //
    240     // Create a empty Parameter List and an empty Task List
    241     //
    242     MParList  plist4;
    243 
    244     MTaskList tlist4;
    245     plist4.AddToList(&tlist4);
    246 
    247     //
    248     // Now setup the tasks and tasklist to analize the data
    249     // -----------------------------------------------------
    250     //
    251 
    252     plist4.AddToList(&geomcam);
    253     plist4.AddToList(&pedcam);
    254     plist4.AddToList(&calcam);
    255     plist4.AddToList(&nphot);
    256     plist4.AddToList(&nphotrms);
    257 
    258     //tasks
    259     MReadMarsFile read4("Events", dataname);
    260     read4.DisableAutoScheme();
    261 
    262 
    263     MExtractSignal     extsig;
    264     MCalibrate       photcalc;
    265 
    266     tlist4.AddToList(&read4);
    267     tlist4.AddToList(&geomapl);
    268     tlist4.AddToList(&extsig);
    269     tlist4.AddToList(&photcalc);
    270 
    271     //
    272     // Create and setup the eventloop
    273     //
    274     MEvtLoop evtloop4;
    275     evtloop4.SetParList(&plist4);
    276 
    277     if (!evtloop4.PreProcess())
    278         return;
    279 
    280     TCanvas *c = new TCanvas;
    281     MHCamera display(geomcam);
    282     display.SetPrettyPalette();
    283     //display.SetInvDeepBlueSeaPalette()
    284     display.Draw();
    285     gPad->SetLogy();
    286     gPad->cd(1);
    287 
    288     while (tlist4.Process())
    289     {
    290       display.SetCamContent(nphot);
    291 
    292       gPad->Modified();
    293       gPad->Update();
    294 
    295       // Remove the comments if you want to go through the file
    296       // event-by-event:
    297       if (!HandleInput())
    298         break;
     371 
     372  MCalibrationCam::PulserColor_t col = MCalibrationCam::kNONE;
     373
     374  TString filenames;
     375
     376  while (!(filenames=run->Next()).IsNull())
     377    {
     378
     379      filenames.ToLower();
     380
     381      if (filenames.Contains("green"))
     382        if (col == MCalibrationCam::kNONE)
     383          {
     384            cout << "Found colour: Green  in " << filenames << endl;
     385            col = MCalibrationCam::kGREEN;
     386          }
     387        else if (col != MCalibrationCam::kGREEN)
     388          {
     389            cout << "Different colour found in " << filenames << "... abort" << endl;
     390            return MCalibrationCam::kNONE;
     391          }
     392
     393      if (filenames.Contains("blue"))
     394        if (col == MCalibrationCam::kNONE)
     395          {
     396            cout << "Found colour: Blue  in " << filenames << endl;
     397            col = MCalibrationCam::kBLUE;
     398          }
     399        else if (col != MCalibrationCam::kBLUE)
     400          {
     401            cout << "Different colour found in " << filenames << "... abort" << endl;
     402            return MCalibrationCam::kNONE;
     403          }
     404
     405      if (filenames.Contains("uv"))
     406        if (col == MCalibrationCam::kNONE)
     407          {
     408            cout << "Found colour: Uv  in " << filenames << endl;
     409            col = MCalibrationCam::kUV;
     410          }
     411        else if (col != MCalibrationCam::kUV)
     412          {
     413            cout << "Different colour found in " << filenames << "... abort" << endl;
     414            return MCalibrationCam::kNONE;
     415          }
     416
     417      if (filenames.Contains("ct1"))
     418        if (col == MCalibrationCam::kNONE)
     419          {
     420            cout << "Found colour: Ct1  in " << filenames << endl;
     421            col = MCalibrationCam::kCT1;
     422          }
     423        else if (col != MCalibrationCam::kCT1)
     424          {
     425            cout << "Different colour found in " << filenames << "... abort" << endl;
     426            return MCalibrationCam::kNONE;
     427          }
     428     
    299429    }
    300 
    301 
    302    
    303     evtloop4.PostProcess();
    304 
     430 
     431
     432     
     433  if (col == MCalibrationCam::kNONE)
     434    cout <<  "No colour found in filenames of runs: " << ((MRunIter*)run)->GetRunsAsString()
     435         << "... abort" << endl;
     436 
     437  return col;     
    305438}
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.